31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_1874 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009051  Memar_1874  HEAT repeat-containing PBS lyase  100 
 
 		 311 aa  603  1.0000000000000001e-171  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1875  HEAT repeat-containing PBS lyase  31.4 
 
 		 302 aa  90.5  3e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3152  hypothetical protein  47.76 
 
 		 431 aa  64.3  0.000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.119885  normal  0.0295401 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1817  phycocyanin alpha phycocyanobilin lyase  49.3 
 
 		 493 aa  58.2  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0551014  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0115  HEAT repeat-containing PBS lyase  42.03 
 
 		 395 aa  56.2  0.0000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2175  HEAT repeat-containing PBS lyase  31.52 
 
 		 490 aa  56.2  0.0000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.779763  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3394  HEAT repeat-containing PBS lyase  47.83 
 
 		 524 aa  55.5  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.232744  normal  0.348803 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3392  HEAT repeat-containing PBS lyase  48.19 
 
 		 510 aa  55.5  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.323304 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0697  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  49.18 
 
 		 208 aa  53.1  0.000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0575876  normal  0.921461 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0933  hypothetical protein  26.3 
 
 		 958 aa  52  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.471083  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2129  HEAT repeat-containing PBS lyase  38.05 
 
 		 399 aa  51.6  0.00002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.846494  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1826  hypothetical protein  39.74 
 
 		 1094 aa  50.1  0.00005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0811  HEAT repeat-containing PBS lyase  37.62 
 
 		 192 aa  50.1  0.00005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1531  HEAT repeat-containing PBS lyase  34.88 
 
 		 1412 aa  49.3  0.00007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0731666  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1507  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  38.46 
 
 		 445 aa  49.7  0.00007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3508  signal transduction protein  31.78 
 
 		 1148 aa  48.5  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.139224 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0675  HEAT repeat-containing PBS lyase  40.28 
 
 		 323 aa  48.1  0.0002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2426  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  36.54 
 
 		 464 aa  48.1  0.0002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0156  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  45.57 
 
 		 284 aa  46.6  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00291683 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0617  HEAT repeat-containing PBS lyase  37.18 
 
 		 1041 aa  45.8  0.0008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.639116  normal  0.314613 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0342  HEAT repeat-containing PBS lyase  48.48 
 
 		 101 aa  45.8  0.0009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.649618 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2732  HEAT domain containing protein  50 
 
 		 1133 aa  45.4  0.001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0604  phycocyanin alpha phycocyanobilin lyase related protein  36.92 
 
 		 501 aa  45.1  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1736  HEAT repeat-containing PBS lyase  46.38 
 
 		 1438 aa  44.3  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.198352  normal  0.401891 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3019  phycocyanin alpha-subunit  38.89 
 
 		 546 aa  45.1  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.993507  hitchhiker  0.00737492 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0823  HEAT repeat-containing PBS lyase  45.12 
 
 		 180 aa  44.3  0.003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.922694  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2133  hypothetical protein  42.65 
 
 		 84 aa  43.5  0.005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2934  HEAT repeat-containing PBS lyase  34.92 
 
 		 276 aa  43.1  0.005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1030  HEAT repeat-containing PBS lyase  39.78 
 
 		 1139 aa  43.1  0.007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.762033  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0746  HEAT repeat-containing PBS lyase  29.8 
 
 		 313 aa  42.7  0.008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.793568  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0822  HEAT repeat-containing PBS lyase  40.24 
 
 		 200 aa  42.4  0.009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.166674  normal  0.581812 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>