130 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_4512 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_4512  Carbohydrate binding family 6  100 
 
 		 1391 aa  2867    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.472745 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1954  hypothetical protein  50.1 
 
 		 525 aa  503  1e-140  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.450301  hitchhiker  0.00199296 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3003  hypothetical protein  34.55 
 
 		 1167 aa  259  2e-67  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.25795  hitchhiker  0.000812606 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2929  hypothetical protein  44.15 
 
 		 673 aa  209  3e-52  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2494  hypothetical protein  43.97 
 
 		 610 aa  196  3e-48  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2993  endoglucanase-like  36.84 
 
 		 863 aa  167  9e-40  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0380373  hitchhiker  0.000000401461 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5117  Carbohydrate binding family 6  31.55 
 
 		 1132 aa  166  4.0000000000000004e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.17685 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0652  Beta-glucanase/Beta-glucan synthetase-like  36.58 
 
 		 569 aa  155  4e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.307266  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2832  hypothetical protein  39.22 
 
 		 877 aa  152  4e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0897926  normal  0.0109857 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7479  Carbohydrate binding family 6  34.98 
 
 		 918 aa  151  9e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0488  Carbohydrate binding family 6  23.45 
 
 		 1799 aa  148  8.000000000000001e-34  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1838  Carbohydrate binding family 6  24.17 
 
 		 1035 aa  144  1.9999999999999998e-32  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.533489  normal  0.441295 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2992  helix-turn-helix, AraC type  33.56 
 
 		 982 aa  140  2e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0557584  hitchhiker  0.000000421127 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1609  Beta-glucosidase  31.07 
 
 		 1338 aa  124  9.999999999999999e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.344254 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5042  glycoside hydrolase family 3 domain protein  29.18 
 
 		 1321 aa  123  3e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2187  Carbohydrate binding family 6  41.4 
 
 		 389 aa  115  5e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00108018  hitchhiker  0.000808611 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4175  glycoside hydrolase family protein  35.47 
 
 		 541 aa  109  4e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3536  Carbohydrate binding family 6  36.22 
 
 		 726 aa  108  6e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.414252  normal  0.419471 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4284  Carbohydrate binding family 6  43.18 
 
 		 705 aa  108  1e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.162289  normal  0.0937971 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3927  peptidyl-Asp metallopeptidase. metallo peptidase. MEROPS family M72  45.53 
 
 		 465 aa  107  2e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3753  Carbohydrate binding family 6  48.84 
 
 		 639 aa  106  4e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000661715 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3023  endoglucanase-like  43.8 
 
 		 869 aa  102  4e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00102959 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2186  glycoside hydrolase family 18  42.37 
 
 		 536 aa  102  4e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0363978  hitchhiker  0.000898498 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1779  Carbohydrate binding family 6  25.09 
 
 		 526 aa  102  6e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00214562  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4176  carbohydrate-binding family 6 protein  37.09 
 
 		 884 aa  102  7e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02670  glycoside hydrolase family 16  42.4 
 
 		 503 aa  101  8e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1873  carbohydrate-binding family 6 protein  30.14 
 
 		 1091 aa  101  9e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00027012  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1393  thiol oxidoreductase-like  29.69 
 
 		 1707 aa  101  1e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.619739  normal  0.222979 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4337  coagulation factor 5/8 type domain protein  37.42 
 
 		 933 aa  99.4  4e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.202539 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6229  Carbohydrate binding family 6  49.07 
 
 		 461 aa  99  5e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0216  hypothetical protein  30.53 
 
 		 630 aa  98.2  1e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.80342 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4545  glycoside hydrolase family 16  45.76 
 
 		 383 aa  97.8  1e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3787  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  29.92 
 
 		 945 aa  97.4  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.339008  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1344  periplasmic copper-binding  28.77 
 
 		 954 aa  97.1  2e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.283677  normal  0.307468 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1271  carbohydrate-binding family 6 protein  27.61 
 
 		 679 aa  96.3  4e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4174  carbohydrate-binding family 6 protein  40 
 
 		 957 aa  95.1  8e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.49527  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2996  endoglucanase-like  42.19 
 
 		 853 aa  95.1  9e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0689244  hitchhiker  0.000000433363 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2137  Carbohydrate binding family 6  23.21 
 
 		 1262 aa  92  7e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.138075  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0112  hypothetical protein  33.33 
 
 		 1024 aa  86.7  0.000000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0292658  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3805  glycoside hydrolase family 18  29.78 
 
 		 801 aa  84  0.00000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.165252 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0078  Carbohydrate binding family 6  26.32 
 
 		 1234 aa  80.5  0.0000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.511687 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3260  hypothetical protein  33.11 
 
 		 500 aa  80.1  0.0000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00293464 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4050  carbohydrate-binding family 6 protein  36.15 
 
 		 479 aa  79.3  0.0000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.567483  normal  0.0446183 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2193  carbohydrate-binding family 6 protein  38.74 
 
 		 948 aa  79  0.0000000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.43679  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2066  Carbohydrate binding family 6  35.66 
 
 		 870 aa  78.2  0.000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3892  hypothetical protein  35.16 
 
 		 550 aa  77.4  0.000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0718789  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1756  Carbohydrate binding family 6  25.4 
 
 		 930 aa  77  0.000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.127893  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2068  Carbohydrate binding family 6  35.21 
 
 		 1356 aa  75.9  0.000000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.684202  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1978  Carbohydrate binding family 6  33.56 
 
 		 823 aa  75.5  0.000000000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.410685 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0843  carbohydrate binding family 6  33.59 
 
 		 470 aa  75.1  0.000000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.392015 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2067  Carbohydrate binding family 6  35.21 
 
