83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU0274 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_0077  hypothetical protein  74.43 
 
 		 616 aa  972    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.09082e-34 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0274  cytochrome c family protein  100 
 
 		 619 aa  1290    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00552346  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0095  hypothetical protein  74.92 
 
 		 616 aa  976    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00000209926  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0125  hypothetical protein  83.04 
 
 		 618 aa  1093    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000548778  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0100  cytochrome c family protein  89.5 
 
 		 618 aa  1153    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000214934  normal  0.444755 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2063  hypothetical protein  66.5 
 
 		 615 aa  833    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.97808  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0551  cytochrome c family protein  38.13 
 
 		 688 aa  392  1e-108  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0762772  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0064  cytochrome c family protein  35.99 
 
 		 689 aa  374  1e-102  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0014  hypothetical protein  36.41 
 
 		 670 aa  371  1e-101  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2603  cytochrome b subunit of formate dehydrogenase-like protein  36.09 
 
 		 729 aa  368  1e-100  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.18944  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4073  cytochrome c family protein  33.83 
 
 		 662 aa  358  1.9999999999999998e-97  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0807  cytochrome c family protein  37.28 
 
 		 688 aa  351  3e-95  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1404  cytochrome c family protein  33.78 
 
 		 655 aa  337  2.9999999999999997e-91  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.352447  normal  0.0404574 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0845  cytochrome b subunit of formate dehydrogenase-like protein  29.64 
 
 		 757 aa  227  6e-58  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.763615  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2713  cytochrome b subunit of formate dehydrogenase-like  29.16 
 
 		 658 aa  219  1e-55  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.151641  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0116  hypothetical protein  28.03 
 
 		 566 aa  208  2e-52  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.7686  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0109  hypothetical protein  28.67 
 
 		 571 aa  206  1e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0127  hypothetical protein  27.89 
 
 		 566 aa  205  2e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3925  hypothetical protein  33.62 
 
 		 236 aa  133  1.0000000000000001e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1805  cytochrome C family protein  32.46 
 
 		 346 aa  132  3e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.126894  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2002  cytochrome c family protein  29.73 
 
 		 346 aa  128  3e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1961  cytochrome C family protein  29.73 
 
 		 346 aa  128  4.0000000000000003e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.613696  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1876  cytochrome C family protein  29.73 
 
 		 346 aa  128  4.0000000000000003e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2001  deca-heme C-type cytochrome-like  29.13 
 
 		 241 aa  99.8  1e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1877  deca-heme C-type cytochrome-like protein  29.13 
 
 		 241 aa  99.8  1e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.14633  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1962  deca-heme C-type cytochrome-like protein  29.13 
 
 		 241 aa  99.8  1e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.282752  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1806  deca-heme C-type cytochrome-like protein  29.57 
 
 		 247 aa  94  7e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.655576  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3926  hypothetical protein  30.85 
 
 		 211 aa  83.6  0.00000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0113  hypothetical protein  26.69 
 
 		 577 aa  67.8  0.0000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.020056  normal  0.620455 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2739  hypothetical protein  27.55 
 
 		 471 aa  62.8  0.00000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  unclonable  0.000000852444  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0594  cytochrome c family protein  31.47 
 
 		 349 aa  59.3  0.0000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.127637  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1577  cytochrome c family protein  22.73 
 
 		 372 aa  58.2  0.0000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2899  cytochrome c family protein  26.97 
 
 		 374 aa  53.1  0.00001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.167025  normal  0.604733 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0600  PKD  26.25 
 
 		 712 aa  52.4  0.00003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000134554  normal  0.252595 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2928  cytochrome c family protein  28.35 
 
 		 350 aa  50.8  0.00006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000703284  decreased coverage  2.01033e-17 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0598  PKD  26.25 
 
 		 806 aa  50.8  0.00008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00146483  normal  0.752324 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3828  multiheme cytochrome  27.51 
 
 		 307 aa  50.1  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.326628 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2431  cytochrome c nitrite reductase pentaheme subunit  26.43 
 
 		 189 aa  49.7  0.0002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2734  cytochrome c nitrite reductase pentaheme subunit  26.06 
 
 		 189 aa  49.3  0.0002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0689  multiheme cytochrome  27.27 
 
 		 359 aa  48.9  0.0003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000324131 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2925  cytochrome c family protein  25.97 
 
 		 315 aa  48.9  0.0003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2902  hypothetical protein  25 
 
