44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_0300 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013223  Dret_2383  hypothetical protein  72.93 
 
 		 473 aa  722    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1634  hypothetical protein  69.7 
 
 		 463 aa  696    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000364247  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0300  hypothetical protein  100 
 
 		 461 aa  973    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.124376  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4366  hypothetical protein  41.8 
 
 		 488 aa  335  7.999999999999999e-91  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4755  hypothetical protein  40.88 
 
 		 488 aa  330  2e-89  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0308268  unclonable  0.0000000219309 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3025  hypothetical protein  39.78 
 
 		 489 aa  322  7e-87  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0059  hypothetical protein  38.82 
 
 		 505 aa  322  9.999999999999999e-87  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.811122  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0467  hydroxylamine oxidase  44.5 
 
 		 464 aa  319  7.999999999999999e-86  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0434  hydroxylamine oxidase  38.74 
 
 		 455 aa  311  2e-83  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.000562853  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0800  hydroxylamine oxidase  38.33 
 
 		 461 aa  308  1.0000000000000001e-82  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000000654333  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1552  beta ketoacyl-acyl carrier protein synthase II  38.16 
 
 		 456 aa  300  3e-80  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2076  hypothetical protein  38.65 
 
 		 529 aa  300  4e-80  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.616227  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2170  hypothetical protein  37.61 
 
 		 528 aa  293  3e-78  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.355183  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1764  hypothetical protein  37.97 
 
 		 535 aa  291  1e-77  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0550  hypothetical protein  36.84 
 
 		 487 aa  290  3e-77  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000169921  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2550  hydroxylamine oxidase  31.36 
 
 		 511 aa  211  3e-53  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1248  hydroxylamine oxidase  30.75 
 
 		 496 aa  204  2e-51  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0152054  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0217  hydroxylamine oxidase  28.19 
 
 		 520 aa  183  6e-45  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3667  hypothetical protein  27.21 
 
 		 407 aa  139  1e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000152326  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0142  hypothetical protein  28.28 
 
 		 413 aa  137  4e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.611176  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0953  hydroxylamine oxidase  27.31 
 
 		 442 aa  127  3e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0956  multihaem cytochrome  28.1 
 
 		 446 aa  125  1e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0959  multiheme cytochrome  28.03 
 
 		 447 aa  125  2e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3758  hypothetical protein  25.17 
 
 		 417 aa  123  6e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1044  hypothetical protein  24.94 
 
 		 418 aa  117  3e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000096075  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1628  hypothetical protein  25.75 
 
 		 436 aa  112  1.0000000000000001e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000975742  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0983  hypothetical protein  25.44 
 
 		 425 aa  112  2.0000000000000002e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.392669 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0892  hydroxylamine oxidase  26.36 
 
 		 580 aa  98.6  2e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0707349  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0805  hydroxylamine oxidase  23.73 
 
 		 570 aa  94  5e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2662  hydroxylamine oxidase  23.73 
 
 		 570 aa  94  5e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.0000630744  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1082  hydroxylamine oxidase  23.73 
 
 		 570 aa  94  5e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00172641  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0956  hydroxylamine oxydoreductase  23.63 
 
 		 559 aa  85.1  0.000000000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.157414  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0113  hypothetical protein  24.14 
 
 		 577 aa  54.7  0.000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.020056  normal  0.620455 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1402  double CXXCH motif-containing protein  24.73 
 
 		 317 aa  51.6  0.00003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0638375 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2713  cytochrome b subunit of formate dehydrogenase-like  26.61 
 
 		 658 aa  50.4  0.00006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.151641  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2748  hypothetical protein  26.54 
 
 		 1601 aa  48.5  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0109  hypothetical protein  23.91 
 
 		 571 aa  47.8  0.0004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0116  hypothetical protein  23.27 
 
 		 566 aa  47.4  0.0006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.7686  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0127  hypothetical protein  23.83 
 
 		 566 aa  47  0.0008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1924  cytochrome c family protein  25.95 
 
 		 270 aa  44.7  0.003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00050556  normal  0.656343 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3175  cytochrome c family protein  25.87 
 
 		 266 aa  44.7  0.003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2869  cytochrome C family protein  24.38 
 
 		 1196 aa  44.3  0.004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00106509  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2180  hypothetical protein  30.4 
 
 		 346 aa  43.9  0.005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1648  cytochrome c family protein  28.06 
 
 		 270 aa  43.5  0.008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>