42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_1924 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_1924  cytochrome c family protein  100 
 
 		 270 aa  558  1e-158  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00050556  normal  0.656343 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1648  cytochrome c family protein  60.47 
 
 		 270 aa  329  4e-89  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2381  hypothetical protein  58.43 
 
 		 270 aa  317  2e-85  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.145583  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3175  cytochrome c family protein  53.28 
 
 		 266 aa  268  7e-71  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1086  cytochrome c family protein  52.72 
 
 		 266 aa  267  1e-70  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2713  cytochrome b subunit of formate dehydrogenase-like  32.39 
 
 		 658 aa  62.8  0.000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.151641  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0116  hypothetical protein  32.72 
 
 		 566 aa  61.2  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.7686  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0127  hypothetical protein  32.1 
 
 		 566 aa  59.3  0.00000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0109  hypothetical protein  32.52 
 
 		 571 aa  58.2  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0113  hypothetical protein  29.81 
 
 		 577 aa  53.9  0.000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.020056  normal  0.620455 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2603  cytochrome b subunit of formate dehydrogenase-like protein  35.42 
 
 		 729 aa  52.8  0.000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.18944  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0064  cytochrome c family protein  28.16 
 
 		 689 aa  49.3  0.00007  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1552  beta ketoacyl-acyl carrier protein synthase II  31.87 
 
 		 456 aa  47.4  0.0003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0467  hydroxylamine oxidase  33.7 
 
 		 464 aa  47  0.0003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0014  hypothetical protein  33.98 
 
 		 670 aa  46.6  0.0004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1404  cytochrome c family protein  32.77 
 
 		 655 aa  46.6  0.0005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.352447  normal  0.0404574 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2739  hypothetical protein  31.87 
 
 		 471 aa  46.2  0.0005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  unclonable  0.000000852444  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0983  hypothetical protein  33.64 
 
 		 425 aa  46.2  0.0005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.392669 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2203  cytochrome c family protein  29.05 
 
 		 363 aa  46.2  0.0006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2063  hypothetical protein  28.03 
 
 		 615 aa  45.8  0.0007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.97808  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0845  cytochrome b subunit of formate dehydrogenase-like protein  27.97 
 
 		 757 aa  45.8  0.0007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.763615  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3118  cytochrome C family protein  30.4 
 
 		 334 aa  45.8  0.0008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0300  hypothetical protein  25.95 
 
 		 461 aa  44.7  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.124376  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0240  formate-dependent nitrite reductase  28.28 
 
 		 157 aa  45.1  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1144  cytochrome C family protein  29.69 
 
 		 334 aa  44.7  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0434  hydroxylamine oxidase  31.11 
 
 		 455 aa  44.3  0.002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.000562853  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0594  cytochrome c family protein  32.26 
 
 		 349 aa  44.7  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.127637  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2731  polyheme membrane-associated cytochrome c  25.17 
 
 		 768 aa  43.9  0.003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.209433  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1805  cytochrome C family protein  26.54 
 
 		 346 aa  43.9  0.003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.126894  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3626  cytochrome C family protein  28.37 
 
 		 299 aa  43.1  0.004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0059  hypothetical protein  27.54 
 
 		 505 aa  43.1  0.004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.811122  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2928  cytochrome c family protein  26.14 
 
 		 350 aa  43.5  0.004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000703284  decreased coverage  2.01033e-17 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1402  cytochrome c family protein  28.28 
 
 		 316 aa  43.1  0.005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0676  multihaem cytochrome  29.03 
 
 		 359 aa  43.1  0.005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0689  multiheme cytochrome  29.03 
 
 		 359 aa  43.1  0.005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000324131 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0817  cytochrome C family protein  27.45 
 
 		 540 aa  42.7  0.006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3758  hypothetical protein  26.62 
 
 		 417 aa  42.7  0.007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1876  cytochrome C family protein  25.52 
 
 		 346 aa  42.4  0.008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0800  hydroxylamine oxidase  31.11 
 
 		 461 aa  42  0.009  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000000654333  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2002  cytochrome c family protein  25.52 
 
 		 346 aa  42.4  0.009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3639  cytochrome C family protein  30 
 
 		 353 aa  42  0.01  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0348181  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1961  cytochrome C family protein  25.52 
 
 		 346 aa  42  0.01  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.613696  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>