38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_4755 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_4755  hypothetical protein  100 
 
 		 488 aa  1030    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0308268  unclonable  0.0000000219309 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4366  hypothetical protein  95.08 
 
 		 488 aa  989    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0550  hypothetical protein  53.32 
 
 		 487 aa  511  1e-143  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000169921  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0059  hypothetical protein  47.53 
 
 		 505 aa  463  1e-129  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.811122  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2076  hypothetical protein  47.67 
 
 		 529 aa  453  1.0000000000000001e-126  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.616227  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1764  hypothetical protein  47.85 
 
 		 535 aa  450  1e-125  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2170  hypothetical protein  47.07 
 
 		 528 aa  443  1e-123  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.355183  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3025  hypothetical protein  47.27 
 
 		 489 aa  443  1e-123  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0300  hypothetical protein  40.88 
 
 		 461 aa  330  2e-89  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.124376  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0467  hydroxylamine oxidase  42.89 
 
 		 464 aa  325  1e-87  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1634  hypothetical protein  38.32 
 
 		 463 aa  323  6e-87  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000364247  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2383  hypothetical protein  38.79 
 
 		 473 aa  311  2e-83  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0800  hydroxylamine oxidase  37.56 
 
 		 461 aa  290  6e-77  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000000654333  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0434  hydroxylamine oxidase  38.9 
 
 		 455 aa  285  1.0000000000000001e-75  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.000562853  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1552  beta ketoacyl-acyl carrier protein synthase II  37.01 
 
 		 456 aa  280  4e-74  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2550  hydroxylamine oxidase  32.58 
 
 		 511 aa  201  3e-50  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0217  hydroxylamine oxidase  28.15 
 
 		 520 aa  192  2e-47  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1248  hydroxylamine oxidase  29.41 
 
 		 496 aa  172  2e-41  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0152054  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0956  multihaem cytochrome  30.17 
 
 		 446 aa  144  3e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0959  multiheme cytochrome  29.45 
 
 		 447 aa  144  3e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0953  hydroxylamine oxidase  29.06 
 
 		 442 aa  143  8e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0142  hypothetical protein  27.05 
 
 		 413 aa  127  5e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.611176  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3758  hypothetical protein  25.86 
 
 		 417 aa  124  3e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3667  hypothetical protein  27.36 
 
 		 407 aa  119  1.9999999999999998e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000152326  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0983  hypothetical protein  27.92 
 
 		 425 aa  107  5e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.392669 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1628  hypothetical protein  24.83 
 
 		 436 aa  101  3e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000975742  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1044  hypothetical protein  23.83 
 
 		 418 aa  95.9  1e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000096075  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1082  hydroxylamine oxidase  26.96 
 
 		 570 aa  91.3  4e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00172641  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0805  hydroxylamine oxidase  26.96 
 
 		 570 aa  91.3  4e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2662  hydroxylamine oxidase  26.96 
 
 		 570 aa  91.3  4e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.0000630744  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0892  hydroxylamine oxidase  29.89 
 
 		 580 aa  85.1  0.000000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0707349  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0956  hydroxylamine oxydoreductase  27.47 
 
 		 559 aa  84.7  0.000000000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.157414  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2748  hypothetical protein  24.23 
 
 		 1601 aa  49.7  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2063  hypothetical protein  24.04 
 
 		 615 aa  46.6  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.97808  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2887  cytochrome c family protein  23.95 
 
 		 884 aa  46.6  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0141387  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0109  hypothetical protein  24.51 
 
 		 571 aa  46.6  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1530  cytochrome c family protein  23.62 
 
 		 321 aa  43.9  0.007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.892773  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0116  hypothetical protein  24.9 
 
 		 566 aa  43.5  0.009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.7686  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>