26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_1735 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009253  Dred_1735  HEAT repeat-containing PBS lyase  100 
 
 		 487 aa  1003    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00210534  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1826  hypothetical protein  30.34 
 
 		 1094 aa  57.8  0.0000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0933  hypothetical protein  27.74 
 
 		 958 aa  52.8  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.471083  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0811  HEAT repeat-containing PBS lyase  32.99 
 
 		 192 aa  50.4  0.00008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3508  signal transduction protein  28.25 
 
 		 1148 aa  50.1  0.00009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.139224 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2515  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  34.12 
 
 		 101 aa  49.3  0.0002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.808601  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2129  HEAT repeat-containing PBS lyase  39.51 
 
 		 399 aa  48.9  0.0002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.846494  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3019  phycocyanin alpha-subunit  23.64 
 
 		 546 aa  48.5  0.0003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.993507  hitchhiker  0.00737492 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1736  HEAT repeat-containing PBS lyase  32.93 
 
 		 1438 aa  48.1  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.198352  normal  0.401891 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1841  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  24.34 
 
 		 1343 aa  48.1  0.0004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.520685  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1616  HEAT repeat-containing PBS lyase  32.95 
 
 		 375 aa  47.8  0.0005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000382095  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2231  HEAT repeat-containing PBS lyase  31.82 
 
 		 335 aa  46.2  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000135622  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4624  transcriptional regulator, MerR family  32.98 
 
 		 333 aa  45.4  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3139  PBS lyase HEAT-like repeat domain protein  31.82 
 
 		 375 aa  46.2  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000640173  normal  0.0140567 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2177  PBS lyase HEAT-like repeat domain protein  32.1 
 
 		 375 aa  45.8  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000513448  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2314  PBS lyase HEAT-like repeat domain protein  32.1 
 
 		 375 aa  45.8  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000816736  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3394  HEAT repeat-containing PBS lyase  36.49 
 
 		 524 aa  45.4  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.232744  normal  0.348803 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3392  HEAT repeat-containing PBS lyase  29.82 
 
 		 510 aa  45.8  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.323304 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2265  HEAT domain containing protein  38.1 
 
 		 402 aa  45.1  0.003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0591737 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1824  hypothetical protein  35.44 
 
 		 1224 aa  45.1  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.21873  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0823  HEAT repeat-containing PBS lyase  33.33 
 
 		 180 aa  44.7  0.004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.922694  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0049  HEAT domain containing protein  35.9 
 
 		 959 aa  44.7  0.004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3218  MerR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 336 aa  43.5  0.008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1201  HEAT repeat-containing protein  23.81 
 
 		 644 aa  43.5  0.008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.88812  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0746  HEAT repeat-containing PBS lyase  27.44 
 
 		 313 aa  43.5  0.009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.793568  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0133  HEAT repeat-containing PBS lyase  32.05 
 
 		 197 aa  43.5  0.01  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000842725  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>