66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_3417 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_3417  cytochrome C family protein  100 
 
 		 939 aa  1896    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000650224  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1157  hypothetical protein  46.44 
 
 		 642 aa  381  1e-104  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3540  hypothetical protein  37.16 
 
 		 1289 aa  339  9.999999999999999e-92  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0500  cytochrome C family protein  32.73 
 
 		 1496 aa  321  3.9999999999999996e-86  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00446809  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0581  high-molecular-weight cytochrome c  34.84 
 
 		 2912 aa  256  1.0000000000000001e-66  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2898  high-molecular-weight cytochrome c  35.16 
 
 		 2803 aa  240  6.999999999999999e-62  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0075  cytochrome C family protein  33.16 
 
 		 2222 aa  233  1e-59  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0120  cytochrome C family protein  37.75 
 
 		 2026 aa  226  2e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.345457  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0076  cytochrome C family protein  31.28 
 
 		 1438 aa  222  3e-56  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0077  cytochrome C family protein  34.01 
 
 		 2499 aa  196  2e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0398  cytochrome C family protein  33.53 
 
 		 672 aa  115  5e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1198  cytochrome C family protein  28.64 
 
 		 1143 aa  90.9  1e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1152  cytochrome C family protein  34.43 
 
 		 1009 aa  87  0.000000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3563  cytochrome C family protein  29.95 
 
 		 1276 aa  87.4  0.000000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3564  cytochrome C family protein  27.99 
 
 		 955 aa  84.7  0.000000000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0571  cytochrome c family protein  29.14 
 
 		 1848 aa  83.2  0.00000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0576  hypothetical protein  35.62 
 
 		 1284 aa  74.7  0.000000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0498  cytochrome C family protein  35.68 
 
 		 1281 aa  74.7  0.000000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.618718  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0499  cytochrome C family protein  34.17 
 
 		 1379 aa  74.7  0.000000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00294186  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1834  cytochrome C family protein  30.32 
 
 		 1611 aa  74.3  0.000000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3541  hypothetical protein  26.91 
 
 		 1538 aa  73.9  0.00000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2884  cytochrome c family protein  25.71 
 
 		 1038 aa  74.3  0.00000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0575  cytochrome c family protein  28.13 
 
 		 1127 aa  73.2  0.00000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3543  cytochrome C family protein  26.33 
 
 		 957 aa  72.8  0.00000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3057  cytochrome C family protein  29.93 
 
 		 1017 aa  70.5  0.0000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2883  cytochrome c family protein  27.29 
 
 		 902 aa  70.9  0.0000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3052  cytochrome C family protein  25.97 
 
 		 1143 aa  70.1  0.0000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3470  cytochrome C family protein  29.47 
 
 		 958 aa  70.1  0.0000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1153  cytochrome C family protein  29.47 
 
 		 958 aa  70.1  0.0000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0558  cytochrome c family protein  26.34 
 
 		 1036 aa  69.7  0.0000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1193  cytochrome C family protein  29.25 
 
 		 1018 aa  70.1  0.0000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2815  cytochrome c like protein  32.57 
 
 		 457 aa  66.2  0.000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1826  cytochrome C family protein  30.29 
 
 		 1645 aa  65.5  0.000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0702  cytochrome c family protein  22.17 
 
 		 1916 aa  65.1  0.000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1155  hypothetical protein  26.4 
 
 		 1537 aa  63.9  0.00000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3268  cytochrome C family protein  27.9 
 
 		 1329 aa  62.4  0.00000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1823  cytochrome C family protein  30.08 
 
 		 1525 aa  61.6  0.00000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3561  Fibronectin type III domain protein  26.29 
 
 		 2178 aa  61.6  0.00000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2035  cytochrome C family protein  26.27 
 
 		 1596 aa  60.1  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3427  cytochrome C family protein  26.76 
 
 		 1457 aa  59.3  0.0000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.476422  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2869  cytochrome C family protein  26.61 
 
 		 1196 aa  58.9  0.0000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00106509  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2899  high-molecular-weight cytochrome c  25.66 
 
 		 979 aa  58.9  0.0000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2470  high-molecular-weight cytochrome c  23.92 
 
 		 1521 aa  58.9  0.0000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2882  cytochrome c family protein  29.62 
 
 		 688 aa  58.2  0.0000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3174  cytochrome C family protein  26.92 
 
 		 1329 aa  57.8  0.000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.246364  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3542  cytochrome C family protein  23.17 
 
 		 1453 aa  56.6  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1154  cytochrome C family protein  23.56 
 
 		 1454 aa  56.2  0.000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2997  cytochrome C family protein  28.44 
 
 		 455 aa  56.2  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.742851  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3724  cytochrome C family protein  25.23 
 
 		 1691 aa  55.5  0.000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0229  cytochrome C family protein  30.06 
 
 		 431 aa  55.1  0.000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.286914 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2903  cytochrome C family protein  33.61 
 
 		 455 aa  53.9  0.00001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.864697  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0215  multihaem cytochrome  33.33 
 
 		 563 aa  53.9  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.354833  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2762  cytochrome C family protein  28.88 
 
 		 454 aa  53.1  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0497  cytochrome C family protein  25.34 
 
 		 1053 aa  53.1  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0573  cytochrome C family protein  23.29 
 
 		 1672 aa  52.4  0.00004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2912  cytochrome c family protein  25.63 
 
 		 1046 aa  51.2  0.00008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.802585  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2998  cytochrome C family protein  28.44 
 
 		 655 aa  50.4  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2816  cytochrome c like protein  26.22 
 
 		 655 aa  50.4  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.16928  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2904  cytochrome C family protein  28.91 
 
 		 655 aa  49.7  0.0003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3426  cytochrome C family protein  25.82 
 
 		 901 aa  48.9  0.0004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.360069  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3428  cytochrome C family protein  28.07 
 
 		 1017 aa  48.5  0.0005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.624718  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3077  multihaem cytochrome  25.64 
 
 		 1330 aa  48.9  0.0005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0580  high-molecular-weight cytochrome c  27.24 
 
 		 869 aa  48.5  0.0005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3049  cytochrome C family protein  26.51 
 
 		 2081 aa  48.1  0.0007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1827  cytochrome C family protein  26.17 
 
 		 656 aa  47.8  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.287996  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6276  cytochrome C family protein  23.35 
 
 		 501 aa  45.1  0.007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.943991 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>