43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_3758 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_3758  hypothetical protein  100 
 
 		 417 aa  872    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0953  hydroxylamine oxidase  66.07 
 
 		 442 aa  559  1e-158  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0956  multihaem cytochrome  64.52 
 
 		 446 aa  543  1e-153  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0959  multiheme cytochrome  64.68 
 
 		 447 aa  540  9.999999999999999e-153  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3667  hypothetical protein  54.03 
 
 		 407 aa  421  1e-116  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000152326  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0142  hypothetical protein  49.63 
 
 		 413 aa  412  1e-114  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.611176  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1044  hypothetical protein  50.51 
 
 		 418 aa  411  1e-113  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000096075  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1628  hypothetical protein  28.77 
 
 		 436 aa  173  3.9999999999999995e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000975742  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0983  hypothetical protein  27.04 
 
 		 425 aa  165  1.0000000000000001e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.392669 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0467  hydroxylamine oxidase  27.75 
 
 		 464 aa  164  3e-39  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1552  beta ketoacyl-acyl carrier protein synthase II  29.91 
 
 		 456 aa  147  3e-34  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0059  hypothetical protein  29.27 
 
 		 505 aa  143  6e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.811122  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0434  hydroxylamine oxidase  28.41 
 
 		 455 aa  142  8e-33  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.000562853  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1634  hypothetical protein  25.74 
 
 		 463 aa  140  3.9999999999999997e-32  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000364247  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3025  hypothetical protein  26.67 
 
 		 489 aa  139  1e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0800  hydroxylamine oxidase  27.56 
 
 		 461 aa  138  2e-31  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000000654333  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2383  hypothetical protein  25.62 
 
 		 473 aa  133  6e-30  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4755  hypothetical protein  25.86 
 
 		 488 aa  125  1e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0308268  unclonable  0.0000000219309 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0956  hydroxylamine oxydoreductase  25.47 
 
 		 559 aa  125  2e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.157414  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0300  hypothetical protein  25.17 
 
 		 461 aa  123  5e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.124376  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4366  hypothetical protein  26.38 
 
 		 488 aa  121  3e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1764  hypothetical protein  30.77 
 
 		 535 aa  115  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2076  hypothetical protein  31.27 
 
 		 529 aa  115  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.616227  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0550  hypothetical protein  26.14 
 
 		 487 aa  113  6e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000169921  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2170  hypothetical protein  31.27 
 
 		 528 aa  110  6e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.355183  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0892  hydroxylamine oxidase  23.68 
 
 		 580 aa  104  4e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0707349  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0805  hydroxylamine oxidase  24.95 
 
 		 570 aa  103  4e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1082  hydroxylamine oxidase  24.95 
 
 		 570 aa  103  4e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00172641  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2662  hydroxylamine oxidase  24.95 
 
 		 570 aa  103  4e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.0000630744  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1248  hydroxylamine oxidase  24.3 
 
 		 496 aa  90.1  7e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0152054  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2550  hydroxylamine oxidase  22.56 
 
 		 511 aa  88.6  2e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0217  hydroxylamine oxidase  23.47 
 
 		 520 aa  77.4  0.0000000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0030  hypothetical protein  29.2 
 
 		 405 aa  60.1  0.00000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1837  cytochrome C family protein  33.1 
 
 		 429 aa  53.9  0.000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3175  cytochrome c family protein  27.54 
 
 		 266 aa  46.6  0.0007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1086  cytochrome c family protein  25.75 
 
 		 266 aa  46.6  0.0008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1762  hypothetical protein  21.74 
 
 		 305 aa  45.1  0.003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1588  cytochrome C family protein  28.41 
 
 		 333 aa  44.3  0.005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00373932  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2748  hypothetical protein  24.6 
 
 		 1601 aa  43.9  0.005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2766  cytochrome C family protein  28.41 
 
 		 333 aa  43.5  0.007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0218266  hitchhiker  0.000000422231 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1577  cytochrome C family protein  28.41 
 
 		 333 aa  43.5  0.007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000354628  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1611  cytochrome C family protein  28.41 
 
 		 333 aa  43.5  0.007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.173927  normal  0.248798 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2677  cytochrome C family protein  28.34 
 
 		 329 aa  43.1  0.008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.376662  normal  0.0163011 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>