44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC8801_0553 on replicon NC_011726
Organism: Cyanothece sp. PCC 8801



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013161  Cyan8802_0570  putative signal transduction protein with Nacht domain  99.68 
 
 
1235 aa  2536    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.466575 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0553  putative signal transduction protein with Nacht domain  100 
 
 
1235 aa  2548    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4212  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  38.79 
 
 
1234 aa  833    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1763  putative signal transduction protein with Nacht domain protein  30.12 
 
 
1475 aa  379  1e-103  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.923912 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0049  HEAT repeat-containing PBS lyase  31.2 
 
 
944 aa  348  2e-94  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.229879  normal  0.368167 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0622  putative signal transduction protein with Nacht domain protein  30.22 
 
 
872 aa  310  1.0000000000000001e-82  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2638  putative signal transduction protein with Nacht domain protein  34.86 
 
 
852 aa  256  2.0000000000000002e-66  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.637289 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1841  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  28.62 
 
 
1343 aa  110  2e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.520685  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1826  hypothetical protein  23.47 
 
 
1094 aa  94.7  9e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3392  HEAT repeat-containing PBS lyase  27.8 
 
 
510 aa  72  0.00000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.323304 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1201  HEAT repeat-containing protein  28.41 
 
 
644 aa  68.9  0.0000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.88812  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3244  signal transduction protein  25 
 
 
799 aa  62.4  0.00000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.0094323  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0675  HEAT repeat-containing PBS lyase  28.23 
 
 
323 aa  60.5  0.0000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4394  HEAT repeat-containing PBS lyase  26.7 
 
 
851 aa  59.7  0.0000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.6079 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0746  HEAT repeat-containing PBS lyase  26.67 
 
 
313 aa  56.6  0.000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.793568  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3019  phycocyanin alpha-subunit  27.8 
 
 
546 aa  56.2  0.000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.993507  hitchhiker  0.00737492 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3508  signal transduction protein  27.59 
 
 
1148 aa  54.7  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.139224 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1916  signal transduction protein  25.31 
 
 
766 aa  53.9  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.394463 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0996  HEAT repeat-containing PBS lyase  20.98 
 
 
1110 aa  53.9  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.399368  normal  0.160233 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2732  HEAT domain containing protein  31.41 
 
 
1133 aa  53.1  0.00003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2349  protein of unknown function DUF323  19.78 
 
 
1186 aa  52.8  0.00004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.719002  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2016  SH3 type 3 domain-containing protein  23.08 
 
 
773 aa  52.8  0.00005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000554023  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0650  signal transduction protein  24.12 
 
 
801 aa  51.2  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.190918 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1817  phycocyanin alpha phycocyanobilin lyase  24.03 
 
 
493 aa  51.2  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0551014  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1587  protein of unknown function DUF323  19.36 
 
 
1064 aa  51.6  0.0001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4227  HEAT domain containing protein  26.32 
 
 
756 aa  50.4  0.0002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0826  heat domain-containing protein  21.63 
 
 
1328 aa  50.1  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.851003  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0251  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  22.62 
 
 
408 aa  50.1  0.0003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.169018  normal  0.0104715 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1531  HEAT repeat-containing PBS lyase  25.45 
 
 
1412 aa  49.7  0.0003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0731666  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0933  hypothetical protein  26.09 
 
 
958 aa  50.1  0.0003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.471083  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1824  hypothetical protein  30.11 
 
 
1224 aa  50.1  0.0003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.21873  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0067  signal transduction protein  22.18 
 
 
773 aa  49.3  0.0004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.571466  normal  0.0199052 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5124  hypothetical protein  25.13 
 
 
951 aa  49.3  0.0005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2192  protein of unknown function DUF323  20.17 
 
 
1049 aa  48.9  0.0005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3214  putative signal transduction protein with Nacht domain  23.25 
 
 
649 aa  49.3  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.614434  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1553  putative signal transduction protein with Nacht domain  20.78 
 
 
1023 aa  48.9  0.0006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0972336  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1940  SH3 type 3 domain-containing protein  25.42 
 
 
522 aa  48.9  0.0006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0604  phycocyanin alpha phycocyanobilin lyase related protein  26.7 
 
 
501 aa  47.4  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5122  signal transduction protein  24.37 
 
 
953 aa  47  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1299  hypothetical protein  19.35 
 
 
1492 aa  47  0.002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1875  HEAT repeat-containing PBS lyase  28.29 
 
 
302 aa  45.8  0.004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2887  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  26.55 
 
 
1181 aa  45.4  0.006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.371101  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0278  peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  29.45 
 
 
846 aa  45.1  0.009  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00401975  hitchhiker  0.000238179 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0753  HEAT domain containing protein  29.61 
 
 
838 aa  44.7  0.01  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>