48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_0676 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_0676  multihaem cytochrome  100 
 
 		 359 aa  755    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0689  multiheme cytochrome  93.87 
 
 		 359 aa  717    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000324131 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2712  hypothetical protein  56.31 
 
 		 366 aa  387  1e-106  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2928  cytochrome c family protein  49.72 
 
 		 350 aa  348  7e-95  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000703284  decreased coverage  2.01033e-17 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0594  cytochrome c family protein  50.46 
 
 		 349 aa  341  1e-92  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.127637  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1577  cytochrome c family protein  45.08 
 
 		 372 aa  330  3e-89  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2739  hypothetical protein  23.04 
 
 		 471 aa  90.9  3e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  unclonable  0.000000852444  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0077  hypothetical protein  28.78 
 
 		 616 aa  58.5  0.0000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.09082e-34 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0095  hypothetical protein  28.25 
 
 		 616 aa  58.2  0.0000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00000209926  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2603  cytochrome b subunit of formate dehydrogenase-like protein  29.71 
 
 		 729 aa  53.5  0.000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.18944  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2713  cytochrome b subunit of formate dehydrogenase-like  25.48 
 
 		 658 aa  51.6  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.151641  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3544  cytochrome C family protein  29.73 
 
 		 1106 aa  51.2  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1616  cytochrome C family protein  29.82 
 
 		 321 aa  50.1  0.00006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.093642  normal  0.713619 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2063  hypothetical protein  23.5 
 
 		 615 aa  50.1  0.00007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.97808  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2761  cytochrome C family protein  29.82 
 
 		 319 aa  49.3  0.00009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.309572  hitchhiker  0.000367908 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1593  cytochrome C family protein  29.82 
 
 		 321 aa  49.3  0.0001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000481816  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1611  cytochrome C family protein  28.17 
 
 		 333 aa  48.5  0.0002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.173927  normal  0.248798 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2766  cytochrome C family protein  28.17 
 
 		 333 aa  48.5  0.0002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0218266  hitchhiker  0.000000422231 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1582  cytochrome C family protein  27.56 
 
 		 321 aa  48.5  0.0002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000911408  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1577  cytochrome C family protein  28.17 
 
 		 333 aa  48.5  0.0002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000354628  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3565  hypothetical protein  29.93 
 
 		 1110 aa  47.4  0.0004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0100  cytochrome c family protein  23.91 
 
 		 618 aa  47.4  0.0004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000214934  normal  0.444755 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0274  cytochrome c family protein  26.36 
 
 		 619 aa  47  0.0005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00552346  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2506  cytochrome C family protein  28.95 
 
 		 321 aa  46.6  0.0006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.365224  hitchhiker  0.00105775 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2574  cytochrome C family protein  28.95 
 
 		 321 aa  47  0.0006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.448859  hitchhiker  0.00699839 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2672  cytochrome C family protein  28.95 
 
 		 321 aa  46.6  0.0006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.655979  normal  0.0486911 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2677  cytochrome C family protein  27.27 
 
 		 329 aa  46.6  0.0007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.376662  normal  0.0163011 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2579  cytochrome C family protein  27.27 
 
 		 329 aa  46.2  0.0008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.069167  normal  0.0206665 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1782  decaheme cytochrome c MtrD  28.95 
 
 		 306 aa  46.2  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1530  cytochrome c family protein  25.48 
 
 		 321 aa  45.8  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.892773  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2511  cytochrome C family protein  27.27 
 
 		 329 aa  46.2  0.001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.115309  hitchhiker  0.00672893 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2638  cytochrome C family protein  27.43 
 
 		 329 aa  44.7  0.002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.838087  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1777  decaheme cytochrome c MtrA  26.76 
 
 		 333 aa  45.1  0.002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0125  hypothetical protein  23.38 
 
 		 618 aa  45.4  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000548778  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2925  cytochrome c family protein  25.95 
 
 		 315 aa  45.1  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1402  cytochrome c family protein  27.56 
 
 		 316 aa  45.1  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1588  cytochrome C family protein  27.46 
 
 		 333 aa  45.1  0.002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00373932  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2699  cytochrome C family protein  26.06 
 
 		 328 aa  44.3  0.003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.840713  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2149  cytochrome c family protein  28.7 
 
 		 304 aa  44.3  0.003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0950345  normal  0.491991 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1477  cytochrome C family protein  27.27 
 
 		 334 aa  44.7  0.003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000779097  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3126  cytochrome C family protein  25.35 
 
 		 333 aa  43.5  0.006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00631921  hitchhiker  0.0000243395 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0227  cytochrome c family protein  27.12 
 
 		 316 aa  43.1  0.007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3926  hypothetical protein  26.52 
 
 		 211 aa  43.1  0.008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0231  cytochrome C family protein  26.98 
 
 		 316 aa  42.7  0.009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0993  hypothetical protein  27.17 
 
 		 291 aa  42.7  0.009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000916347  decreased coverage  0.0000889659 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3828  multiheme cytochrome  26.43 
 
 		 307 aa  42.7  0.009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.326628 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1086  cytochrome c family protein  26.97 
 
 		 266 aa  42.7  0.01  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3260  cytochrome C family protein  26.37 
 
 		 436 aa  42.7  0.01  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>