38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCC13826_1552 on replicon NC_009802
Organism: Campylobacter concisus 13826



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009802  CCC13826_1552  beta ketoacyl-acyl carrier protein synthase II  100 
 
 
456 aa  957    Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0434  hydroxylamine oxidase  85.24 
 
 
455 aa  829    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.000562853  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0800  hydroxylamine oxidase  60.34 
 
 
461 aa  598  1e-170  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000000654333  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1634  hypothetical protein  36.34 
 
 
463 aa  300  3e-80  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000364247  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0300  hypothetical protein  38.16 
 
 
461 aa  300  3e-80  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.124376  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2383  hypothetical protein  35.08 
 
 
473 aa  293  5e-78  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4755  hypothetical protein  37.01 
 
 
488 aa  280  3e-74  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0308268  unclonable  0.0000000219309 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0467  hydroxylamine oxidase  36.45 
 
 
464 aa  279  9e-74  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4366  hypothetical protein  36.05 
 
 
488 aa  277  3e-73  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0059  hypothetical protein  35.23 
 
 
505 aa  269  8e-71  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.811122  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3025  hypothetical protein  35.84 
 
 
489 aa  258  1e-67  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0550  hypothetical protein  36.03 
 
 
487 aa  248  1e-64  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000169921  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2076  hypothetical protein  32.13 
 
 
529 aa  221  1.9999999999999999e-56  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.616227  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2170  hypothetical protein  32.37 
 
 
528 aa  219  7e-56  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.355183  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1764  hypothetical protein  31.83 
 
 
535 aa  215  9.999999999999999e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2550  hydroxylamine oxidase  30.15 
 
 
511 aa  192  1e-47  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1248  hydroxylamine oxidase  30.74 
 
 
496 aa  191  2e-47  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0152054  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0217  hydroxylamine oxidase  26.52 
 
 
520 aa  178  1e-43  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0959  multiheme cytochrome  28.86 
 
 
447 aa  155  1e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0956  multihaem cytochrome  29.09 
 
 
446 aa  155  1e-36  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3758  hypothetical protein  29.91 
 
 
417 aa  147  4.0000000000000006e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0142  hypothetical protein  27.07 
 
 
413 aa  137  6.0000000000000005e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.611176  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0953  hydroxylamine oxidase  27.17 
 
 
442 aa  134  3e-30  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3667  hypothetical protein  28.17 
 
 
407 aa  128  2.0000000000000002e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000152326  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1628  hypothetical protein  25.22 
 
 
436 aa  119  9.999999999999999e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000975742  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0983  hypothetical protein  25.58 
 
 
425 aa  118  1.9999999999999998e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.392669 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1044  hypothetical protein  25 
 
 
418 aa  111  2.0000000000000002e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000096075  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0956  hydroxylamine oxydoreductase  23.16 
 
 
559 aa  92.4  2e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.157414  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1082  hydroxylamine oxidase  24.25 
 
 
570 aa  89.7  1e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00172641  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2662  hydroxylamine oxidase  24.25 
 
 
570 aa  89.7  1e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.0000630744  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0805  hydroxylamine oxidase  24.25 
 
 
570 aa  89.7  1e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0892  hydroxylamine oxidase  22.88 
 
 
580 aa  77  0.0000000000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0707349  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2381  hypothetical protein  31.87 
 
 
270 aa  48.1  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.145583  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1648  cytochrome c family protein  30.21 
 
 
270 aa  47  0.0007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1924  cytochrome c family protein  31.87 
 
 
270 aa  46.2  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00050556  normal  0.656343 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0959  hypothetical protein  30.26 
 
 
130 aa  45.1  0.003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0845  cytochrome b subunit of formate dehydrogenase-like protein  24.56 
 
 
757 aa  45.1  0.003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.763615  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0807  cytochrome c family protein  24.06 
 
 
688 aa  44.3  0.005  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>