39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_0289 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_3338  glycoside hydrolase family 5  78.48 
 
 		 382 aa  639    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0734572  normal  0.542716 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0289  glycoside hydrolase family 5  100 
 
 		 378 aa  790    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.014441  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0671  glycoside hydrolase family 5  48.57 
 
 		 331 aa  331  1e-89  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0234  glycoside hydrolase family 5  43.97 
 
 		 328 aa  277  2e-73  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0987  glycoside hydrolase family protein  40.26 
 
 		 402 aa  276  3e-73  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0923078  hitchhiker  0.00882175 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1073  glycoside hydrolase family protein  41.55 
 
 		 329 aa  275  1.0000000000000001e-72  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0119  glycoside hydrolase family protein  37.18 
 
 		 365 aa  272  7e-72  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.432881 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0888  glycoside hydrolase family protein  38.08 
 
 		 337 aa  220  1.9999999999999999e-56  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3317  glycoside hydrolase family protein  24.78 
 
 		 357 aa  95.9  1e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2807  glycoside hydrolase family protein  25.61 
 
 		 343 aa  88.6  1e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000151011  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0670  glycoside hydrolase family 5  25.67 
 
 		 312 aa  82.8  0.000000000000009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0669  Cellulase  24.47 
 
 		 332 aa  78.6  0.0000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6252  Cellulase  23.19 
 
 		 370 aa  70.5  0.00000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.827824  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0276  Cellulase  23.42 
 
 		 335 aa  70.1  0.00000000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.166979  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2195  glycoside hydrolase family 5  22.77 
 
 		 337 aa  69.7  0.00000000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1560  glycoside hydrolase family protein  25.25 
 
 		 343 aa  68.9  0.0000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000321145  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1689  glycoside hydrolase family protein  24.64 
 
 		 365 aa  62.8  0.000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0715346 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3093  glycoside hydrolase family protein  23.27 
 
 		 377 aa  62.4  0.00000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.288487  normal  0.253195 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1074  glycoside hydrolase family protein  22.3 
 
 		 335 aa  54.7  0.000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_39160  Endoglucanase C (EGC) (Endo-1,4-beta-glucanase) (Cellulase C)  25.75 
 
 		 483 aa  52.4  0.00001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.151498  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2178  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  25.31 
 
 		 673 aa  52  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00232015  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0182  glycoside hydrolase family protein  21.5 
 
 		 373 aa  50.4  0.00005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05710  endoglucanase  24.69 
 
 		 601 aa  49.7  0.00008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.118041  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2014  glycoside hydrolase family protein  23.57 
 
 		 501 aa  48.5  0.0002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4045  glycoside hydrolase family 5  25.91 
 
 		 573 aa  47.8  0.0003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0840  glycoside hydrolase family 5  21.84 
 
 		 584 aa  48.1  0.0003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04052  beta-1,3-exoglucosidase (Eurofung)  24.42 
 
 		 486 aa  47.4  0.0004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.137005  normal  0.167106 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2490  2-isopropylmalate synthase  26.6 
 
 		 566 aa  47.4  0.0004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_66312  Endo-1,4-beta-glucanase  22.94 
 
 		 481 aa  46.6  0.0007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0233843 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2058  cellulase  22.22 
 
 		 469 aa  44.7  0.002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.33329  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_39320  endoglucanase family 5 glycoside hydrolase  23.93 
 
 		 481 aa  45.1  0.002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.280438 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1902  glycoside hydrolase family protein  19.71 
 
 		 359 aa  45.4  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4149  glycoside hydrolase family 5  23.73 
 
 		 590 aa  44.7  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.533031  normal  0.39445 
 
 
-
 
NC_006693  CNH02900  cytoplasm protein, putative  26.03 
 
 		 498 aa  43.9  0.005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2147  glycoside hydrolase family protein  23.04 
 
 		 660 aa  43.5  0.006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3335  Cellulase  23.73 
 
 		 578 aa  43.5  0.006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.59527  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0797  glycoside hydrolase family protein  22.95 
 
 		 814 aa  43.5  0.007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_78873  Glucan 1,3-beta-glucosidase precursor (Exo-1,3-beta-glucanase)  27.27 
 
 		 438 aa  42.7  0.009  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.161777 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1586  Cellulase  23.23 
 
 		 545 aa  42.7  0.01  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>