40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_1634 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009943  Dole_1634  hypothetical protein  100 
 
 
463 aa  979    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000364247  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2383  hypothetical protein  73.48 
 
 
473 aa  739    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0300  hypothetical protein  69.7 
 
 
461 aa  696    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.124376  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0467  hydroxylamine oxidase  43.73 
 
 
464 aa  333  3e-90  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4366  hypothetical protein  37.11 
 
 
488 aa  327  2.0000000000000001e-88  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4755  hypothetical protein  38.32 
 
 
488 aa  323  5e-87  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0308268  unclonable  0.0000000219309 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0059  hypothetical protein  37.21 
 
 
505 aa  317  4e-85  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.811122  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3025  hypothetical protein  38.22 
 
 
489 aa  316  6e-85  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0800  hydroxylamine oxidase  38.19 
 
 
461 aa  313  4.999999999999999e-84  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000000654333  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0434  hydroxylamine oxidase  37.77 
 
 
455 aa  311  2e-83  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.000562853  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1552  beta ketoacyl-acyl carrier protein synthase II  36.34 
 
 
456 aa  300  3e-80  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0550  hypothetical protein  35.41 
 
 
487 aa  293  5e-78  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000169921  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2076  hypothetical protein  36.07 
 
 
529 aa  286  5e-76  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.616227  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1764  hypothetical protein  36.31 
 
 
535 aa  278  1e-73  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2170  hypothetical protein  35.95 
 
 
528 aa  278  1e-73  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.355183  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1248  hydroxylamine oxidase  31.16 
 
 
496 aa  219  7e-56  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0152054  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2550  hydroxylamine oxidase  31.82 
 
 
511 aa  202  9e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0217  hydroxylamine oxidase  28.48 
 
 
520 aa  193  7e-48  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3667  hypothetical protein  27.99 
 
 
407 aa  144  4e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000152326  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3758  hypothetical protein  25.57 
 
 
417 aa  140  3.9999999999999997e-32  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0953  hydroxylamine oxidase  27.61 
 
 
442 aa  137  5e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0956  multihaem cytochrome  26.86 
 
 
446 aa  133  6e-30  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0142  hypothetical protein  28.34 
 
 
413 aa  133  6.999999999999999e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.611176  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0959  multiheme cytochrome  27.38 
 
 
447 aa  132  1.0000000000000001e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1044  hypothetical protein  25.65 
 
 
418 aa  129  1.0000000000000001e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000096075  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0983  hypothetical protein  24.94 
 
 
425 aa  110  7.000000000000001e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.392669 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1628  hypothetical protein  25.76 
 
 
436 aa  109  1e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000975742  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0892  hydroxylamine oxidase  27.11 
 
 
580 aa  107  4e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0707349  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2662  hydroxylamine oxidase  23.65 
 
 
570 aa  96.3  1e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.0000630744  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1082  hydroxylamine oxidase  23.65 
 
 
570 aa  96.3  1e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00172641  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0805  hydroxylamine oxidase  23.65 
 
 
570 aa  96.3  1e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0956  hydroxylamine oxydoreductase  25.19 
 
 
559 aa  91.7  3e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.157414  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1402  double CXXCH motif-containing protein  26.21 
 
 
317 aa  52.8  0.00001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0638375 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0113  hypothetical protein  22.83 
 
 
577 aa  47  0.0006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.020056  normal  0.620455 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2713  cytochrome b subunit of formate dehydrogenase-like  24.6 
 
 
658 aa  47.4  0.0006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.151641  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0600  PKD  23.25 
 
 
712 aa  45.1  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000134554  normal  0.252595 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3380  hypothetical protein  27.78 
 
 
231 aa  43.9  0.006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.419565  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0109  hypothetical protein  22.01 
 
 
571 aa  43.9  0.006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0534  cytochrome c family protein  23.88 
 
 
324 aa  43.1  0.009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0422268  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2180  hypothetical protein  26.81 
 
 
346 aa  43.1  0.01  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>