58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_1054 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_1054  HEAT repeat-containing PBS lyase  100 
 
 
273 aa  541  1e-153  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.230439  normal  0.0412138 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0156  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  57.58 
 
 
284 aa  295  8e-79  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00291683 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3041  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  55.27 
 
 
284 aa  291  6e-78  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3079  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  55.27 
 
 
284 aa  291  6e-78  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5047  HEAT repeat-containing PBS lyase  54.29 
 
 
289 aa  288  7e-77  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3485  PBS lyase HEAT domain-containing protein repeat-containing protein  51.87 
 
 
276 aa  257  1e-67  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.315582  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2934  HEAT repeat-containing PBS lyase  53.79 
 
 
276 aa  247  1e-64  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1692  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  53.03 
 
 
276 aa  218  7e-56  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.312329 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1911  HEAT repeat-containing PBS lyase  41.25 
 
 
256 aa  157  2e-37  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0294  PBS lyase HEAT domain-containing protein repeat-containing protein  40.16 
 
 
261 aa  155  6e-37  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.936732  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2928  HEAT repeat-containing PBS lyase  39.02 
 
 
253 aa  150  3e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.71825 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0418  HEAT repeat-containing PBS lyase  30.83 
 
 
492 aa  110  3e-23  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.092568  normal  0.037069 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5731  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  30.04 
 
 
431 aa  79  0.00000000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1826  hypothetical protein  30.32 
 
 
1094 aa  69.3  0.00000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011723  PCC8801_4512  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  30.22 
 
 
425 aa  62.8  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  normal  0.0839106  normal  0.594133 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0990  HEAT repeat-containing PBS lyase  29.2 
 
 
425 aa  61.6  0.00000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.260401 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3508  signal transduction protein  25.22 
 
 
1148 aa  57  0.0000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.139224 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3019  phycocyanin alpha-subunit  30.43 
 
 
546 aa  56.6  0.0000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.993507  hitchhiker  0.00737492 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1817  phycocyanin alpha phycocyanobilin lyase  30.56 
 
 
493 aa  56.6  0.0000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0551014  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3392  HEAT repeat-containing PBS lyase  32.14 
 
 
510 aa  56.6  0.0000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.323304 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0675  HEAT repeat-containing PBS lyase  27.18 
 
 
323 aa  55.8  0.0000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0933  hypothetical protein  29.6 
 
 
958 aa  55.1  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.471083  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2192  HEAT repeat-containing PBS lyase  32.54 
 
 
176 aa  53.5  0.000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1841  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  28.16 
 
 
1343 aa  53.5  0.000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.520685  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0604  phycocyanin alpha phycocyanobilin lyase related protein  38.6 
 
 
501 aa  52  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5071  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  32.2 
 
 
831 aa  51.2  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.886653  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0436  HEAT repeat-containing PBS lyase  27.91 
 
 
398 aa  51.2  0.00002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.601783  normal  0.423712 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0115  HEAT repeat-containing PBS lyase  27.82 
 
 
395 aa  50.8  0.00002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2175  HEAT repeat-containing PBS lyase  27.36 
 
 
490 aa  50.1  0.00003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.779763  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1898  putative bilin biosynthesis protein (CpeY)  26.28 
 
 
441 aa  50.4  0.00003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1824  hypothetical protein  26.51 
 
 
1224 aa  49.7  0.00006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.21873  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3140  HEAT repeat-containing PBS lyase  27.81 
 
 
670 aa  48.5  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0458  serine/threonine protein kinase  24.7 
 
 
593 aa  48.5  0.0001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.11555  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0925  hypothetical protein  27.75 
 
 
517 aa  48.5  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1862  HEAT repeat-containing PBS lyase  32.65 
 
 
157 aa  48.9  0.0001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.715493 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2859  HEAT domain containing protein  28.21 
 
 
428 aa  47.8  0.0002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.335978  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3137  HEAT repeat-containing PBS lyase  31.17 
 
 
370 aa  47.4  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000055982  hitchhiker  0.00466606 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1201  HEAT repeat-containing protein  38.46 
 
 
644 aa  46.6  0.0005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.88812  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3152  hypothetical protein  29.32 
 
 
431 aa  46.2  0.0005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.119885  normal  0.0295401 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0049  HEAT domain containing protein  33.33 
 
 
959 aa  46.2  0.0005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6210  heme-binding protein  25.59 
 
 
1141 aa  46.2  0.0006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0823  HEAT repeat-containing PBS lyase  37.36 
 
 
180 aa  45.8  0.0007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.922694  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2216  HEAT repeat-containing PBS lyase  28.4 
 
 
667 aa  45.1  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2732  HEAT domain containing protein  30.32 
 
 
1133 aa  44.3  0.002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2515  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  44.44 
 
 
101 aa  43.5  0.003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.808601  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0542  HEAT domain containing protein  29.17 
 
 
250 aa  43.9  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2803  HEAT repeat-containing PBS lyase  31.25 
 
 
320 aa  43.9  0.003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.873153 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1889  HEAT repeat-containing PBS lyase  31.71 
 
 
331 aa  43.5  0.004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.826607  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0617  HEAT repeat-containing PBS lyase  32.73 
 
 
1041 aa  43.1  0.005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.639116  normal  0.314613 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2119  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  35.96 
 
 
668 aa  43.1  0.005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0342  HEAT repeat-containing PBS lyase  41.54 
 
 
101 aa  42.7  0.006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.649618 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3276  HEAT repeat-containing PBS lyase  38.2 
 
 
557 aa  42.7  0.006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0257764  normal  0.485312 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0826  heat domain-containing protein  28.19 
 
 
1328 aa  42.4  0.007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.851003  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3776  HEAT domain containing protein  34.48 
 
 
249 aa  42.7  0.007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000557068  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1736  HEAT repeat-containing PBS lyase  28.14 
 
 
1438 aa  42.4  0.008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.198352  normal  0.401891 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0761  HEAT domain containing protein  33.33 
 
 
646 aa  42.4  0.009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.181899 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2129  HEAT repeat-containing PBS lyase  28.57 
 
 
399 aa  42.4  0.009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.846494  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2887  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  28.04 
 
 
1181 aa  42  0.01  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.371101  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>