33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU1648 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU1648  cytochrome c family protein  100 
 
 		 270 aa  555  1e-157  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1924  cytochrome c family protein  63.29 
 
 		 270 aa  306  3e-82  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00050556  normal  0.656343 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2381  hypothetical protein  55.56 
 
 		 270 aa  301  1e-80  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.145583  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1086  cytochrome c family protein  55.46 
 
 		 266 aa  276  2e-73  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3175  cytochrome c family protein  55.93 
 
 		 266 aa  275  8e-73  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2713  cytochrome b subunit of formate dehydrogenase-like  29.45 
 
 		 658 aa  61.2  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.151641  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2603  cytochrome b subunit of formate dehydrogenase-like protein  27.45 
 
 		 729 aa  52  0.00001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.18944  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0113  hypothetical protein  29.79 
 
 		 577 aa  51.6  0.00001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.020056  normal  0.620455 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0116  hypothetical protein  31.78 
 
 		 566 aa  49.3  0.00006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.7686  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2731  polyheme membrane-associated cytochrome c  26.12 
 
 		 768 aa  48.9  0.00009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.209433  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0064  cytochrome c family protein  30.39 
 
 		 689 aa  48.1  0.0001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0127  hypothetical protein  31.01 
 
 		 566 aa  47.4  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1552  beta ketoacyl-acyl carrier protein synthase II  30.21 
 
 		 456 aa  47  0.0003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2739  hypothetical protein  28.74 
 
 		 471 aa  47  0.0004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  unclonable  0.000000852444  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1404  cytochrome c family protein  34.02 
 
 		 655 aa  47  0.0004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.352447  normal  0.0404574 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0983  hypothetical protein  30.83 
 
 		 425 aa  46.2  0.0006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.392669 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0109  hypothetical protein  31.01 
 
 		 571 aa  46.2  0.0006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0467  hydroxylamine oxidase  35.11 
 
 		 464 aa  45.4  0.0009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0059  hypothetical protein  30.4 
 
 		 505 aa  45.1  0.001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.811122  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3379  polyheme membrane-associated cytochrome c  32.69 
 
 		 789 aa  45.1  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.675442  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3926  hypothetical protein  28.91 
 
 		 211 aa  44.3  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3540  hypothetical protein  28.79 
 
 		 1289 aa  44.3  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3118  cytochrome C family protein  30.09 
 
 		 334 aa  43.9  0.003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0434  hydroxylamine oxidase  29.47 
 
 		 455 aa  43.9  0.003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.000562853  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0014  hypothetical protein  32.32 
 
 		 670 aa  43.9  0.003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1144  cytochrome C family protein  29.85 
 
 		 334 aa  43.5  0.004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0551  cytochrome c family protein  34.02 
 
 		 688 aa  43.5  0.004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0762772  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0300  hypothetical protein  28.06 
 
 		 461 aa  43.5  0.004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.124376  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0817  cytochrome C family protein  29.01 
 
 		 540 aa  43.1  0.005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0845  cytochrome b subunit of formate dehydrogenase-like protein  29.41 
 
 		 757 aa  43.1  0.005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.763615  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0867  polyheme membrane-associated cytochrome c  32.69 
 
 		 783 aa  43.1  0.005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3626  cytochrome C family protein  27.34 
 
 		 299 aa  42.4  0.008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3639  cytochrome C family protein  28.81 
 
 		 353 aa  42  0.01  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0348181  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>