 		 819 aa  75.1  0.000000000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.517806  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2194  carbohydrate-binding family 6 protein  36.72 
 
 		 501 aa  73.9  0.00000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.29628  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0907  Carbohydrate binding family 6  33.1 
 
 		 845 aa  72.4  0.00000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00955406  normal  0.403954 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2398  Carbohydrate binding family 6  30.41 
 
 		 1004 aa  71.6  0.00000000009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0137535  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2322  protein of unknown function DUF1080  36.5 
 
 		 1444 aa  71.6  0.00000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.205839  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3324  carbohydrate-binding family 6 protein  30.2 
 
 		 972 aa  71.2  0.0000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1920  Carbohydrate binding family 6  33.56 
 
 		 777 aa  71.2  0.0000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.208758 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1656  Carbohydrate binding family 6  36.11 
 
 		 951 aa  70.5  0.0000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00148801  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5224  Carbohydrate binding family 6  32.81 
 
 		 566 aa  69.3  0.0000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.105995  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2070  Carbohydrate binding family 6  33.1 
 
 		 802 aa  69.3  0.0000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.002169  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2071  Carbohydrate binding family 6  39 
 
 		 1380 aa  69.7  0.0000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.306385  normal  0.362656 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0129  carbohydrate-binding family 6 protein  32.56 
 
 		 469 aa  69.3  0.0000000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.235369  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2671  Carbohydrate binding family 6  30.82 
 
 		 581 aa  69.3  0.0000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.684309 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2197  carbohydrate-binding family 6 protein  36 
 
 		 928 aa  67.8  0.000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.71663  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1232  Carbohydrate binding family 6  35.56 
 
 		 490 aa  67.8  0.000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.122742  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1175  agarase  28.05 
 
 		 598 aa  67.8  0.000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.000000000232044  unclonable  0.000000011081 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1473  Carbohydrate binding family 6  32.19 
 
 		 719 aa  67.4  0.000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  unclonable  0.0000967191  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1961  Carbohydrate binding family 6  30.82 
 
 		 840 aa  66.6  0.000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  unclonable  0.00050409  normal  0.0219561 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1961  Endo-1,4-beta-xylanase  36.36 
 
 		 524 aa  66.2  0.000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3240  protein of unknown function DUF291  22.06 
 
 		 2073 aa  65.9  0.000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1960  Carbohydrate binding family 6  30.07 
 
 		 786 aa  65.9  0.000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0676284  normal  0.0447838 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1237  Carbohydrate binding family 6  36.03 
 
 		 604 aa  65.5  0.000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0649618  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2971  glycoside hydrolase family 43  26.44 
 
 		 855 aa  65.5  0.000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0529993 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1239  Carbohydrate binding family 6  34.31 
 
 		 1015 aa  65.5  0.000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000298242  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1051  endoglucanase-related protein  29.27 
 
 		 1295 aa  64.7  0.00000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.222685 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2195  carbohydrate-binding family 6 protein  32 
 
 		 965 aa  63.5  0.00000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.862232  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1241  Carbohydrate binding family 6  33.07 
 
 		 1164 aa  63.5  0.00000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3674  carbohydrate-binding family 6 protein  31.25 
 
 		 479 aa  62.4  0.00000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1238  Carbohydrate binding family 6  33.87 
 
 		 1122 aa  62  0.00000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000137164  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1911  carbohydrate-binding family 6 protein  32.81 
 
 		 1290 aa  61.6  0.0000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.374482  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1342  periplasmic copper-binding  29.86 
 
 		 919 aa  60.8  0.0000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.766214 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1783  Carbohydrate binding family 6  30.99 
 
 		 2554 aa  60.5  0.0000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1784  Carbohydrate binding family 6  30.28 
 
 		 1732 aa  60.8  0.0000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.847863  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3213  glycoside hydrolase family 43  31.75 
 
 		 464 aa  60.5  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.331095  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2618  Carbohydrate binding family 6  34.95 
 
 		 522 aa  60.1  0.0000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0533616 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1231  Carbohydrate binding family 6  29.76 
 
 		 524 aa  60.1  0.0000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0177163  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2920  hypothetical protein  33.33 
 
 		 551 aa  59.3  0.0000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000907563  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0431  Carbohydrate binding family 6  31.78 
 
 		 966 aa  58.5  0.0000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.174739  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1469  Carbohydrate binding family 6  28.87 
 
 		 735 aa  58.5  0.0000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1242  Carbohydrate binding family 6  33.07 
 
 		 629 aa  58.2  0.000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.679314  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1810  Carbohydrate binding family 6  30.28 
 
 		 3295 aa  57.8  0.000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1229  Carbohydrate binding family 6  32.56 
 
 		 535 aa  57.4  0.000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.166566  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0455  Carbohydrate binding family 6  34.65 
 
 		 618 aa  57.8  0.000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2795  hypothetical protein  30.53 
 
 		 912 aa  56.6  0.000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00123137  hitchhiker  0.0000146968 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3218  Alpha-L-fucosidase  26.24 
 
 		 798 aa  57  0.000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.266545  normal  0.296598 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0404  Carbohydrate binding family 6  29.08 
 
 		 468 aa  57  0.000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.813596 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1233  Carbohydrate binding family 6  32.75 
 
 		 746 aa  57  0.000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.555313  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0242  Band 7 protein  30.43 
 
 		 681 aa  56.2  0.000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3141  lipolytic enzyme, G-D-S-L  31.17 
 
 		 831 aa  56.2  0.000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11080  glucose/sorbosone dehydrogenase  31.51 
 
 		 1505 aa  56.6  0.000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.120578  normal  0.319442 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>