67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_0446 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008726  Mvan_0446  glycoside hydrolase family protein  100 
 
 
287 aa  584  1e-166  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.511543  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0404  glycoside hydrolase family protein  88.5 
 
 
283 aa  501  1e-141  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.131377  normal  0.361785 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0425  glycoside hydrolase family protein  88.5 
 
 
283 aa  501  1e-141  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0942551  normal  0.978104 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0416  twin-arginine translocation pathway signal  88.5 
 
 
283 aa  501  1e-141  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0298  glycoside hydrolase family protein  78.75 
 
 
286 aa  465  9.999999999999999e-131  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0557225 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10320  beta-1,3-glucanase precursor  57.79 
 
 
294 aa  280  1e-74  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0132676  normal  0.819711 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1538  glycoside hydrolase family 16  31.02 
 
 
423 aa  84  0.000000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7304  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  28.29 
 
 
261 aa  73.6  0.000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0696013 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3395  Licheninase  28.3 
 
 
588 aa  72.8  0.000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.585681 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2927  beta-1,3-glucanase precursor  30.32 
 
 
1441 aa  70.1  0.00000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1590  glycoside hydrolase family 16  29.34 
 
 
289 aa  68.9  0.00000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0592572 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2626  glycoside hydrolase family 16  29 
 
 
283 aa  67.4  0.0000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.444573  normal  0.839532 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5321  glycoside hydrolase family 16  29.77 
 
 
426 aa  67.4  0.0000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.349726  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1690  glycoside hydrolase family 16  23.78 
 
 
279 aa  65.9  0.0000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4150  glycoside hydrolase family 16  29.32 
 
 
269 aa  64.3  0.000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4177  glycoside hydrolase family protein  30.14 
 
 
1332 aa  64.7  0.000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3843  glycoside hydrolase family protein  26.22 
 
 
346 aa  63.9  0.000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.106581 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2435  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  30.62 
 
 
252 aa  63.5  0.000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.744797  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0843  carbohydrate binding family 6  30.34 
 
 
470 aa  62.4  0.000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.392015 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3723  beta-glucanase  26.2 
 
 
330 aa  62  0.00000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1342  glycoside hydrolase family 16  26.52 
 
 
274 aa  60.8  0.00000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.345936 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4787  coagulation factor 5/8 type domain protein  27.59 
 
 
819 aa  60.8  0.00000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5109  glycoside hydrolase family 16  27.78 
 
 
409 aa  60.8  0.00000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0369397  normal  0.380992 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2739  glycoside hydrolase family protein  27.43 
 
 
308 aa  60.5  0.00000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.77425  normal  0.433839 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4667  glycoside hydrolase family 16  25.29 
 
 
275 aa  59.3  0.00000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4931  glycoside hydrolase family 16  28.64 
 
 
286 aa  59.3  0.00000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.454153  normal  0.64066 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2679  glycoside hydrolase family protein  30.04 
 
 
260 aa  59.3  0.00000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2387  glycoside hydrolase family protein  30.05 
 
 
384 aa  57.4  0.0000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.286598  normal  0.735718 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0284  glycoside hydrolase family 16  29.92 
 
 
256 aa  57.4  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3627  glycoside hydrolase family protein  23.9 
 
 
394 aa  57  0.0000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.652484  normal  0.593329 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6754  glycoside hydrolase family protein  29.85 
 
 
284 aa  56.2  0.0000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4617  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  29.63 
 
 
633 aa  56.2  0.0000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2607  laminarinase  27.56 
 
 
883 aa  56.2  0.0000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2434  glycoside hydrolase family protein  24.51 
 
 
556 aa  55.8  0.0000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.971085  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0109  glycoside hydrolase family 16  27.03 
 
 
276 aa  54.3  0.000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0321176  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02670  glycoside hydrolase family 16  27.64 
 
 
503 aa  54.3  0.000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3100  glycoside hydrolase family 16  27.89 
 
 
291 aa  53.9  0.000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.194858 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1131  Glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  25.39 
 
 
547 aa  53.5  0.000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.232091  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4377  glycoside hydrolase family protein  27.5 
 
 
469 aa  53.1  0.000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6737  glycoside hydrolase family 16  25.47 
 
 
286 aa  52.8  0.000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.833986  normal  0.682845 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3954  glycoside hydrolase family 16  26.46 
 
 
318 aa  52.4  0.000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.913325  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1600  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  27.48 
 
 
288 aa  51.6  0.00001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.715273  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0451  Glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  28.23 
 
 
627 aa  52  0.00001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000399105  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3674  carbohydrate-binding family 6 protein  26.32 
 
 
479 aa  51.6  0.00001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4533  glycoside hydrolase family protein  26.59 
 
 
306 aa  52  0.00001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.445894  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6434  glycoside hydrolase family 16  26.92 
 
 
286 aa  51.2  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5116  Licheninase  28 
 
 
1059 aa  51.2  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0998931 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4545  glycoside hydrolase family 16  28.16 
 
 
383 aa  50.8  0.00003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0286  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  24.31 
 
 
282 aa  50.1  0.00005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0652  Beta-glucanase/Beta-glucan synthetase-like  27.85 
 
 
569 aa  49.3  0.00008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.307266  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2809  glycoside hydrolase family protein  27.31 
 
 
1321 aa  48.9  0.00009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.149168  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4050  carbohydrate-binding family 6 protein  25.82 
 
 
479 aa  48.9  0.0001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.567483  normal  0.0446183 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6294  glycoside hydrolase family protein  28.71 
 
 
427 aa  48.5  0.0001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.202957  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0392  glycoside hydrolase family 16  25 
 
 
691 aa  48.5  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0144  glycoside hydrolase family 16  29.94 
 
 
337 aa  48.5  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.568109  normal  0.0389127 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0724  beta-glucanase/beta-glucan synthetase-like protein  25.71 
 
 
295 aa  47.8  0.0002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.882839  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4931  glycoside hydrolase family protein  30.28 
 
 
465 aa  47  0.0004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.533696 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0724  Glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  26.89 
 
 
290 aa  45.1  0.001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.337879 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0558  glycoside hydrolase family protein  23.67 
 
 
449 aa  45.4  0.001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0874314  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2108  glycoside hydrolase family 16  27.74 
 
 
319 aa  44.3  0.002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.369089 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1077  Carbohydrate binding family 6  26.58 
 
 
464 aa  45.1  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04240  Glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  26.98 
 
 
1290 aa  43.9  0.003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_54681  endo-1,3-beta-glucosidase  25.09 
 
 
1028 aa  43.1  0.005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3542  glycoside hydrolase family 16  25 
 
 
288 aa  43.1  0.005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4707  glycoside hydrolase family protein  22.34 
 
 
291 aa  42.4  0.008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.359297 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0560  glycoside hydrolase family 16  21.86 
 
 
263 aa  42.4  0.008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2816  glycoside hydrolase family protein  28.79 
 
 
752 aa  42.4  0.008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000106793  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>