 		 153 aa  48.5  0.0004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0431  flavodoxin domain-containing protein  25.13 
 
 		 883 aa  48.1  0.0004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0240  formate-dependent nitrite reductase  24.48 
 
 		 157 aa  48.1  0.0005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2960  cytochrome  28.57 
 
 		 577 aa  47.8  0.0007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.992406  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3156  hypothetical protein  25 
 
 		 154 aa  47.8  0.0007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3188  multiheme cytochrome  27.95 
 
 		 189 aa  47.4  0.0008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.167986  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3087  multihaem cytochrome  27.95 
 
 		 189 aa  47  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.998147  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0676  multihaem cytochrome  26.36 
 
 		 359 aa  47  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2149  cytochrome c family protein  25.1 
 
 		 304 aa  47  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0950345  normal  0.491991 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2989  hypothetical protein  28.57 
 
 		 189 aa  45.8  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  hitchhiker  0.00228661  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0361  decaheme cytochrome c MtrA  25.49 
 
 		 286 aa  45.8  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.162857  hitchhiker  0.000223849 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0934  cytochrome C family protein  28.44 
 
 		 337 aa  45.8  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1628  hypothetical protein  27.68 
 
 		 436 aa  46.2  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000975742  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0983  hypothetical protein  27.57 
 
 		 425 aa  46.2  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.392669 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1996  cytochrome C family protein  22.96 
 
 		 427 aa  46.2  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0405741  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0615  hypothetical protein  23.44 
 
 		 154 aa  45.8  0.002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3967  formate-dependent nitrite reductase  27.27 
 
 		 156 aa  45.8  0.003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3564  cytochrome C family protein  26.87 
 
 		 955 aa  45.4  0.003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3563  hypothetical protein  24.24 
 
 		 166 aa  45.1  0.004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2519  cytochrome C family protein  25.55 
 
 		 322 aa  45.1  0.004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.589751  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4530  cytochrome c nitrite reductase pentaheme subunit  25.66 
 
 		 188 aa  45.1  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1402  double CXXCH motif-containing protein  30.58 
 
 		 317 aa  44.7  0.005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0638375 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3839  cytochrome C family protein  24.87 
 
 		 330 aa  44.3  0.006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000122425  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03943  nitrite reductase, formate-dependent, penta-heme cytochrome c  21.43 
 
 		 188 aa  44.3  0.007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5576  cytochrome c nitrite reductase pentaheme subunit  21.43 
 
 		 188 aa  44.3  0.007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3544  cytochrome C family protein  28.57 
 
 		 1106 aa  44.3  0.007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4592  cytochrome c nitrite reductase pentaheme subunit  21.43 
 
 		 188 aa  44.3  0.007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4533  cytochrome c nitrite reductase pentaheme subunit  21.43 
 
 		 188 aa  44.3  0.007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3956  cytochrome c nitrite reductase pentaheme subunit  21.43 
 
 		 188 aa  44.3  0.007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.975829 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3962  formate-dependent nitrite reductase  28.91 
 
 		 154 aa  44.3  0.007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4627  cytochrome c nitrite reductase pentaheme subunit  21.43 
 
 		 188 aa  44.3  0.007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03903  hypothetical protein  21.43 
 
 		 188 aa  44.3  0.007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1836  cytochrome C family protein  26.58 
 
 		 658 aa  44.3  0.007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3921  cytochrome c nitrite reductase, pentaheme subunit  21.43 
 
 		 188 aa  44.3  0.007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4316  cytochrome c nitrite reductase pentaheme subunit  21.43 
 
 		 188 aa  44.3  0.007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3764  formate-dependent nitrite reductase  29.13 
 
 		 154 aa  43.9  0.008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4285  formate-dependent nitrite reductase  29.1 
 
 		 153 aa  43.5  0.01  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.128151 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4153  formate-dependent nitrite reductase  29.1 
 
 		 153 aa  43.5  0.01  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2887  cytochrome c family protein  24.38 
 
 		 884 aa  43.9  0.01  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0141387  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3837  formate-dependent nitrite reductase  29.13 
 
 		 154 aa  43.9  0.01  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1998  cytochrome c nitrite reductase pentaheme subunit  25.53 
 
 		 197 aa  43.9  0.01  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0181  formate-dependent nitrite reductase  29.1 
 
 		 153 aa  43.5  0.01  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>