49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_0029 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013158  Huta_0029  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  100 
 
 		 264 aa  506  9.999999999999999e-143  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.158294  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2465  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  47.06 
 
 		 288 aa  160  2e-38  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.642092  normal  0.482268 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1340  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  46.83 
 
 		 278 aa  147  2.0000000000000003e-34  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3508  signal transduction protein  34.83 
 
 		 1148 aa  71.6  0.00000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.139224 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1826  hypothetical protein  32.61 
 
 		 1094 aa  70.5  0.00000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0697  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  33.33 
 
 		 208 aa  63.9  0.000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0575876  normal  0.921461 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1841  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  33.13 
 
 		 1343 aa  60.8  0.00000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.520685  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0933  hypothetical protein  29.63 
 
 		 958 aa  58.5  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.471083  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1824  hypothetical protein  33.15 
 
 		 1224 aa  55.5  0.0000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.21873  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0675  HEAT repeat-containing PBS lyase  32.39 
 
 		 323 aa  55.5  0.000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1323  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  27.23 
 
 		 212 aa  51.6  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.490996  normal  0.334378 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0604  phycocyanin alpha phycocyanobilin lyase related protein  30.68 
 
 		 501 aa  50.4  0.00003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2175  HEAT repeat-containing PBS lyase  28.57 
 
 		 490 aa  50.4  0.00003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.779763  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1862  HEAT repeat-containing PBS lyase  35.19 
 
 		 157 aa  50.1  0.00004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.715493 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0823  HEAT repeat-containing PBS lyase  37.78 
 
 		 180 aa  49.7  0.00004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.922694  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3712  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  39.07 
 
 		 283 aa  49.7  0.00004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.13018  normal  0.417711 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4189  HEAT domain containing protein  32.61 
 
 		 319 aa  50.1  0.00004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0572  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  27.65 
 
 		 223 aa  49.7  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1391  HEAT domain containing protein  27.65 
 
 		 219 aa  49.7  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1201  HEAT repeat-containing protein  30.99 
 
 		 644 aa  48.1  0.0001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.88812  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4094  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  32.89 
 
 		 522 aa  47  0.0003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3615  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  31.49 
 
 		 221 aa  47  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.23751  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3019  phycocyanin alpha-subunit  28.27 
 
 		 546 aa  47  0.0003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.993507  hitchhiker  0.00737492 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0746  HEAT repeat-containing PBS lyase  27.85 
 
 		 313 aa  46.6  0.0005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.793568  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1480  HEAT repeat-containing protein  33.94 
 
 		 325 aa  46.6  0.0005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0133  HEAT repeat-containing PBS lyase  30.97 
 
 		 197 aa  46.2  0.0005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000842725  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2119  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  31.37 
 
 		 668 aa  46.2  0.0006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22351  HEAT repeat-containing protein  34.4 
 
 		 315 aa  45.4  0.0009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0425  HEAT repeat-containing PBS lyase  31.67 
 
 		 197 aa  45.1  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.164611  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2382  HEAT repeat-containing PBS lyase  28.41 
 
 		 234 aa  45.1  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.509121  normal  0.832729 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3158  phycobiliprotein, putative  32.91 
 
 		 320 aa  45.1  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1721  HEAT repeat-containing PBS lyase  29.05 
 
 		 234 aa  45.4  0.001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2887  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  30.3 
 
 		 1181 aa  44.3  0.002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.371101  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2306  HEAT repeat-containing PBS lyase  31.37 
 
 		 666 aa  44.7  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4762  HEAT repeat-containing PBS lyase  27.98 
 
 		 223 aa  43.9  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.122338  normal  0.117024 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0458  serine/threonine protein kinase  29.14 
 
 		 593 aa  43.9  0.003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.11555  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0115  HEAT repeat-containing PBS lyase  27.47 
 
 		 395 aa  43.5  0.003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1823  HEAT repeat-containing PBS lyase  32.58 
 
 		 219 aa  43.5  0.004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.565572 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4287  HEAT repeat-domain-containing protein-like protein  31.45 
 
 		 1194 aa  43.1  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.248989  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0676  HEAT repeat-containing PBS lyase  34.76 
 
 		 320 aa  43.1  0.004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.401005 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4548  HEAT repeat-containing PBS lyase  27.37 
 
 		 226 aa  43.1  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2563  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  25.16 
 
 		 220 aa  43.5  0.004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3349  heat domain-containing protein  32.5 
 
 		 319 aa  43.5  0.004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.364347  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3392  HEAT repeat-containing PBS lyase  31.21 
 
 		 510 aa  43.5  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.323304 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0811  HEAT repeat-containing PBS lyase  31.18 
 
 		 192 aa  42.7  0.006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0049  HEAT domain containing protein  28.74 
 
 		 959 aa  42.7  0.007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1817  phycocyanin alpha phycocyanobilin lyase  27.78 
 
 		 493 aa  42.4  0.008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0551014  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0617  HEAT repeat-containing PBS lyase  26.92 
 
 		 1041 aa  42  0.009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.639116  normal  0.314613 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34930  putative phycobiliprotein  32.07 
 
 		 321 aa  42  0.009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000771282  normal  0.964295 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>