41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_1086 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_1086  cytochrome c family protein  100 
 
 		 266 aa  545  1e-154  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3175  cytochrome c family protein  91.73 
 
 		 266 aa  474  1e-133  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1648  cytochrome c family protein  54.86 
 
 		 270 aa  294  1e-78  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2381  hypothetical protein  55.69 
 
 		 270 aa  274  1.0000000000000001e-72  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.145583  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1924  cytochrome c family protein  54.24 
 
 		 270 aa  265  4e-70  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00050556  normal  0.656343 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2713  cytochrome b subunit of formate dehydrogenase-like  31.97 
 
 		 658 aa  62.4  0.000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.151641  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2603  cytochrome b subunit of formate dehydrogenase-like protein  27.27 
 
 		 729 aa  55.5  0.000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.18944  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1404  cytochrome c family protein  29.09 
 
 		 655 aa  53.1  0.000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.352447  normal  0.0404574 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0113  hypothetical protein  29.86 
 
 		 577 aa  52.8  0.000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.020056  normal  0.620455 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2063  hypothetical protein  29.94 
 
 		 615 aa  52.8  0.000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.97808  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2731  polyheme membrane-associated cytochrome c  31.06 
 
 		 768 aa  51.6  0.00001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.209433  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3926  hypothetical protein  32.81 
 
 		 211 aa  51.2  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3379  polyheme membrane-associated cytochrome c  26.4 
 
 		 789 aa  50.4  0.00003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.675442  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0467  hydroxylamine oxidase  34.57 
 
 		 464 aa  48.5  0.0001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2928  cytochrome c family protein  24.44 
 
 		 350 aa  47  0.0003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000703284  decreased coverage  2.01033e-17 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0594  cytochrome c family protein  28.49 
 
 		 349 aa  47  0.0003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.127637  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003777  decaheme cytochrome c MtrA  30.13 
 
 		 326 aa  46.6  0.0004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0867  polyheme membrane-associated cytochrome c  33.6 
 
 		 783 aa  46.6  0.0004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1805  cytochrome C family protein  29.41 
 
 		 346 aa  46.2  0.0005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.126894  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0983  hypothetical protein  28.93 
 
 		 425 aa  45.8  0.0006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.392669 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0109  hypothetical protein  29.75 
 
 		 571 aa  45.4  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0116  hypothetical protein  29.83 
 
 		 566 aa  45.4  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.7686  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1628  hypothetical protein  28.33 
 
 		 436 aa  44.7  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000975742  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0550  hypothetical protein  29.45 
 
 		 487 aa  44.7  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000169921  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0127  hypothetical protein  29.28 
 
 		 566 aa  43.9  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3667  hypothetical protein  30.71 
 
 		 407 aa  44.3  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000152326  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4073  cytochrome c family protein  26.89 
 
 		 662 aa  44.7  0.002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2002  cytochrome c family protein  26.49 
 
 		 346 aa  43.5  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1876  cytochrome C family protein  26.49 
 
 		 346 aa  43.9  0.003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1961  cytochrome C family protein  26.49 
 
 		 346 aa  43.5  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.613696  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0689  multiheme cytochrome  25.99 
 
 		 359 aa  43.9  0.003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000324131 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0800  hydroxylamine oxidase  27.27 
 
 		 461 aa  43.9  0.003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000000654333  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1237  TPR repeat-containing protein  26.88 
 
 		 802 aa  43.5  0.004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.200313 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3775  cytochrome c family protein  30.37 
 
 		 384 aa  43.1  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.172971  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0676  multihaem cytochrome  26.97 
 
 		 359 aa  43.1  0.005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0064  cytochrome c family protein  25.49 
 
 		 689 aa  43.1  0.005  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0845  cytochrome b subunit of formate dehydrogenase-like protein  26.03 
 
 		 757 aa  43.1  0.005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.763615  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2739  hypothetical protein  29.09 
 
 		 471 aa  42.7  0.006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  unclonable  0.000000852444  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0125  hypothetical protein  29.22 
 
 		 618 aa  42.4  0.008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000548778  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0014  hypothetical protein  29.91 
 
 		 670 aa  42  0.01  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2149  cytochrome c family protein  26.53 
 
 		 304 aa  42  0.01  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0950345  normal  0.491991 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>