62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU2899 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002939  GSU2899  high-molecular-weight cytochrome c  100 
 
 
979 aa  1988    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0580  high-molecular-weight cytochrome c  41.17 
 
 
869 aa  525  1e-147  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0575  cytochrome c family protein  38.97 
 
 
1127 aa  502  1e-140  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0076  cytochrome C family protein  32.83 
 
 
1438 aa  360  8e-98  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0077  cytochrome C family protein  39.53 
 
 
2499 aa  360  9e-98  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3563  cytochrome C family protein  33.33 
 
 
1276 aa  328  4.0000000000000003e-88  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0521  cytochrome C family protein  48.91 
 
 
383 aa  327  9e-88  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0075  cytochrome C family protein  31.93 
 
 
2222 aa  317  5e-85  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3052  cytochrome C family protein  36.02 
 
 
1143 aa  315  1.9999999999999998e-84  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0702  cytochrome c family protein  37.29 
 
 
1916 aa  313  1e-83  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1198  cytochrome C family protein  35.72 
 
 
1143 aa  312  2e-83  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0499  cytochrome C family protein  33.37 
 
 
1379 aa  302  2e-80  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00294186  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0571  cytochrome c family protein  34.81 
 
 
1848 aa  301  3e-80  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3427  cytochrome C family protein  34.69 
 
 
1457 aa  286  1.0000000000000001e-75  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.476422  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0120  cytochrome C family protein  34.2 
 
 
2026 aa  277  7e-73  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.345457  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2035  cytochrome C family protein  34.74 
 
 
1596 aa  277  8e-73  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2882  cytochrome c family protein  35.44 
 
 
688 aa  262  2e-68  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3426  cytochrome C family protein  37.82 
 
 
901 aa  259  2e-67  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.360069  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0573  cytochrome C family protein  32.97 
 
 
1672 aa  258  4e-67  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2869  cytochrome C family protein  41.98 
 
 
1196 aa  256  1.0000000000000001e-66  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00106509  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3724  cytochrome C family protein  32.24 
 
 
1691 aa  256  1.0000000000000001e-66  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2883  cytochrome c family protein  38.25 
 
 
902 aa  253  1e-65  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2470  high-molecular-weight cytochrome c  32.46 
 
 
1521 aa  224  8e-57  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3542  cytochrome C family protein  27.29 
 
 
1453 aa  208  5e-52  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1154  cytochrome C family protein  28.02 
 
 
1454 aa  202  3e-50  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0498  cytochrome C family protein  31.41 
 
 
1281 aa  198  3e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.618718  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1153  cytochrome C family protein  31.36 
 
 
958 aa  186  2.0000000000000003e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3470  cytochrome C family protein  31.52 
 
 
958 aa  186  2.0000000000000003e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3543  cytochrome C family protein  30.71 
 
 
957 aa  186  2.0000000000000003e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3564  cytochrome C family protein  29.84 
 
 
955 aa  184  1e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0398  cytochrome C family protein  27.6 
 
 
672 aa  166  2.0000000000000002e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3049  cytochrome C family protein  24.67 
 
 
2081 aa  119  3e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1834  cytochrome C family protein  25.84 
 
 
1611 aa  108  5e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0215  multihaem cytochrome  26.71 
 
 
563 aa  93.2  2e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.354833  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0229  cytochrome C family protein  27.76 
 
 
431 aa  81.6  0.00000000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.286914 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0497  cytochrome C family protein  32.72 
 
 
1053 aa  79.3  0.0000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2898  high-molecular-weight cytochrome c  24.97 
 
 
2803 aa  78.2  0.0000000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0581  high-molecular-weight cytochrome c  28.02 
 
 
2912 aa  77.4  0.000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2884  cytochrome c family protein  38.92 
 
 
1038 aa  69.7  0.0000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3057  cytochrome C family protein  24.62 
 
 
1017 aa  69.7  0.0000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2904  cytochrome C family protein  23.88 
 
 
655 aa  70.5  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2998  cytochrome C family protein  23.88 
 
 
655 aa  68.6  0.0000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2816  cytochrome c like protein  23.54 
 
 
655 aa  68.6  0.0000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.16928  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3540  hypothetical protein  32.03 
 
 
1289 aa  67  0.000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2903  cytochrome C family protein  25.73 
 
 
455 aa  65.5  0.000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.864697  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2762  cytochrome C family protein  29.03 
 
 
454 aa  63.9  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1152  cytochrome C family protein  30.45 
 
 
1009 aa  61.6  0.00000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1156  hypothetical protein  37.89 
 
 
176 aa  59.7  0.0000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1193  cytochrome C family protein  28.27 
 
 
1018 aa  57.8  0.0000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2997  cytochrome C family protein  26.57 
 
 
455 aa  57.4  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.742851  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3428  cytochrome C family protein  31.22 
 
 
1017 aa  57  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.624718  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2815  cytochrome c like protein  25.71 
 
 
457 aa  56.6  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2888  hypothetical protein  26.1 
 
 
1294 aa  53.9  0.00001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1826  cytochrome C family protein  23.27 
 
 
1645 aa  53.9  0.00001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3417  cytochrome C family protein  26.91 
 
 
939 aa  54.3  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000650224  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2912  cytochrome c family protein  29.19 
 
 
1046 aa  51.2  0.0001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.802585  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3077  multihaem cytochrome  24.86 
 
 
1330 aa  50.4  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3268  cytochrome C family protein  25.66 
 
 
1329 aa  49.3  0.0004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3174  cytochrome C family protein  24.35 
 
 
1329 aa  47  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.246364  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1823  cytochrome C family protein  21.66 
 
 
1525 aa  45.4  0.005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0558  cytochrome c family protein  23.1 
 
 
1036 aa  45.1  0.007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0500  cytochrome C family protein  27.52 
 
 
1496 aa  44.7  0.009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00446809  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>