102 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_1823 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_1823  HEAT repeat-containing PBS lyase  100 
 
 
219 aa  428  1e-119  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.565572 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2563  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  48.83 
 
 
220 aa  217  1e-55  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0932  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  54.72 
 
 
220 aa  203  2e-51  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0959  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  54.72 
 
 
220 aa  203  2e-51  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1888  HEAT repeat-containing PBS lyase  51.17 
 
 
220 aa  202  3e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.628238 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0577  PBS lyase HEAT domain-containing protein repeat-containing protein  48.56 
 
 
218 aa  185  4e-46  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.166328  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2239  HEAT repeat-containing PBS lyase  48.83 
 
 
220 aa  183  2.0000000000000003e-45  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.5711 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1432  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  48.33 
 
 
220 aa  178  4.999999999999999e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4762  HEAT repeat-containing PBS lyase  39.62 
 
 
223 aa  125  6e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.122338  normal  0.117024 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1323  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  37.93 
 
 
212 aa  121  8e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.490996  normal  0.334378 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4548  HEAT repeat-containing PBS lyase  36.84 
 
 
226 aa  118  7.999999999999999e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0572  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  36.54 
 
 
223 aa  113  3e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1721  HEAT repeat-containing PBS lyase  37.32 
 
 
234 aa  107  1e-22  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1381  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  36.06 
 
 
220 aa  103  2e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1415  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  36.06 
 
 
220 aa  103  2e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2382  HEAT repeat-containing PBS lyase  32.11 
 
 
234 aa  86.3  4e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.509121  normal  0.832729 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1817  phycocyanin alpha phycocyanobilin lyase  28.24 
 
 
493 aa  76.3  0.0000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0551014  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1391  HEAT domain containing protein  29.36 
 
 
219 aa  75.5  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3615  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  31.02 
 
 
221 aa  72.8  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.23751  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3035  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  30.32 
 
 
222 aa  70.5  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.41949 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1826  hypothetical protein  31.49 
 
 
1094 aa  66.6  0.0000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1841  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  28.57 
 
 
1343 aa  67.4  0.0000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.520685  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2325  HEAT repeat-containing PBS lyase  31.02 
 
 
255 aa  66.2  0.0000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1151  HEAT repeat-containing PBS lyase  27.83 
 
 
642 aa  64.7  0.0000000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.181025 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0811  HEAT repeat-containing PBS lyase  28.75 
 
 
192 aa  63.5  0.000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4189  HEAT domain containing protein  29.79 
 
 
319 aa  63.2  0.000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0779  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  30.51 
 
 
641 aa  63.2  0.000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0209009 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1378  HEAT domain containing protein  28.57 
 
 
643 aa  62.8  0.000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.905373  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1201  HEAT repeat-containing protein  28.49 
 
 
644 aa  62  0.000000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.88812  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2887  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  28.12 
 
 
1181 aa  61.2  0.00000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.371101  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3392  HEAT repeat-containing PBS lyase  33.99 
 
 
510 aa  59.7  0.00000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.323304 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0933  hypothetical protein  27.22 
 
 
958 aa  59.7  0.00000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.471083  normal 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5727  heat domain-containing protein  25.84 
 
 
218 aa  59.3  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3508  signal transduction protein  30.48 
 
 
1148 aa  58.9  0.00000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.139224 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3349  heat domain-containing protein  29.8 
 
 
319 aa  59.3  0.00000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.364347  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1572  HEAT repeat-containing PBS lyase  28.25 
 
 
642 aa  58.9  0.00000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.143951  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1030  HEAT repeat-containing PBS lyase  33.88 
 
 
1139 aa  56.6  0.0000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.762033  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2216  HEAT repeat-containing PBS lyase  32.09 
 
 
667 aa  56.2  0.0000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3140  HEAT repeat-containing PBS lyase  29.34 
 
 
670 aa  55.8  0.0000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0029  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  32.8 
 
 
264 aa  55.8  0.0000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.158294  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0049  HEAT domain containing protein  30.95 
 
 
959 aa  55.5  0.0000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3158  phycobiliprotein, putative  34.34 
 
 
320 aa  53.9  0.000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2306  HEAT repeat-containing PBS lyase  30.15 
 
 
666 aa  53.5  0.000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0761  HEAT domain containing protein  29.51 
 
 
646 aa  53.5  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.181899 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0746  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  29.73 
 
 
646 aa  52.8  0.000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0675  HEAT repeat-containing PBS lyase  30.82 
 
 
323 aa  52  0.000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0115  HEAT repeat-containing PBS lyase  29.67 
 
 
395 aa  51.6  0.000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0437  HEAT repeat-containing PBS lyase  23.81 
 
 
489 aa  51.6  0.000009  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000498384  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1669  HEAT repeat-containing PBS lyase  33.58 
 
 
173 aa  51.6  0.000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0604  phycocyanin alpha phycocyanobilin lyase related protein  29.86 
 
 
501 aa  50.4  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2826  HEAT repeat-containing PBS lyase  29.41 
 
 
157 aa  49.7  0.00003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.176107 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0753  HEAT domain containing protein  34.38 
 
