80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU2884 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU2884  cytochrome c family protein  100 
 
 		 1038 aa  2083    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0497  cytochrome C family protein  41.11 
 
 		 1053 aa  679    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2912  cytochrome c family protein  48.7 
 
 		 1046 aa  915    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.802585  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0558  cytochrome c family protein  48.44 
 
 		 1036 aa  873    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3428  cytochrome C family protein  58.06 
 
 		 1017 aa  1182    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.624718  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1193  cytochrome C family protein  43.46 
 
 		 1018 aa  710    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3057  cytochrome C family protein  42.75 
 
 		 1017 aa  701    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2883  cytochrome c family protein  53.44 
 
 		 902 aa  632  1e-179  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1834  cytochrome C family protein  45.54 
 
 		 1611 aa  577  1.0000000000000001e-163  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1152  cytochrome C family protein  38.23 
 
 		 1009 aa  524  1e-147  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3543  cytochrome C family protein  35.8 
 
 		 957 aa  323  9.999999999999999e-87  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3427  cytochrome C family protein  37.59 
 
 		 1457 aa  311  5.9999999999999995e-83  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.476422  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2888  hypothetical protein  47.56 
 
 		 1294 aa  309  2.0000000000000002e-82  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1153  cytochrome C family protein  35.57 
 
 		 958 aa  300  1e-79  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3470  cytochrome C family protein  35.57 
 
 		 958 aa  299  2e-79  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3544  cytochrome C family protein  42.47 
 
 		 1106 aa  293  1e-77  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3565  hypothetical protein  40.82 
 
 		 1110 aa  281  6e-74  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1198  cytochrome C family protein  31.6 
 
 		 1143 aa  268  2.9999999999999995e-70  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3052  cytochrome C family protein  33.33 
 
 		 1143 aa  267  1e-69  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0498  cytochrome C family protein  28.15 
 
 		 1281 aa  124  9e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.618718  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3426  cytochrome C family protein  28.52 
 
 		 901 aa  114  1.0000000000000001e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.360069  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0120  cytochrome C family protein  25.37 
 
 		 2026 aa  90.1  2e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.345457  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2869  cytochrome C family protein  24.46 
 
 		 1196 aa  86.3  0.000000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00106509  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3724  cytochrome C family protein  26.82 
 
 		 1691 aa  84  0.00000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2882  cytochrome c family protein  26.08 
 
 		 688 aa  77  0.000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3417  cytochrome C family protein  25.71 
 
 		 939 aa  76.6  0.000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000650224  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0398  cytochrome C family protein  28.09 
 
 		 672 aa  77  0.000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1823  cytochrome C family protein  25.35 
 
 		 1525 aa  76.3  0.000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2899  high-molecular-weight cytochrome c  31.44 
 
 		 979 aa  73.6  0.00000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1154  cytochrome C family protein  30.96 
 
 		 1454 aa  73.9  0.00000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3174  cytochrome C family protein  27.24 
 
 		 1329 aa  72.4  0.00000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.246364  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0702  cytochrome c family protein  25.68 
 
 		 1916 aa  70.5  0.0000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3542  cytochrome C family protein  27.86 
 
 		 1453 aa  69.3  0.0000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0075  cytochrome C family protein  26.19 
 
 		 2222 aa  69.7  0.0000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0575  cytochrome c family protein  32.31 
 
 		 1127 aa  68.6  0.0000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0571  cytochrome c family protein  30.26 
 
 		 1848 aa  67.8  0.000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3563  cytochrome C family protein  26.82 
 
 		 1276 aa  66.6  0.000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3564  cytochrome C family protein  26.85 
 
 		 955 aa  66.6  0.000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0076  cytochrome C family protein  24.68 
 
 		 1438 aa  65.9  0.000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0573  cytochrome C family protein  25.26 
 
 		 1672 aa  65.9  0.000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0077  cytochrome C family protein  25.99 
 
 		 2499 aa  64.7  0.000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0499  cytochrome C family protein  31.16 
 
 		 1379 aa  64.3  0.00000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00294186  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2035  cytochrome C family protein  22.8 
 
 		 1596 aa  64.3  0.00000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3261  cytochrome C family protein  24.08 
 
 		 656 aa  63.2  0.00000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3077  multihaem cytochrome  26.87 
 
 		 1330 aa  62.8  0.00000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1826  cytochrome C family protein  26.23 
 
 		 1645 aa  61.6  0.00000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0580  high-molecular-weight cytochrome c  26.77 
 
 		 869 aa  61.6  0.00000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3068  cytochrome c family protein  23.85 
 
 		 650 aa  60.8  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3166  cytochrome C family protein  23.95 
 
 		 650 aa  61.2  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1155  hypothetical protein  27.27 
 
 		 1537 aa  60.5  0.0000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2470  high-molecular-weight cytochrome c  28.28 
 
 		 1521 aa  60.1  0.0000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2763  cytochrome C family protein  27.08 
 
 		 336 aa  57.4  0.000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.888791  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2898  high-molecular-weight cytochrome c  25.12 
 
 		 2803 aa  55.5  0.000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0215  multihaem cytochrome  35.94 
 
 		 563 aa  54.7  0.000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.354833  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3268  cytochrome C family protein  25.52 
 
 		 1329 aa  54.7  0.000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0229  cytochrome C family protein  31.61 
 
 		 431 aa  53.1  0.00003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.286914 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0581  high-molecular-weight cytochrome c  24.74 
 
 		 2912 aa  52.4  0.00004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1827  cytochrome C family protein  28.45 
 
 		 656 aa  52.4  0.00005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.287996  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6276  cytochrome C family protein  29.79 
 
 		 501 aa  52  0.00006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.943991 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3049  cytochrome C family protein  23.49 
 
 		 2081 aa  51.6  0.00007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0747  multiheme cytochrome  21.78 
 
 		 487 aa  50.8  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.568299  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3541  hypothetical protein  27.31 
 
 		 1538 aa  50.4  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2495  cytochrome c family protein  27.86 
 
 		 646 aa  49.3  0.0003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1836  cytochrome C family protein  26.6 
 
 		 658 aa  49.7  0.0003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1900  hypothetical protein  24.03 
 
 		 340 aa  48.1  0.0008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.857082 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3108  cytochrome c family protein  30.3 
 
 		 553 aa  47.8  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2887  cytochrome c family protein  24.77 
 
 		 884 aa  47.4  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0141387  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2822  hypothetical protein  24.81 
 
 		 340 aa  48.1  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000171082  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1857  fibronectin type III domain-containing protein  24.6 
 
 		 733 aa  47.4  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1124  cytochrome C family protein  21.52 
 
 		 658 aa  47.8  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.932844  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3163  cytochrome C family protein  24.58 
 
 		 442 aa  46.2  0.003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2759  cytochrome C family protein  26.15 
 
 		 449 aa  46.2  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2816  cytochrome c like protein  31.03 
 
 		 655 aa  46.2  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.16928  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2815  cytochrome c like protein  27.56 
 
 		 457 aa  46.2  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3540  hypothetical protein  28.22 
 
 		 1289 aa  45.8  0.004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2820  cytochrome C family protein  26.42 
 
 		 312 aa  45.8  0.004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2903  cytochrome C family protein  29.39 
 
 		 455 aa  45.4  0.005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.864697  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2998  cytochrome C family protein  30.46 
 
 		 655 aa  45.4  0.006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2904  cytochrome C family protein  30.46 
 
 		 655 aa  45.4  0.006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2323  hypothetical protein  24.03 
 
 		 340 aa  44.7  0.009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00000105852  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>