47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_0142 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_0142  hypothetical protein  100 
 
 		 413 aa  860    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.611176  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3667  hypothetical protein  57.11 
 
 		 407 aa  452  1.0000000000000001e-126  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000152326  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0959  multiheme cytochrome  50.78 
 
 		 447 aa  416  9.999999999999999e-116  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0956  multihaem cytochrome  51.04 
 
 		 446 aa  417  9.999999999999999e-116  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1044  hypothetical protein  51.03 
 
 		 418 aa  414  1e-114  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000096075  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0953  hydroxylamine oxidase  49.37 
 
 		 442 aa  410  1e-113  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3758  hypothetical protein  50.77 
 
 		 417 aa  410  1e-113  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1628  hypothetical protein  30.13 
 
 		 436 aa  181  2e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000975742  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0983  hypothetical protein  30.07 
 
 		 425 aa  173  3.9999999999999995e-42  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.392669 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0467  hydroxylamine oxidase  26.53 
 
 		 464 aa  138  1e-31  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0300  hypothetical protein  28.28 
 
 		 461 aa  137  4e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.124376  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1552  beta ketoacyl-acyl carrier protein synthase II  27.07 
 
 		 456 aa  137  5e-31  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1634  hypothetical protein  28.34 
 
 		 463 aa  133  6e-30  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000364247  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0059  hypothetical protein  28.21 
 
 		 505 aa  132  1.0000000000000001e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.811122  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0800  hydroxylamine oxidase  25.81 
 
 		 461 aa  131  2.0000000000000002e-29  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000000654333  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0434  hydroxylamine oxidase  26.45 
 
 		 455 aa  130  5.0000000000000004e-29  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.000562853  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2383  hypothetical protein  26.34 
 
 		 473 aa  129  9.000000000000001e-29  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4755  hypothetical protein  27.05 
 
 		 488 aa  127  4.0000000000000003e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0308268  unclonable  0.0000000219309 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3025  hypothetical protein  28.71 
 
 		 489 aa  125  2e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4366  hypothetical protein  26.97 
 
 		 488 aa  119  9.999999999999999e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0956  hydroxylamine oxydoreductase  24.4 
 
 		 559 aa  110  5e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.157414  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2076  hypothetical protein  30.62 
 
 		 529 aa  107  3e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.616227  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1764  hypothetical protein  31.03 
 
 		 535 aa  107  3e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2170  hypothetical protein  30.62 
 
 		 528 aa  106  7e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.355183  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0892  hydroxylamine oxidase  23.86 
 
 		 580 aa  100  6e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0707349  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2550  hydroxylamine oxidase  22.92 
 
 		 511 aa  97.8  3e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0550  hypothetical protein  25.84 
 
 		 487 aa  94.7  3e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000169921  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2662  hydroxylamine oxidase  24.33 
 
 		 570 aa  87  6e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.0000630744  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1082  hydroxylamine oxidase  24.33 
 
 		 570 aa  87  6e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00172641  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0805  hydroxylamine oxidase  24.33 
 
 		 570 aa  87  6e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1248  hydroxylamine oxidase  22.17 
 
 		 496 aa  82  0.00000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0152054  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0217  hydroxylamine oxidase  23.25 
 
 		 520 aa  65.9  0.000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1762  hypothetical protein  24.87 
 
 		 305 aa  55.5  0.000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0598  PKD  26.17 
 
 		 806 aa  55.5  0.000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00146483  normal  0.752324 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1402  double CXXCH motif-containing protein  29.2 
 
 		 317 aa  55.1  0.000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0638375 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0600  PKD  25.45 
 
 		 712 aa  53.9  0.000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000134554  normal  0.252595 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2887  cytochrome c family protein  23.76 
 
 		 884 aa  53.5  0.000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0141387  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2603  cytochrome b subunit of formate dehydrogenase-like protein  23.86 
 
 		 729 aa  51.6  0.00002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.18944  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2739  hypothetical protein  25.67 
 
 		 471 aa  49.7  0.00009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  unclonable  0.000000852444  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1744  cytochrome c family protein  26.91 
 
 		 337 aa  45.4  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.740978 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1710  cytochrome c family protein  28.87 
 
 		 490 aa  44.7  0.003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00235547  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2748  hypothetical protein  21.76 
 
 		 1601 aa  44.7  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2495  cytochrome c family protein  26.63 
 
 		 646 aa  45.1  0.003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1809  hypothetical protein  26.23 
 
 		 171 aa  44.3  0.004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0786634  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3544  cytochrome C family protein  21.88 
 
 		 1106 aa  44.3  0.004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3518  cytochrome C family protein  22.26 
 
 		 331 aa  43.1  0.009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000517887 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2881  hypothetical protein  32.26 
 
 		 578 aa  43.1  0.009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>