49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_0550 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008576  Mmc1_0550  hypothetical protein  100 
 
 		 487 aa  1027    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000169921  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4755  hypothetical protein  53.32 
 
 		 488 aa  522  1e-147  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0308268  unclonable  0.0000000219309 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4366  hypothetical protein  52.78 
 
 		 488 aa  523  1e-147  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3025  hypothetical protein  43.66 
 
 		 489 aa  401  9.999999999999999e-111  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0059  hypothetical protein  42.6 
 
 		 505 aa  385  1e-106  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.811122  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2076  hypothetical protein  41.36 
 
 		 529 aa  378  1e-103  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.616227  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1764  hypothetical protein  41.67 
 
 		 535 aa  376  1e-103  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2170  hypothetical protein  40.9 
 
 		 528 aa  363  4e-99  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.355183  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0467  hydroxylamine oxidase  42.82 
 
 		 464 aa  296  7e-79  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1634  hypothetical protein  35.24 
 
 		 463 aa  294  2e-78  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000364247  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0300  hypothetical protein  36.84 
 
 		 461 aa  291  2e-77  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.124376  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2383  hypothetical protein  36.04 
 
 		 473 aa  286  8e-76  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0800  hydroxylamine oxidase  36.47 
 
 		 461 aa  256  7e-67  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000000654333  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0434  hydroxylamine oxidase  35.21 
 
 		 455 aa  251  2e-65  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.000562853  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1552  beta ketoacyl-acyl carrier protein synthase II  35.43 
 
 		 456 aa  248  1e-64  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2550  hydroxylamine oxidase  27.66 
 
 		 511 aa  175  9.999999999999999e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0217  hydroxylamine oxidase  27.81 
 
 		 520 aa  169  1e-40  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1248  hydroxylamine oxidase  27.06 
 
 		 496 aa  167  2.9999999999999998e-40  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0152054  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0959  multiheme cytochrome  27.67 
 
 		 447 aa  115  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0956  multihaem cytochrome  27.67 
 
 		 446 aa  115  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3758  hypothetical protein  25.84 
 
 		 417 aa  114  4.0000000000000004e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0953  hydroxylamine oxidase  26.33 
 
 		 442 aa  109  9.000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0142  hypothetical protein  25.84 
 
 		 413 aa  95.1  3e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.611176  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1628  hypothetical protein  24.64 
 
 		 436 aa  94.4  4e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000975742  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0892  hydroxylamine oxidase  32.02 
 
 		 580 aa  92  2e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0707349  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0956  hydroxylamine oxydoreductase  26.27 
 
 		 559 aa  91.3  4e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.157414  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3667  hypothetical protein  26.21 
 
 		 407 aa  91.3  4e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000152326  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0805  hydroxylamine oxidase  31.02 
 
 		 570 aa  89  2e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1082  hydroxylamine oxidase  31.02 
 
 		 570 aa  89  2e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00172641  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2662  hydroxylamine oxidase  31.02 
 
 		 570 aa  89  2e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.0000630744  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1044  hypothetical protein  23.16 
 
 		 418 aa  88.2  3e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000096075  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0983  hypothetical protein  24.08 
 
 		 425 aa  87.4  5e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.392669 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0551  cytochrome c family protein  23.86 
 
 		 688 aa  50.8  0.00005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0762772  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1402  double CXXCH motif-containing protein  27.75 
 
 		 317 aa  48.9  0.0002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0638375 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2063  hypothetical protein  27.91 
 
 		 615 aa  48.9  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.97808  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2766  cytochrome C family protein  24.74 
 
 		 333 aa  48.1  0.0003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0218266  hitchhiker  0.000000422231 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1577  cytochrome C family protein  24.74 
 
 		 333 aa  48.5  0.0003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000354628  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1611  cytochrome C family protein  24.74 
 
 		 333 aa  48.5  0.0003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.173927  normal  0.248798 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1588  cytochrome C family protein  24.74 
 
 		 333 aa  48.1  0.0003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00373932  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4082  hypothetical protein  26.2 
 
 		 307 aa  47  0.0007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0556738  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2677  cytochrome C family protein  24.21 
 
 		 329 aa  47  0.0009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.376662  normal  0.0163011 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3126  cytochrome C family protein  21.93 
 
 		 333 aa  46.6  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00631921  hitchhiker  0.0000243395 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1524  cytochrome c family protein  22.03 
 
 		 333 aa  45.8  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.462693  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2526  cytochrome C family protein  21.57 
 
 		 329 aa  45.4  0.002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2579  cytochrome C family protein  24.21 
 
 		 329 aa  45.8  0.002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.069167  normal  0.0206665 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2511  cytochrome C family protein  24.21 
 
 		 329 aa  45.8  0.002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.115309  hitchhiker  0.00672893 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1777  decaheme cytochrome c MtrA  24.21 
 
 		 333 aa  45.8  0.002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1086  cytochrome c family protein  29.45 
 
 		 266 aa  44.3  0.005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2603  cytochrome b subunit of formate dehydrogenase-like protein  25.76 
 
 		 729 aa  43.9  0.006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.18944  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>