97 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_3563 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_3563  hypothetical protein  100 
 
 		 166 aa  345  2e-94  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0241  hypothetical protein  50.9 
 
 		 157 aa  167  7e-41  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3967  formate-dependent nitrite reductase  47.47 
 
 		 156 aa  153  9e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3156  hypothetical protein  46.67 
 
 		 154 aa  147  5e-35  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0615  hypothetical protein  47.3 
 
 		 154 aa  147  5e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0313  formate-dependent nitrite reductase  44.1 
 
 		 154 aa  139  9.999999999999999e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0518  hypothetical protein  43.33 
 
 		 156 aa  139  1.9999999999999998e-32  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2902  hypothetical protein  44.3 
 
 		 153 aa  138  3e-32  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0240  formate-dependent nitrite reductase  51.61 
 
 		 157 aa  134  7.000000000000001e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0181  formate-dependent nitrite reductase  44.97 
 
 		 153 aa  129  3e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4153  formate-dependent nitrite reductase  44.97 
 
 		 153 aa  129  3e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3837  formate-dependent nitrite reductase  41.51 
 
 		 154 aa  128  3e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3764  formate-dependent nitrite reductase  41.51 
 
 		 154 aa  128  3e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4285  formate-dependent nitrite reductase  44.97 
 
 		 153 aa  129  3e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.128151 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0182  formate-dependent nitrite reductase  44.3 
 
 		 153 aa  127  5.0000000000000004e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3962  formate-dependent nitrite reductase  41.51 
 
 		 154 aa  126  1.0000000000000001e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4623  cytochrome c nitrite reductase pentaheme subunit  34.16 
 
 		 188 aa  85.1  4e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4621  cytochrome c nitrite reductase pentaheme subunit  34.16 
 
 		 188 aa  85.1  4e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.342396 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4537  cytochrome c nitrite reductase pentaheme subunit  34.16 
 
 		 188 aa  85.1  4e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4672  cytochrome c nitrite reductase pentaheme subunit  34.16 
 
 		 188 aa  85.1  4e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4530  cytochrome c nitrite reductase pentaheme subunit  34.16 
 
 		 188 aa  84.7  5e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3956  cytochrome c nitrite reductase pentaheme subunit  37.19 
 
 		 188 aa  79  0.00000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.975829 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4533  cytochrome c nitrite reductase pentaheme subunit  37.19 
 
 		 188 aa  79  0.00000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4592  cytochrome c nitrite reductase pentaheme subunit  37.19 
 
 		 188 aa  79  0.00000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4627  cytochrome c nitrite reductase pentaheme subunit  37.19 
 
 		 188 aa  79  0.00000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4316  cytochrome c nitrite reductase pentaheme subunit  37.19 
 
 		 188 aa  79  0.00000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5576  cytochrome c nitrite reductase pentaheme subunit  37.19 
 
 		 188 aa  79  0.00000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03903  hypothetical protein  37.19 
 
 		 188 aa  79  0.00000000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3921  cytochrome c nitrite reductase, pentaheme subunit  37.19 
 
 		 188 aa  79  0.00000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03943  nitrite reductase, formate-dependent, penta-heme cytochrome c  37.19 
 
 		 188 aa  79  0.00000000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2431  cytochrome c nitrite reductase pentaheme subunit  38.84 
 
 		 189 aa  77.8  0.00000000000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2734  cytochrome c nitrite reductase pentaheme subunit  32.92 
 
 		 189 aa  74.7  0.0000000000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2149  cytochrome c family protein  28.83 
 
 		 304 aa  71.6  0.000000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0950345  normal  0.491991 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4360  decaheme cytochrome c  28.99 
 
 		 304 aa  71.2  0.000000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2230  cytochrome C family protein  34.65 
 
 		 309 aa  70.5  0.00000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0468166  decreased coverage  0.000802637 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3675  cytochrome C family protein  33.86 
 
 		 315 aa  70.1  0.00000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0268  cytochrome C family protein  33.86 
 
 		 314 aa  70.1  0.00000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1427  decaheme cytochrome c  32.82 
 
 		 318 aa  67.4  0.00000000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2925  cytochrome c family protein  35.94 
 
 		 315 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1524  cytochrome c family protein  25.65 
 
 		 333 aa  65.5  0.0000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.462693  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0352  cytochrome c family protein  34.38 
 
 		 317 aa  65.5  0.0000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.101331 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2579  cytochrome C family protein  27.53 
 
 		 329 aa  65.1  0.0000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.069167  normal  0.0206665 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3126  cytochrome C family protein  26.7 
 
 		 333 aa  64.7  0.0000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00631921  hitchhiker  0.0000243395 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2820  cytochrome C family protein  33.59 
 
 		 312 aa  64.3  0.0000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1207  decaheme cytochrome c MtrA  31.75 
 
 		 326 aa  64.3  0.0000000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0298799  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2766  cytochrome C family protein  31.75 
 
 		 333 aa  63.9  0.0000000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0218266  hitchhiker  0.000000422231 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1402  cytochrome c family protein  32.81 
 
 		 316 aa  63.9  0.0000000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1611  cytochrome C family protein  31.75 
 
 		 333 aa  63.9  0.000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.173927  normal  0.248798 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1577  cytochrome C family protein  31.75 
 
