73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlab_1313 on replicon NC_008942
Organism: Methanocorpusculum labreanum Z



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008942  Mlab_1313  hypothetical protein  100 
 
 		 361 aa  716    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3508  signal transduction protein  30.51 
 
 		 1148 aa  102  1e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.139224 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1826  hypothetical protein  28.17 
 
 		 1094 aa  99.8  6e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1841  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  28.61 
 
 		 1343 aa  91.7  2e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.520685  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0049  HEAT domain containing protein  33.08 
 
 		 959 aa  78.6  0.0000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4073  HEAT repeat-containing PBS lyase  29.21 
 
 		 325 aa  76.6  0.0000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.429453  normal  0.578065 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3392  HEAT repeat-containing PBS lyase  27.93 
 
 		 510 aa  72.4  0.00000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.323304 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1824  hypothetical protein  29.82 
 
 		 1224 aa  70.5  0.00000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.21873  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0115  HEAT repeat-containing PBS lyase  23.41 
 
 		 395 aa  67.4  0.0000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0746  HEAT repeat-containing PBS lyase  27.59 
 
 		 313 aa  67  0.0000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.793568  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0826  heat domain-containing protein  27.99 
 
 		 1328 aa  65.9  0.000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.851003  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0676  HEAT repeat-containing PBS lyase  30.69 
 
 		 320 aa  64.3  0.000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.401005 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2803  HEAT repeat-containing PBS lyase  29.3 
 
 		 320 aa  63.5  0.000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.873153 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2175  HEAT repeat-containing PBS lyase  22.67 
 
 		 490 aa  63.2  0.000000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.779763  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2016  SH3 type 3 domain-containing protein  27.33 
 
 		 773 aa  62.8  0.000000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000554023  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3349  heat domain-containing protein  27.57 
 
 		 319 aa  61.2  0.00000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.364347  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1736  HEAT repeat-containing PBS lyase  30.68 
 
 		 1438 aa  60.5  0.00000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.198352  normal  0.401891 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0933  hypothetical protein  25.46 
 
 		 958 aa  60.5  0.00000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.471083  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0753  HEAT domain containing protein  29.03 
 
 		 838 aa  57.8  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0604  phycocyanin alpha phycocyanobilin lyase related protein  28.96 
 
 		 501 aa  57  0.0000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4189  HEAT domain containing protein  26.91 
 
 		 319 aa  57  0.0000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2216  HEAT repeat-containing PBS lyase  25.94 
 
 		 667 aa  55.8  0.000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1817  phycocyanin alpha phycocyanobilin lyase  28.81 
 
 		 493 aa  55.8  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0551014  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4198  HEAT domain containing protein  26.06 
 
 		 321 aa  54.3  0.000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011723  PCC8801_4511  HEAT domain containing protein  28.57 
 
 		 286 aa  53.5  0.000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  normal  0.715352  normal  0.801323 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0697  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  34.33 
 
 		 208 aa  53.9  0.000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0575876  normal  0.921461 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1201  HEAT repeat-containing protein  22.96 
 
 		 644 aa  53.5  0.000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.88812  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2149  HEAT repeat-containing PBS lyase  26.54 
 
 		 390 aa  53.5  0.000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34930  putative phycobiliprotein  27.93 
 
 		 321 aa  52.8  0.000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000771282  normal  0.964295 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0512  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  28.17 
 
 		 251 aa  52.4  0.00001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3019  phycocyanin alpha-subunit  52.73 
 
 		 546 aa  52  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.993507  hitchhiker  0.00737492 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6151  HEAT repeat-containing PBS lyase  27.3 
 
 		 321 aa  51.2  0.00003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1862  HEAT repeat-containing PBS lyase  33.33 
 
 		 157 aa  50.8  0.00004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.715493 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2887  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  25.98 
 
 		 1181 aa  50.4  0.00005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.371101  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2129  HEAT repeat-containing PBS lyase  29.48 
 
 		 399 aa  50.1  0.00006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.846494  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0822  HEAT repeat-containing PBS lyase  25.99 
 
