30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_1710 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008609  Ppro_0867  cytochrome c family protein  61.63 
 
 		 485 aa  664    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.473652  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1710  cytochrome c family protein  100 
 
 		 490 aa  1025    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00235547  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2801  cytochrome c family protein  65.21 
 
 		 488 aa  655    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.885444  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0679  cytochrome c family protein  59.5 
 
 		 490 aa  629  1e-179  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1643  cytochrome c family protein  36.85 
 
 		 467 aa  255  2.0000000000000002e-66  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2376  hypothetical protein  31.16 
 
 		 457 aa  192  1e-47  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0331555  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2087  hypothetical protein  31.54 
 
 		 442 aa  192  1e-47  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000422239  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4639  hypothetical protein  27.84 
 
 		 536 aa  117  3.9999999999999997e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1584  hypothetical protein  24.48 
 
 		 595 aa  111  3e-23  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1439  hypothetical protein  24.72 
 
 		 663 aa  105  2e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1754  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.64 
 
 		 906 aa  95.5  2e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.255136  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3444  hypothetical protein  26.63 
 
 		 459 aa  94  6e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.166801  normal  0.529515 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1683  TPR repeat-containing protein  24.22 
 
 		 942 aa  91.7  2e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.354598 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0271  hypothetical protein  25.07 
 
 		 635 aa  91.7  2e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6647  Tetratricopeptide TPR_4  23.81 
 
 		 739 aa  87.4  6e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00102839 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1691  hypothetical protein  23.1 
 
 		 406 aa  79.7  0.0000000000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1063  hypothetical protein  24.04 
 
 		 640 aa  78.6  0.0000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000914446  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2276  hypothetical protein  21.93 
 
 		 735 aa  77  0.0000000000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1692  hypothetical protein  23.98 
 
 		 392 aa  65.1  0.000000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1880  hypothetical protein  25.73 
 
 		 934 aa  63.5  0.000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.983245 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2674  hypothetical protein  25.73 
 
 		 412 aa  62.4  0.00000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0789864  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6394  hypothetical protein  22.59 
 
 		 687 aa  58.9  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0069  hypothetical protein  22.51 
 
 		 434 aa  50.8  0.00005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1762  hypothetical protein  23.78 
 
 		 305 aa  48.9  0.0002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0999  hypothetical protein  24.1 
 
 		 368 aa  47.8  0.0005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1172  cytochrome c family protein  23.32 
 
 		 320 aa  47.4  0.0006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00131961  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1201  hypothetical protein  22.73 
 
 		 321 aa  46.6  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0142  hypothetical protein  28.87 
 
 		 413 aa  44.7  0.004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.611176  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3059  hypothetical protein  23.99 
 
 		 386 aa  43.9  0.006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2450  hypothetical protein  28.05 
 
 		 408 aa  43.5  0.008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>