 		 333 aa  63.9  0.000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000354628  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2677  cytochrome C family protein  26.97 
 
 		 329 aa  63.9  0.000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.376662  normal  0.0163011 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2526  cytochrome C family protein  26.34 
 
 		 329 aa  63.5  0.000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2511  cytochrome C family protein  26.97 
 
 		 329 aa  63.9  0.000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.115309  hitchhiker  0.00672893 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1777  decaheme cytochrome c MtrA  31.75 
 
 		 333 aa  62.4  0.000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1530  cytochrome c family protein  30.95 
 
 		 321 aa  62  0.000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.892773  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2638  cytochrome C family protein  30.16 
 
 		 329 aa  62  0.000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.838087  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2519  cytochrome C family protein  29.41 
 
 		 322 aa  61.6  0.000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.589751  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2692  cytochrome C family protein  28.8 
 
 		 319 aa  61.6  0.000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1213  decaheme cytochrome c MtrD  30.71 
 
 		 318 aa  61.2  0.000000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.766107  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1477  cytochrome C family protein  31.75 
 
 		 334 aa  61.2  0.000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000779097  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1588  cytochrome C family protein  30.95 
 
 		 333 aa  60.5  0.00000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00373932  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1305  cytochrome c family protein  29.6 
 
 		 310 aa  60.1  0.00000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000952698 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1998  cytochrome c nitrite reductase pentaheme subunit  28.03 
 
 		 197 aa  59.3  0.00000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0227  cytochrome c family protein  32.03 
 
 		 316 aa  59.7  0.00000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3130  cytochrome C family protein  29.69 
 
 		 317 aa  59.3  0.00000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.849943  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2761  cytochrome C family protein  32.81 
 
 		 319 aa  58.9  0.00000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.309572  hitchhiker  0.000367908 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1582  cytochrome C family protein  32.81 
 
 		 321 aa  58.9  0.00000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000911408  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2574  cytochrome C family protein  25.88 
 
 		 321 aa  58.2  0.00000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.448859  hitchhiker  0.00699839 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0231  cytochrome C family protein  29.69 
 
 		 316 aa  57.8  0.00000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2506  cytochrome C family protein  25.88 
 
 		 321 aa  57.8  0.00000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.365224  hitchhiker  0.00105775 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2672  cytochrome C family protein  26.54 
 
 		 321 aa  57.4  0.00000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.655979  normal  0.0486911 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2699  cytochrome C family protein  26.7 
 
 		 328 aa  57.4  0.00000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.840713  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1616  cytochrome C family protein  32.03 
 
 		 321 aa  57  0.0000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.093642  normal  0.713619 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1593  cytochrome C family protein  32.03 
 
 		 321 aa  57.4  0.0000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000481816  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1782  decaheme cytochrome c MtrD  29.37 
 
 		 306 aa  56.6  0.0000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3686  cytochrome C family protein  29.69 
 
 		 314 aa  56.2  0.0000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003115  cytochrome c-type protein nrfB precursor  26.72 
 
 		 200 aa  51.6  0.000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02726  cytochrome c nitrite reductase pentaheme subunit  27.48 
 
 		 200 aa  51.2  0.000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4082  hypothetical protein  32.67 
 
 		 307 aa  50.1  0.00001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0556738  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003777  decaheme cytochrome c MtrA  27.61 
 
 		 326 aa  49.7  0.00002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0397  cytochrome C family protein  27.1 
 
 		 299 aa  48.1  0.00005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.265526 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0361  decaheme cytochrome c MtrA  26.62 
 
 		 286 aa  47.8  0.00007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.162857  hitchhiker  0.000223849 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2063  hypothetical protein  30.69 
 
 		 615 aa  47  0.0001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.97808  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0077  hypothetical protein  22.76 
 
 		 616 aa  47  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.09082e-34 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1744  cytochrome c family protein  30.84 
 
 		 337 aa  45.8  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.740978 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1402  double CXXCH motif-containing protein  31.68 
 
 		 317 aa  46.2  0.0002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0638375 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0095  hypothetical protein  21.95 
 
 		 616 aa  45.8  0.0003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00000209926  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0274  cytochrome c family protein  24.24 
 
 		 619 aa  45.1  0.0004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00552346  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3626  cytochrome C family protein  29.63 
 
 		 299 aa  45.1  0.0004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3859  cytochrome C family protein  23.39 
 
 		 287 aa  44.3  0.0007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00158078  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3118  cytochrome C family protein  29.91 
 
 		 334 aa  44.3  0.0008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1144  cytochrome C family protein  29.91 
 
 		 334 aa  44.3  0.0008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0747  multiheme cytochrome  27.61 
 
 		 487 aa  43.9  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.568299  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2203  cytochrome c family protein  27.56 
 
 		 363 aa  43.1  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3828  multiheme cytochrome  32.97 
 
 		 307 aa  42.7  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.326628 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0100  cytochrome c family protein  23.26 
 
 		 618 aa  43.1  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000214934  normal  0.444755 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3110  hypothetical protein  29.69 
 
 		 916 aa  42.4  0.003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1577  cytochrome c family protein  26.42 
 
 		 372 aa  40.8  0.009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>