15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_3166 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_3166  hypothetical protein  100 
 
 		 320 aa  654    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.252461  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3033  hypothetical protein  85.36 
 
 		 292 aa  500  1e-140  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0401759 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2927  beta-1,3-glucanase precursor  39.57 
 
 		 1441 aa  185  9e-46  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1445  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  39.48 
 
 		 473 aa  176  4e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2528  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  31.54 
 
 		 654 aa  99.8  6e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.97811  normal  0.381441 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5684  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  31.15 
 
 		 642 aa  93.6  4e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.354384  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4930  hypothetical protein  30 
 
 		 279 aa  92.8  7e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.13299  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7153  hypothetical protein  31.02 
 
 		 300 aa  89.4  7e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1979  glycosyl hydrolase 53 protein  29.8 
 
 		 399 aa  83.6  0.000000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.861107 
 
 
-
 
NC_006687  CNE03340  conserved hypothetical protein  29.23 
 
 		 301 aa  70.5  0.00000000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.144085  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03925  conserved hypothetical protein  28.3 
 
 		 279 aa  70.1  0.00000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.15718  normal  0.280487 
 
 
-
 
NC_006684  CNB03460  conserved hypothetical protein  26.12 
 
 		 417 aa  69.3  0.00000000009  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.056245  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07871  conserved hypothetical protein  25.1 
 
 		 234 aa  59.7  0.00000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.104048  normal  0.872612 
 
 
-
 
NC_006681  CNL06520  conserved hypothetical protein  25.66 
 
 		 443 aa  56.2  0.0000007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA02400  conserved hypothetical protein  25.1 
 
 		 442 aa  53.1  0.000005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  decreased coverage  0.00957306  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>