 
838 aa  49.7  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0676  HEAT repeat-containing PBS lyase  26.88 
 
 
320 aa  49.3  0.00005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.401005 
 
 
-
 
NC_011723  PCC8801_4512  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  33.9 
 
 
425 aa  49.3  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  normal  0.0839106  normal  0.594133 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4110  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  36.09 
 
 
515 aa  48.9  0.00006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0298438  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3966  LigA  36.09 
 
 
515 aa  48.9  0.00007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0113076  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2859  HEAT domain containing protein  28.28 
 
 
428 aa  48.9  0.00007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.335978  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1480  HEAT repeat-containing protein  30.29 
 
 
325 aa  48.5  0.00008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34930  putative phycobiliprotein  30.73 
 
 
321 aa  48.5  0.00009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000771282  normal  0.964295 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2929  HEAT repeat-containing PBS lyase  30.53 
 
 
213 aa  47  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2742  HEAT repeat-containing PBS lyase  32.63 
 
 
121 aa  47.4  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2744  HEAT repeat-containing PBS lyase  27.93 
 
 
121 aa  47  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3674  HEAT domain containing protein  28.71 
 
 
323 aa  47  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.631029  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2420  HEAT domain containing protein  30.72 
 
 
363 aa  47  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0823  HEAT repeat-containing PBS lyase  32.41 
 
 
180 aa  46.2  0.0003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.922694  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2690  HEAT repeat-containing PBS lyase  26.7 
 
 
232 aa  46.2  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0127412  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4077  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  35.34 
 
 
515 aa  47  0.0003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.910859  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0251  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  27.48 
 
 
408 aa  46.6  0.0003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.169018  normal  0.0104715 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2156  HEAT domain containing protein  30.65 
 
 
922 aa  47  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.710014 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0166  hypothetical protein  25 
 
 
203 aa  46.2  0.0004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0746  HEAT repeat-containing PBS lyase  27.41 
 
 
313 aa  46.2  0.0004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.793568  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2192  HEAT repeat-containing PBS lyase  32.74 
 
 
176 aa  45.8  0.0005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0609  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  25.84 
 
 
822 aa  45.8  0.0005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1824  hypothetical protein  25 
 
 
1224 aa  45.1  0.0007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.21873  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1293  HEAT repeat-containing PBS lyase  30.35 
 
 
333 aa  45.4  0.0007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.737747  normal  0.270405 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5731  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  32.61 
 
 
431 aa  45.4  0.0007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2515  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  36.25 
 
 
101 aa  45.4  0.0007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.808601  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3676  HEAT domain containing protein  26.22 
 
 
886 aa  45.1  0.0008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000145397 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3152  hypothetical protein  29.58 
 
 
431 aa  44.3  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.119885  normal  0.0295401 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2129  HEAT repeat-containing PBS lyase  27.18 
 
 
399 aa  44.3  0.001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.846494  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5008  HEAT repeat-containing PBS lyase  26.78 
 
 
321 aa  44.7  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0940  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  28.64 
 
 
408 aa  45.1  0.001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2175  HEAT repeat-containing PBS lyase  25.31 
 
 
490 aa  43.9  0.002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.779763  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0697  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  27.65 
 
 
208 aa  44.3  0.002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0575876  normal  0.921461 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0458  serine/threonine protein kinase  23.76 
 
 
593 aa  43.9  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.11555  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0210  phycobiliprotein, putative  27.32 
 
 
321 aa  43.1  0.003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.203679 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4882  hypothetical protein  27.42 
 
 
316 aa  43.5  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.453587  normal  0.143497 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1616  HEAT repeat-containing PBS lyase  25.48 
 
 
375 aa  43.1  0.003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000382095  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2016  SH3 type 3 domain-containing protein  30.92 
 
 
773 aa  43.1  0.003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000554023  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0278  peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  31.06 
 
 
846 aa  43.5  0.003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00401975  hitchhiker  0.000238179 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3274  HEAT repeat-containing PBS lyase  31.62 
 
 
215 aa  42.7  0.004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000494855  normal  0.143744 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1531  HEAT repeat-containing PBS lyase  27.67 
 
 
1412 aa  42.7  0.004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0731666  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1736  HEAT repeat-containing PBS lyase  41.77 
 
 
1438 aa  42.7  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.198352  normal  0.401891 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4073  HEAT repeat-containing PBS lyase  25.64 
 
 
325 aa  42.4  0.005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.429453  normal  0.578065 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1642  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  23.94 
 
 
821 aa  42.4  0.005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.723052  normal  0.546905 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1862  HEAT repeat-containing PBS lyase  33.68 
 
 
157 aa  42.4  0.006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.715493 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5869  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  35.9 
 
 
283 aa  42.4  0.006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.618301 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1972  heme-binding protein  35.34 
 
 
1110 aa  42.4  0.006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0294  PBS lyase HEAT domain-containing protein repeat-containing protein  27.92 
 
 
261 aa  42  0.006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.936732  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1572  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  26.06 
 
 
377 aa  42  0.007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0581284  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>