35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCV52592_0434 on replicon NC_009715
Organism: Campylobacter curvus 525.92



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009802  CCC13826_1552  beta ketoacyl-acyl carrier protein synthase II  85.24 
 
 
456 aa  829    Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0434  hydroxylamine oxidase  100 
 
 
455 aa  959    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.000562853  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0800  hydroxylamine oxidase  64.16 
 
 
461 aa  635    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000000654333  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2383  hypothetical protein  37.5 
 
 
473 aa  315  9.999999999999999e-85  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1634  hypothetical protein  37.77 
 
 
463 aa  311  2e-83  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000364247  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0300  hypothetical protein  38.74 
 
 
461 aa  311  2e-83  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.124376  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4755  hypothetical protein  38.9 
 
 
488 aa  285  1.0000000000000001e-75  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0308268  unclonable  0.0000000219309 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4366  hypothetical protein  38.04 
 
 
488 aa  283  4.0000000000000003e-75  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0467  hydroxylamine oxidase  37.05 
 
 
464 aa  278  1e-73  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0059  hypothetical protein  33.33 
 
 
505 aa  258  1e-67  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.811122  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3025  hypothetical protein  35.91 
 
 
489 aa  259  1e-67  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0550  hypothetical protein  35.21 
 
 
487 aa  251  2e-65  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000169921  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2076  hypothetical protein  32.3 
 
 
529 aa  220  3e-56  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.616227  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2170  hypothetical protein  32.53 
 
 
528 aa  216  5e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.355183  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1764  hypothetical protein  31.67 
 
 
535 aa  211  2e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0217  hydroxylamine oxidase  28.24 
 
 
520 aa  171  2e-41  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1248  hydroxylamine oxidase  28.75 
 
 
496 aa  171  3e-41  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0152054  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2550  hydroxylamine oxidase  27.44 
 
 
511 aa  166  5.9999999999999996e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0956  multihaem cytochrome  29.32 
 
 
446 aa  159  9e-38  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0959  multiheme cytochrome  29.09 
 
 
447 aa  158  2e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3758  hypothetical protein  28.41 
 
 
417 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0953  hydroxylamine oxidase  27.19 
 
 
442 aa  134  3e-30  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3667  hypothetical protein  28.24 
 
 
407 aa  133  7.999999999999999e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000152326  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0142  hypothetical protein  26.45 
 
 
413 aa  130  5.0000000000000004e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.611176  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1628  hypothetical protein  24.67 
 
 
436 aa  119  9.999999999999999e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000975742  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0983  hypothetical protein  26.23 
 
 
425 aa  118  3e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.392669 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1044  hypothetical protein  22.59 
 
 
418 aa  106  1e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000096075  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2662  hydroxylamine oxidase  22.61 
 
 
570 aa  86.3  0.000000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.0000630744  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1082  hydroxylamine oxidase  22.61 
 
 
570 aa  86.3  0.000000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00172641  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0805  hydroxylamine oxidase  22.61 
 
 
570 aa  86.3  0.000000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0956  hydroxylamine oxydoreductase  23.59 
 
 
559 aa  84.3  0.000000000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.157414  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0892  hydroxylamine oxidase  23.23 
 
 
580 aa  83.2  0.00000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0707349  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1648  cytochrome c family protein  29.47 
 
 
270 aa  43.9  0.007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1924  cytochrome c family protein  31.11 
 
 
270 aa  43.5  0.008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00050556  normal  0.656343 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1155  hypothetical protein  27.1 
 
 
1537 aa  43.1  0.009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>