48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9902_0612 on replicon NC_007513
Organism: Synechococcus sp. CC9902



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007513  Syncc9902_0612  HEAT repeat-containing PBS lyase  100 
 
 		 270 aa  532  1e-150  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.96054  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2060  HEAT repeat-containing PBS lyase  80 
 
 		 270 aa  432  1e-120  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.156934  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04441  hypothetical protein  67.42 
 
 		 263 aa  348  5e-95  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1010  HEAT repeat-containing PBS lyase  58.52 
 
 		 269 aa  294  1e-78  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18791  hypothetical protein  58.15 
 
 		 269 aa  293  2e-78  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.16399  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16001  hypothetical protein  57.41 
 
 		 269 aa  271  1e-71  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16601  hypothetical protein  52.63 
 
 		 256 aa  262  4e-69  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.529095  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16701  hypothetical protein  54.2 
 
 		 255 aa  242  5e-63  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.175067  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1573  HEAT repeat-containing PBS lyase  51.79 
 
 		 255 aa  239  2.9999999999999997e-62  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16821  hypothetical protein  53.81 
 
 		 255 aa  239  5e-62  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3776  HEAT domain containing protein  39.37 
 
 		 249 aa  152  5e-36  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000557068  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2038  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  40.59 
 
 		 246 aa  152  7e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3723  HEAT domain containing protein  39.37 
 
 		 249 aa  151  1e-35  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0542  HEAT domain containing protein  46.19 
 
 		 250 aa  149  6e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4484  heat domain-containing protein  42.78 
 
 		 246 aa  144  1e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.272856  normal  0.131097 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1752  hypothetical protein  39.32 
 
 		 250 aa  140  3e-32  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.253022 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0466  HEAT domain-containing protein  36.29 
 
 		 254 aa  132  6e-30  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.867471  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1404  HEAT repeat-containing PBS lyase  36.21 
 
 		 252 aa  131  9e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.284551  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1841  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  31.47 
 
 		 1343 aa  60.8  0.00000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.520685  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3392  HEAT repeat-containing PBS lyase  32.74 
 
 		 510 aa  59.7  0.00000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.323304 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2192  HEAT repeat-containing PBS lyase  36.88 
 
 		 176 aa  59.7  0.00000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1824  hypothetical protein  30.77 
 
 		 1224 aa  59.3  0.00000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.21873  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3508  signal transduction protein  32.42 
 
 		 1148 aa  57.8  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.139224 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3137  HEAT repeat-containing PBS lyase  30.05 
 
 		 370 aa  57.4  0.0000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000055982  hitchhiker  0.00466606 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0940  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  28.71 
 
 		 408 aa  56.6  0.0000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0604  phycocyanin alpha phycocyanobilin lyase related protein  32.41 
 
 		 501 aa  55.5  0.0000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0251  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  26.24 
 
 		 408 aa  52.8  0.000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.169018  normal  0.0104715 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1817  phycocyanin alpha phycocyanobilin lyase  29.5 
 
 		 493 aa  51.6  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0551014  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0933  hypothetical protein  27.81 
 
 		 958 aa  51.2  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.471083  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0925  hypothetical protein  25.23 
 
 		 517 aa  50.4  0.00003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0811  HEAT repeat-containing PBS lyase  33.91 
 
 		 192 aa  50.4  0.00003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1826  hypothetical protein  29.93 
 
 		 1094 aa  50.4  0.00003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0823  HEAT repeat-containing PBS lyase  32.24 
 
 		 180 aa  47.4  0.0002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.922694  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2887  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  32.12 
 
 		 1181 aa  47.4  0.0003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.371101  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0675  HEAT repeat-containing PBS lyase  30.89 
 
 		 323 aa  46.6  0.0005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0746  HEAT repeat-containing PBS lyase  30.72 
 
 		 313 aa  45.8  0.0006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.793568  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1480  HEAT repeat-containing protein  28.57 
 
 		 325 aa  45.8  0.0008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1381  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  30.87 
 
 		 220 aa  45.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1736  HEAT repeat-containing PBS lyase  33.33 
 
 		 1438 aa  45.4  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.198352  normal  0.401891 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1415  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  30.87 
 
 		 220 aa  45.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0754  hypothetical protein  27.57 
 
 		 199 aa  45.1  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000250438  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0676  HEAT repeat-containing PBS lyase  35.65 
 
 		 320 aa  44.3  0.002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.401005 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2129  HEAT repeat-containing PBS lyase  31.03 
 
 		 399 aa  44.3  0.002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.846494  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3158  phycobiliprotein, putative  29.29 
 
 		 320 aa  44.7  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3394  HEAT repeat-containing PBS lyase  35.04 
 
 		 524 aa  43.9  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.232744  normal  0.348803 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0049  HEAT domain containing protein  29.47 
 
 		 959 aa  43.5  0.004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2515  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  39.71 
 
 		 101 aa  42.4  0.007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.808601  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0133  HEAT repeat-containing PBS lyase  27.91 
 
 		 197 aa  42.4  0.009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000842725  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>