46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DET0524 on replicon NC_002936
Organism: Dehalococcoides ethenogenes 195



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002936  DET0524  HEAT repeat-containing PBS lyase  100 
 
 		 316 aa  641    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.25489  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_465  PBS lyase heat-like repeat domain protein  87.03 
 
 		 316 aa  573  1.0000000000000001e-162  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.089505  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0500  heat domain-containing protein  84.49 
 
 		 316 aa  562  1.0000000000000001e-159  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.332473  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3973  HEAT repeat-containing PBS lyase  37.05 
 
 		 309 aa  170  2e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.629775  normal  0.213011 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1417  HEAT repeat-containing PBS lyase  35.52 
 
 		 309 aa  166  5e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.970236  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3051  HEAT domain containing protein  36 
 
 		 304 aa  158  1e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.593239  hitchhiker  0.000276879 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0952  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  34.11 
 
 		 286 aa  145  9e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0081  HEAT repeat-containing PBS lyase  30.94 
 
 		 334 aa  135  8e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3019  phycocyanin alpha-subunit  27.69 
 
 		 546 aa  73.9  0.000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.993507  hitchhiker  0.00737492 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2129  HEAT repeat-containing PBS lyase  28.84 
 
 		 399 aa  57.4  0.0000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.846494  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0933  hypothetical protein  27.32 
 
 		 958 aa  57  0.0000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.471083  normal  1 
 
 
-
 
NC_011723  PCC8801_4511  HEAT domain containing protein  22.75 
 
 		 286 aa  55.1  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  normal  0.715352  normal  0.801323 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1817  phycocyanin alpha phycocyanobilin lyase  23.88 
 
 		 493 aa  54.3  0.000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0551014  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2563  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  26.17 
 
 		 220 aa  54.3  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1841  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  31.71 
 
 		 1343 aa  54.3  0.000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.520685  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0753  HEAT domain containing protein  30.65 
 
 		 838 aa  52.8  0.000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0959  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  31.19 
 
 		 220 aa  52  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0932  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  31.19 
 
 		 220 aa  52  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2887  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  23.4 
 
 		 1181 aa  50.8  0.00003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.371101  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0604  phycocyanin alpha phycocyanobilin lyase related protein  23.79 
 
 		 501 aa  50.8  0.00003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0987  HEAT repeat-containing PBS lyase  25 
 
 		 285 aa  50.8  0.00003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.322977  normal  0.0540864 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5719  HEAT domain containing protein  23.72 
 
 		 299 aa  50.4  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1201  HEAT repeat-containing protein  25.83 
 
 		 644 aa  50.4  0.00004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.88812  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3508  signal transduction protein  25.21 
 
 		 1148 aa  49.7  0.00007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.139224 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1826  hypothetical protein  22.73 
 
 		 1094 aa  49.3  0.00009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1572  HEAT repeat-containing PBS lyase  41.27 
 
 		 642 aa  49.3  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.143951  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2859  HEAT domain containing protein  21.68 
 
 		 428 aa  48.5  0.0001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.335978  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3394  HEAT repeat-containing PBS lyase  23.1 
 
 		 524 aa  48.1  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.232744  normal  0.348803 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1432  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  26.19 
 
 		 220 aa  47.4  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0779  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  35.48 
 
 		 641 aa  47.4  0.0003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0209009 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4287  HEAT repeat-domain-containing protein-like protein  26.69 
 
 		 1194 aa  47.4  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.248989  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1251  HEAT repeat-containing PBS lyase  31.09 
 
 		 162 aa  47  0.0005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1133  putative signal transduction protein with Nacht domain protein  28.18 
 
 		 951 aa  46.6  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2175  HEAT repeat-containing PBS lyase  25.25 
 
 		 490 aa  44.7  0.002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.779763  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2123  HEAT repeat-containing PBS lyase  23.04 
 
 		 635 aa  44.7  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.209503  normal  0.0989309 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3140  HEAT repeat-containing PBS lyase  26.85 
 
 		 670 aa  44.7  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1862  HEAT repeat-containing PBS lyase  24.18 
 
 		 157 aa  43.5  0.004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.715493 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2732  HEAT domain containing protein  26.91 
 
 		 1133 aa  43.9  0.004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4620  heme-binding protein  25.95 
 
 		 1143 aa  43.5  0.004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3158  phycobiliprotein, putative  26.56 
 
 		 320 aa  43.5  0.005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1151  HEAT repeat-containing PBS lyase  35.48 
 
 		 642 aa  43.5  0.005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.181025 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3392  HEAT repeat-containing PBS lyase  24.19 
 
 		 510 aa  43.1  0.006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.323304 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2239  HEAT repeat-containing PBS lyase  27.12 
 
 		 220 aa  43.1  0.006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.5711 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0754  hypothetical protein  26.79 
 
 		 199 aa  42.7  0.007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000250438  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1221  hypothetical protein  30.21 
 
 		 291 aa  42.4  0.009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0115  HEAT repeat-containing PBS lyase  21.97 
 
 		 395 aa  42.4  0.01  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>