32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA0956 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002977  MCA0956  hydroxylamine oxydoreductase  100 
 
 
559 aa  1176    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.157414  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0892  hydroxylamine oxidase  56.02 
 
 
580 aa  555  1e-157  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0707349  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0805  hydroxylamine oxidase  52.7 
 
 
570 aa  528  1e-149  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1082  hydroxylamine oxidase  52.7 
 
 
570 aa  528  1e-149  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00172641  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2662  hydroxylamine oxidase  52.7 
 
 
570 aa  528  1e-149  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.0000630744  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1628  hypothetical protein  26.9 
 
 
436 aa  139  2e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000975742  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0983  hypothetical protein  27.51 
 
 
425 aa  130  4.0000000000000003e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.392669 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3758  hypothetical protein  25.41 
 
 
417 aa  127  6e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0953  hydroxylamine oxidase  28.64 
 
 
442 aa  125  1e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3667  hypothetical protein  27.01 
 
 
407 aa  123  9.999999999999999e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000152326  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0956  multihaem cytochrome  26.91 
 
 
446 aa  115  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0959  multiheme cytochrome  26.72 
 
 
447 aa  114  5e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0467  hydroxylamine oxidase  23.87 
 
 
464 aa  113  7.000000000000001e-24  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0142  hypothetical protein  24.4 
 
 
413 aa  110  6e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.611176  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1044  hypothetical protein  26.62 
 
 
418 aa  98.6  3e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000096075  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1552  beta ketoacyl-acyl carrier protein synthase II  23.16 
 
 
456 aa  91.7  3e-17  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1634  hypothetical protein  25.19 
 
 
463 aa  91.3  4e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000364247  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0550  hypothetical protein  26.27 
 
 
487 aa  91.3  5e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000169921  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0800  hydroxylamine oxidase  24.63 
 
 
461 aa  90.9  6e-17  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000000654333  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2383  hypothetical protein  23.59 
 
 
473 aa  90.5  8e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4755  hypothetical protein  27.47 
 
 
488 aa  85.1  0.000000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0308268  unclonable  0.0000000219309 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2550  hydroxylamine oxidase  27.01 
 
 
511 aa  85.1  0.000000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0300  hypothetical protein  23.63 
 
 
461 aa  85.1  0.000000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.124376  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0434  hydroxylamine oxidase  23.59 
 
 
455 aa  84.3  0.000000000000006  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.000562853  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1764  hypothetical protein  30.11 
 
 
535 aa  83.6  0.000000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2076  hypothetical protein  30.11 
 
 
529 aa  82.8  0.00000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.616227  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2170  hypothetical protein  29.57 
 
 
528 aa  80.1  0.00000000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.355183  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4366  hypothetical protein  26 
 
 
488 aa  80.1  0.0000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0059  hypothetical protein  37.96 
 
 
505 aa  79.7  0.0000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.811122  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1248  hydroxylamine oxidase  24.46 
 
 
496 aa  79  0.0000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0152054  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0217  hydroxylamine oxidase  27.36 
 
 
520 aa  72.4  0.00000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3025  hypothetical protein  23.67 
 
 
489 aa  66.2  0.000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>