 		 200 aa  50.1  0.00006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.166674  normal  0.581812 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1875  HEAT repeat-containing PBS lyase  28.51 
 
 		 302 aa  49.7  0.00008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3140  HEAT repeat-containing PBS lyase  31.14 
 
 		 670 aa  48.9  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0675  HEAT repeat-containing PBS lyase  23.75 
 
 		 323 aa  49.3  0.0001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1030  HEAT repeat-containing PBS lyase  28.66 
 
 		 1139 aa  48.5  0.0002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.762033  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0617  HEAT repeat-containing PBS lyase  30.77 
 
 		 1041 aa  47.8  0.0003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.639116  normal  0.314613 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3674  HEAT domain containing protein  26.56 
 
 		 323 aa  47.8  0.0003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.631029  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1378  HEAT domain containing protein  29.37 
 
 		 643 aa  47.4  0.0004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.905373  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2306  HEAT repeat-containing PBS lyase  22.99 
 
 		 666 aa  47  0.0005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1480  HEAT repeat-containing protein  30.6 
 
 		 325 aa  46.6  0.0006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2826  HEAT repeat-containing PBS lyase  30.89 
 
 		 157 aa  46.6  0.0007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.176107 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1572  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  33.33 
 
 		 377 aa  45.8  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0581284  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3158  phycobiliprotein, putative  25.99 
 
 		 320 aa  45.4  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1572  HEAT repeat-containing PBS lyase  25.61 
 
 		 642 aa  45.4  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.143951  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1415  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  30.48 
 
 		 220 aa  45.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0447  domain of unknown function DUF1730  37.8 
 
 		 414 aa  45.1  0.002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5289  HEAT repeat-containing PBS lyase  30.68 
 
 		 331 aa  45.4  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.460967  normal  0.0714479 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3676  HEAT domain containing protein  28.46 
 
 		 886 aa  45.1  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000145397 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4537  HEAT repeat-containing PBS lyase  26.55 
 
 		 400 aa  44.7  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3137  HEAT repeat-containing PBS lyase  27.91 
 
 		 370 aa  45.4  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000055982  hitchhiker  0.00466606 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0746  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  32.84 
 
 		 646 aa  45.4  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3394  HEAT repeat-containing PBS lyase  26.88 
 
 		 524 aa  45.4  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.232744  normal  0.348803 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1962  HEAT repeat-containing PBS lyase  35.06 
 
 		 331 aa  44.7  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.626659  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1889  HEAT repeat-containing PBS lyase  35.06 
 
 		 331 aa  44.3  0.004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.826607  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1381  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  29.95 
 
 		 220 aa  43.9  0.004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4882  hypothetical protein  26.26 
 
 		 316 aa  44.3  0.004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.453587  normal  0.143497 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1721  HEAT repeat-containing PBS lyase  32.3 
 
 		 234 aa  43.5  0.005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2754  HEAT domain containing protein  36.54 
 
 		 273 aa  43.5  0.005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.202465  normal  0.0148799 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2976  protein of unknown function DUF1080  25.3 
 
 		 1145 aa  43.9  0.005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.657239  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5008  HEAT repeat-containing PBS lyase  29.41 
 
 		 321 aa  43.5  0.006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1562  heat domain-containing protein  30.25 
 
 		 214 aa  43.5  0.006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.882517  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4453  HEAT repeat-containing PBS lyase  26.27 
 
 		 326 aa  43.1  0.007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0155685  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2732  HEAT domain containing protein  26.11 
 
 		 1133 aa  43.1  0.008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2454  protein of unknown function DUF323  36.49 
 
 		 1132 aa  42.7  0.008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0264144 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0823  HEAT repeat-containing PBS lyase  37.86 
 
 		 180 aa  42.7  0.009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.922694  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0811  HEAT repeat-containing PBS lyase  39 
 
 		 192 aa  42.7  0.009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1048  signal transduction protein  26.44 
 
 		 1216 aa  42.7  0.009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.958943  normal  0.02885 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2192  HEAT repeat-containing PBS lyase  33.33 
 
 		 176 aa  42.7  0.009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>