29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_0213 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011898  Ccel_0213  hypothetical protein  100 
 
 
223 aa  463  9.999999999999999e-131  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2558  hypothetical protein  43.32 
 
 
214 aa  187  2e-46  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000292512  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1276  hypothetical protein  37.96 
 
 
206 aa  140  9.999999999999999e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.415352  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0598  hypothetical protein  35.24 
 
 
194 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000409551  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0612  hypothetical protein  35.24 
 
 
194 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000107431  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0085  hypothetical protein  28.57 
 
 
232 aa  63.2  0.000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0067  hypothetical protein  28.57 
 
 
232 aa  60.5  0.00000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1192  hypothetical protein  25.32 
 
 
228 aa  60.1  0.00000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.00959683  normal  0.311825 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01580  hypothetical protein  27.27 
 
 
248 aa  58.2  0.0000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20450  hypothetical protein  27.27 
 
 
234 aa  57.4  0.0000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0120  hypothetical protein  25.9 
 
 
221 aa  55.8  0.0000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5793  hypothetical protein  23.44 
 
 
233 aa  55.1  0.0000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.243711 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1600  hypothetical protein  25.52 
 
 
227 aa  55.1  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.988724  normal  0.695323 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0136  hypothetical protein  24.29 
 
 
225 aa  52  0.000007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0975  hypothetical protein  25.32 
 
 
236 aa  51.6  0.000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0630914 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0731  Crp/FNR family transcriptional regulator  24.69 
 
 
245 aa  50.8  0.00002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7275  PKD domain containing protein  25.86 
 
 
1138 aa  50.4  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000186518  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6311  hypothetical protein  25.14 
 
 
220 aa  49.7  0.00004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.566642 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1518  hypothetical protein  25.14 
 
 
220 aa  49.7  0.00004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5101  hypothetical protein  26.04 
 
 
228 aa  48.5  0.00007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.204756  normal  0.111259 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7276  Crp/FNR family transcriptional regulator  24.07 
 
 
272 aa  47.8  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.127431  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6969  hypothetical protein  24.04 
 
 
220 aa  47  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.83544  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4030  PKD domain containing protein  24.46 
 
 
1182 aa  47  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.775047 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4442  hypothetical protein  20.51 
 
 
219 aa  46.2  0.0004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0485245  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4398  PKD domain containing protein  23.2 
 
 
1142 aa  44.7  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0061097  normal  0.588694 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1732  Crp/FNR family transcriptional regulator  24.29 
 
 
232 aa  44.7  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.901856  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4406  hypothetical protein  21.57 
 
 
217 aa  43.1  0.004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.192664  normal  0.135313 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5054  PKD domain containing protein  22.84 
 
 
1135 aa  42.4  0.006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4674  hypothetical protein  25.31 
 
 
279 aa  41.6  0.009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.929518  normal  0.751673 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>