44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene AnaeK_0116 on replicon NC_011145
Organism: Anaeromyxobacter sp. K



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011145  AnaeK_0116  hypothetical protein  100 
 
 
566 aa  1161    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.7686  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0113  hypothetical protein  74.77 
 
 
577 aa  852    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.020056  normal  0.620455 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0127  hypothetical protein  98.41 
 
 
566 aa  1150    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0109  hypothetical protein  97.87 
 
 
571 aa  1108    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2713  cytochrome b subunit of formate dehydrogenase-like  30.66 
 
 
658 aa  248  2e-64  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.151641  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4073  cytochrome c family protein  29.26 
 
 
662 aa  231  3e-59  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0014  hypothetical protein  26.94 
 
 
670 aa  230  4e-59  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2063  hypothetical protein  30.21 
 
 
615 aa  220  5e-56  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.97808  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0064  cytochrome c family protein  28.95 
 
 
689 aa  216  9.999999999999999e-55  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0845  cytochrome b subunit of formate dehydrogenase-like protein  29.9 
 
 
757 aa  213  9e-54  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.763615  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0274  cytochrome c family protein  28.26 
 
 
619 aa  210  4e-53  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00552346  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0077  hypothetical protein  29.98 
 
 
616 aa  207  5e-52  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.09082e-34 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0551  cytochrome c family protein  27.01 
 
 
688 aa  206  1e-51  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0762772  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0095  hypothetical protein  29.81 
 
 
616 aa  206  1e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00000209926  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0125  hypothetical protein  27.9 
 
 
618 aa  206  1e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000548778  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0100  cytochrome c family protein  29.26 
 
 
618 aa  201  3e-50  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000214934  normal  0.444755 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0807  cytochrome c family protein  27.83 
 
 
688 aa  198  2.0000000000000003e-49  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3925  hypothetical protein  42.41 
 
 
236 aa  186  1.0000000000000001e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1404  cytochrome c family protein  29.23 
 
 
655 aa  184  5.0000000000000004e-45  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.352447  normal  0.0404574 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2603  cytochrome b subunit of formate dehydrogenase-like protein  27.64 
 
 
729 aa  175  1.9999999999999998e-42  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.18944  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2001  deca-heme C-type cytochrome-like  37.27 
 
 
241 aa  156  1e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1877  deca-heme C-type cytochrome-like protein  37.27 
 
 
241 aa  156  1e-36  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.14633  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1962  deca-heme C-type cytochrome-like protein  37.27 
 
 
241 aa  156  1e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.282752  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1806  deca-heme C-type cytochrome-like protein  34.09 
 
 
247 aa  143  9e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.655576  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2002  cytochrome c family protein  28.57 
 
 
346 aa  87.4  6e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1961  cytochrome C family protein  28.57 
 
 
346 aa  87.4  7e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.613696  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1876  cytochrome C family protein  28.57 
 
 
346 aa  87  8e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1805  cytochrome C family protein  27.8 
 
 
346 aa  84.3  0.000000000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.126894  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3926  hypothetical protein  26.27 
 
 
211 aa  79  0.0000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1924  cytochrome c family protein  32.72 
 
 
270 aa  59.3  0.0000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00050556  normal  0.656343 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3025  hypothetical protein  27.05 
 
 
489 aa  58.5  0.0000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0300  hypothetical protein  24.66 
 
 
461 aa  52.4  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.124376  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1648  cytochrome c family protein  31.78 
 
 
270 aa  49.7  0.0001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2383  hypothetical protein  23.1 
 
 
473 aa  48.1  0.0005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2381  hypothetical protein  26.82 
 
 
270 aa  47.4  0.0008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.145583  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2739  hypothetical protein  26.3 
 
 
471 aa  46.2  0.001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  unclonable  0.000000852444  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1744  cytochrome c family protein  26.64 
 
 
337 aa  46.6  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.740978 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3372  hypothetical protein  27.78 
 
 
206 aa  46.2  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.356958  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4366  hypothetical protein  25.47 
 
 
488 aa  45.1  0.004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4755  hypothetical protein  25.09 
 
 
488 aa  44.7  0.005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0308268  unclonable  0.0000000219309 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1086  cytochrome c family protein  29.75 
 
 
266 aa  44.7  0.005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3601  hypothetical protein  25 
 
 
206 aa  44.7  0.005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.894877  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0431  flavodoxin domain-containing protein  27.42 
 
 
883 aa  43.9  0.007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0059  hypothetical protein  24.92 
 
 
505 aa  43.9  0.009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.811122  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>