63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_3426 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009483  Gura_3427  cytochrome C family protein  93.9 
 
 
1457 aa  903    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.476422  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3426  cytochrome C family protein  100 
 
 
901 aa  1798    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.360069  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2883  cytochrome c family protein  50.26 
 
 
902 aa  624  1e-177  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2882  cytochrome c family protein  63.08 
 
 
688 aa  580  1e-164  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2470  high-molecular-weight cytochrome c  39.77 
 
 
1521 aa  405  1e-111  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2035  cytochrome C family protein  40.95 
 
 
1596 aa  377  1e-103  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1834  cytochrome C family protein  38.02 
 
 
1611 aa  368  1e-100  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0573  cytochrome C family protein  41.48 
 
 
1672 aa  358  1.9999999999999998e-97  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0571  cytochrome c family protein  39.57 
 
 
1848 aa  328  3e-88  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0575  cytochrome c family protein  40.07 
 
 
1127 aa  327  7e-88  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3724  cytochrome C family protein  40.84 
 
 
1691 aa  323  9.999999999999999e-87  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3563  cytochrome C family protein  42.91 
 
 
1276 aa  310  5e-83  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3052  cytochrome C family protein  30.69 
 
 
1143 aa  301  3e-80  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1198  cytochrome C family protein  31.83 
 
 
1143 aa  293  1e-77  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2869  cytochrome C family protein  40.54 
 
 
1196 aa  273  1e-71  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00106509  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3564  cytochrome C family protein  39.26 
 
 
955 aa  267  5.999999999999999e-70  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2899  high-molecular-weight cytochrome c  38.29 
 
 
979 aa  260  8e-68  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1153  cytochrome C family protein  38.7 
 
 
958 aa  259  1e-67  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3543  cytochrome C family protein  38.61 
 
 
957 aa  258  3e-67  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3470  cytochrome C family protein  38.15 
 
 
958 aa  257  7e-67  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0702  cytochrome c family protein  38.17 
 
 
1916 aa  256  1.0000000000000001e-66  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0580  high-molecular-weight cytochrome c  37.16 
 
 
869 aa  227  6e-58  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3542  cytochrome C family protein  34.97 
 
 
1453 aa  204  6e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1154  cytochrome C family protein  35.56 
 
 
1454 aa  204  7e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0398  cytochrome C family protein  34.86 
 
 
672 aa  204  9e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0077  cytochrome C family protein  34.17 
 
 
2499 aa  202  1.9999999999999998e-50  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0499  cytochrome C family protein  34.5 
 
 
1379 aa  202  1.9999999999999998e-50  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00294186  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0498  cytochrome C family protein  35.01 
 
 
1281 aa  196  1e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.618718  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0076  cytochrome C family protein  33.33 
 
 
1438 aa  160  9e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0075  cytochrome C family protein  32.92 
 
 
2222 aa  145  3e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2912  cytochrome c family protein  28.24 
 
 
1046 aa  126  2e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.802585  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2884  cytochrome c family protein  28.52 
 
 
1038 aa  116  2.0000000000000002e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0558  cytochrome c family protein  31.56 
 
 
1036 aa  113  2.0000000000000002e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3428  cytochrome C family protein  26.75 
 
 
1017 aa  100  1e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.624718  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3057  cytochrome C family protein  27.66 
 
 
1017 aa  100  2e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1193  cytochrome C family protein  27.85 
 
 
1018 aa  99.4  3e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0120  cytochrome C family protein  29.9 
 
 
2026 aa  97.8  7e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.345457  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0500  cytochrome C family protein  43.35 
 
 
1496 aa  88.2  6e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00446809  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0497  cytochrome C family protein  26.43 
 
 
1053 aa  87  0.000000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2898  high-molecular-weight cytochrome c  28.44 
 
 
2803 aa  80.1  0.0000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1152  cytochrome C family protein  25.87 
 
 
1009 aa  72.8  0.00000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2815  cytochrome c like protein  32.43 
 
 
457 aa  60.1  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2998  cytochrome C family protein  24.68 
 
 
655 aa  59.7  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0581  high-molecular-weight cytochrome c  25.05 
 
 
2912 aa  59.7  0.0000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2816  cytochrome c like protein  24.51 
 
 
655 aa  59.7  0.0000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.16928  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2904  cytochrome C family protein  24.51 
 
 
655 aa  58.9  0.0000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3049  cytochrome C family protein  28.37 
 
 
2081 aa  57.4  0.000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1826  cytochrome C family protein  25.83 
 
 
1645 aa  57  0.000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2997  cytochrome C family protein  29.15 
 
 
455 aa  56.6  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.742851  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2903  cytochrome C family protein  28.69 
 
 
455 aa  56.2  0.000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.864697  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1156  hypothetical protein  39.34 
 
 
176 aa  51.2  0.00009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3544  cytochrome C family protein  23.94 
 
 
1106 aa  50.8  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3540  hypothetical protein  28.48 
 
 
1289 aa  50.8  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3565  hypothetical protein  24.08 
 
 
1110 aa  50.1  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1823  cytochrome C family protein  26.65 
 
 
1525 aa  49.7  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2888  hypothetical protein  25.74 
 
 
1294 aa  48.9  0.0004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3077  multihaem cytochrome  30.59 
 
 
1330 aa  47.8  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0215  multihaem cytochrome  25.25 
 
 
563 aa  47.4  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.354833  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2887  cytochrome c family protein  25.05 
 
 
884 aa  46.6  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0141387  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2763  cytochrome C family protein  29.05 
 
 
336 aa  46.2  0.003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.888791  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2762  cytochrome C family protein  25.2 
 
 
454 aa  45.8  0.004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3417  cytochrome C family protein  26.81 
 
 
939 aa  45.4  0.005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000650224  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3174  cytochrome C family protein  29.65 
 
 
1329 aa  44.7  0.007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.246364  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>