29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_2058 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_2058  cellulase  100 
 
 		 469 aa  972    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.33329  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1099  glycoside hydrolase family 5  51.95 
 
 		 475 aa  422  1e-117  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0797  glycoside hydrolase family protein  41.74 
 
 		 814 aa  267  4e-70  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2636  DNA mismatch repair protein  32.69 
 
 		 621 aa  197  5.000000000000001e-49  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000000119439  normal  0.352688 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0325  dihydroxy-acid dehydratase  29.13 
 
 		 451 aa  175  1.9999999999999998e-42  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.375618  normal  0.486344 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0774  glycoside hydrolase family protein  31.7 
 
 		 502 aa  173  5e-42  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2781  glycoside hydrolase family 5  29.75 
 
 		 681 aa  159  8e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.183868  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3335  Cellulase  29.08 
 
 		 578 aa  157  3e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.59527  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1586  Cellulase  31.04 
 
 		 545 aa  156  6e-37  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0182  Cellulase  28.69 
 
 		 593 aa  151  3e-35  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5006  glycoside hydrolase family 5  29.53 
 
 		 516 aa  149  1.0000000000000001e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.180234  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4876  Cellulase  26.87 
 
 		 572 aa  130  5.0000000000000004e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.168386  normal  0.620598 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3202  cellulase  27.96 
 
 		 743 aa  127  5e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000270074  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4946  Cellulase  27.61 
 
 		 589 aa  126  9e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0257714  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08068  extracellular endoglucanase, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G01830)  29.18 
 
 		 572 aa  125  1e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1560  glycoside hydrolase family protein  30.4 
 
 		 343 aa  124  3e-27  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000321145  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1472  carbohydrate-binding family 11 protein  29.66 
 
 		 900 aa  122  9.999999999999999e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.980604  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0276  Cellulase  29.68 
 
 		 335 aa  122  9.999999999999999e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.166979  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0840  glycoside hydrolase family 5  25.86 
 
 		 584 aa  112  1.0000000000000001e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2490  2-isopropylmalate synthase  25.37 
 
 		 566 aa  107  3e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0669  Cellulase  28.94 
 
 		 332 aa  105  2e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0670  glycoside hydrolase family 5  25.57 
 
 		 312 aa  102  1e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1074  glycoside hydrolase family protein  25.29 
 
 		 335 aa  98.2  3e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1283  glycoside hydrolase family protein  24.81 
 
 		 332 aa  68.9  0.0000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00987671 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2929  hypothetical protein  21.85 
 
 		 673 aa  58.5  0.0000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6229  Carbohydrate binding family 6  21.64 
 
 		 461 aa  57.8  0.0000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4596  glycoside hydrolase family 5  22.75 
 
 		 378 aa  57  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3338  glycoside hydrolase family 5  25 
 
 		 382 aa  45.1  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0734572  normal  0.542716 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0289  glycoside hydrolase family 5  22.22 
 
 		 378 aa  44.3  0.004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.014441  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>