46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_1157 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_1157  hypothetical protein  100 
 
 		 151 aa  296  6e-80  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4863  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  77.78 
 
 		 112 aa  84.7  4e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.483102  normal  0.0640253 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4824  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  55.56 
 
 		 1117 aa  58.9  0.00000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.90345 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2003  hypothetical protein  47.44 
 
 		 850 aa  58.5  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.614926  normal  0.156337 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1480  coagulation factor 5/8 type domain protein  50 
 
 		 722 aa  57.4  0.00000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7912  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  55.56 
 
 		 953 aa  57.4  0.00000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.241269  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7911  hypothetical protein  55.56 
 
 		 392 aa  56.6  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3724  hypothetical protein  50 
 
 		 999 aa  55.5  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.606148  normal  0.741628 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2927  beta-1,3-glucanase precursor  48.15 
 
 		 1441 aa  55.1  0.0000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3212  peptidase S45 penicillin amidase  55.56 
 
 		 1103 aa  53.5  0.0000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0203581  normal  0.139028 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3687  coagulation factor 5/8 type domain protein  50 
 
 		 674 aa  52.4  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0980417  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3805  glycoside hydrolase family 18  48.15 
 
 		 801 aa  51.2  0.000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.165252 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5654  Beta-N-acetylhexosaminidase  48.08 
 
 		 756 aa  51.2  0.000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.171925  normal  0.428495 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0475  Beta-glucosidase-related glycosidases-like  52.83 
 
 		 1581 aa  50.8  0.000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.811095  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2177  glycoside hydrolase family protein  49.06 
 
 		 578 aa  50.8  0.000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0141597  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3845  Beta-glucosidase  48.15 
 
 		 987 aa  50.4  0.000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.822537  normal  0.0429767 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2035  peptidase S45 penicillin amidase  37.18 
 
 		 1070 aa  50.1  0.00001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.973933 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4909  coagulation factor 5/8 type domain protein  48.15 
 
 		 915 aa  49.7  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.01005  normal  0.104643 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3492  coagulation factor 5/8 type domain protein  45.45 
 
 		 962 aa  49.7  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.536777  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4499  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  47.27 
 
 		 470 aa  49.3  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4887  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  53.19 
 
 		 581 aa  49.3  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.825597 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4311  coagulation factor 5/8 type domain protein  43.64 
 
 		 755 aa  48.5  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0177286  hitchhiker  0.00166201 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4811  coagulation factor 5/8 type domain protein  35.9 
 
 		 971 aa  47.8  0.00005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000406891  unclonable  0.000000000000101535 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3281  coagulation factor 5/8 type-like  41.82 
 
 		 487 aa  47.8  0.00006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5195  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  41.82 
 
 		 480 aa  47.8  0.00006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5087  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  41.82 
 
 		 487 aa  47.8  0.00006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.800108 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5024  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  43.64 
 
 		 470 aa  46.6  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4312  coagulation factor 5/8 type domain protein  44.44 
 
 		 1007 aa  46.6  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.382948  hitchhiker  0.000989115 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3544  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  40 
 
 		 471 aa  45.8  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2512  cellulose-binding family II protein  45.1 
 
 		 637 aa  46.2  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4855  coagulation factor 5/8 type domain protein  43.64 
 
 		 472 aa  45.1  0.0003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0569  putative secreted protein  41.82 
 
 		 470 aa  45.4  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3778  coagulation factor 5/8 type domain protein  43.64 
 
 		 472 aa  45.1  0.0003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0933074  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2893  Alkaline phosphatase  41.51 
 
 		 452 aa  44.3  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.21156  normal  0.886769 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6675  coagulation factor 5/8 type domain protein  43.4 
 
 		 929 aa  43.9  0.0007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.692846  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5042  glycoside hydrolase family 3 domain protein  47.27 
 
 		 1321 aa  44.3  0.0007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0478  GTP-binding protein TypA  41.67 
 
 		 1028 aa  43.9  0.0008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1551  hypothetical protein  46.3 
 
 		 571 aa  43.1  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3395  Licheninase  45.28 
 
 		 588 aa  43.1  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.585681 
 
 
-
 
NC_003296  RS03685  signal peptide protein  40 
 
 		 475 aa  42.4  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0875463  normal  0.498425 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3396  hypothetical protein  42.59 
 
 		 433 aa  42  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.494224 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3493  glycoside hydrolase family 3 domain protein  47.17 
 
 		 1158 aa  42  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.035247  normal  0.808735 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5094  conserved repeat domain protein  38.46 
 
 		 4013 aa  41.6  0.004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3723  hypothetical protein  48.15 
 
 		 449 aa  41.6  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.788097  normal  0.713748 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2816  glycoside hydrolase family protein  35.85 
 
 		 752 aa  40.8  0.007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000106793  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2796  coagulation factor 5/8 type domain protein  41.07 
 
 		 1139 aa  40.4  0.009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.151007  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>