28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_3175 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_3175  cytochrome c family protein  100 
 
 		 266 aa  546  1e-154  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1086  cytochrome c family protein  91.73 
 
 		 266 aa  476  1e-133  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1648  cytochrome c family protein  55.25 
 
 		 270 aa  293  1e-78  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2381  hypothetical protein  55.69 
 
 		 270 aa  273  2.0000000000000002e-72  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.145583  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1924  cytochrome c family protein  54.66 
 
 		 270 aa  265  4e-70  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00050556  normal  0.656343 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2713  cytochrome b subunit of formate dehydrogenase-like  31.69 
 
 		 658 aa  64.7  0.000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.151641  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0113  hypothetical protein  29.08 
 
 		 577 aa  56.6  0.0000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.020056  normal  0.620455 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2063  hypothetical protein  29.34 
 
 		 615 aa  56.2  0.0000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.97808  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2731  polyheme membrane-associated cytochrome c  31.82 
 
 		 768 aa  54.7  0.000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.209433  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3379  polyheme membrane-associated cytochrome c  29.85 
 
 		 789 aa  51.2  0.00001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.675442  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2603  cytochrome b subunit of formate dehydrogenase-like protein  29.17 
 
 		 729 aa  52  0.00001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.18944  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2928  cytochrome c family protein  24.58 
 
 		 350 aa  49.7  0.00005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000703284  decreased coverage  2.01033e-17 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1404  cytochrome c family protein  28.49 
 
 		 655 aa  49.3  0.00006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.352447  normal  0.0404574 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3926  hypothetical protein  31.25 
 
 		 211 aa  48.5  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0867  polyheme membrane-associated cytochrome c  34.4 
 
 		 783 aa  47.4  0.0003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003777  decaheme cytochrome c MtrA  28.92 
 
 		 326 aa  47  0.0004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0467  hydroxylamine oxidase  33.33 
 
 		 464 aa  46.6  0.0004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0983  hypothetical protein  28.72 
 
 		 425 aa  45.8  0.0007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.392669 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2888  hypothetical protein  26.61 
 
 		 1294 aa  45.4  0.0008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2739  hypothetical protein  30 
 
 		 471 aa  45.4  0.0009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  unclonable  0.000000852444  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0300  hypothetical protein  25.87 
 
 		 461 aa  44.7  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.124376  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0594  cytochrome c family protein  27.37 
 
 		 349 aa  44.3  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.127637  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1402  cytochrome c family protein  27.56 
 
 		 316 aa  43.9  0.003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1805  cytochrome C family protein  29.24 
 
 		 346 aa  43.9  0.003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.126894  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1628  hypothetical protein  29.51 
 
 		 436 aa  43.5  0.004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000975742  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3667  hypothetical protein  30.71 
 
 		 407 aa  43.5  0.004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000152326  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2149  cytochrome c family protein  25 
 
 		 304 aa  42.4  0.008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0950345  normal  0.491991 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0127  hypothetical protein  30.07 
 
 		 566 aa  42  0.01  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>