88 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew185_4153 on replicon NC_009665
Organism: Shewanella baltica OS185



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009052  Sbal_0181  formate-dependent nitrite reductase  100 
 
 
153 aa  318  9.999999999999999e-87  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4153  formate-dependent nitrite reductase  100 
 
 
153 aa  318  9.999999999999999e-87  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4285  formate-dependent nitrite reductase  100 
 
 
153 aa  318  9.999999999999999e-87  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.128151 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0182  formate-dependent nitrite reductase  99.35 
 
 
153 aa  318  1.9999999999999998e-86  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3764  formate-dependent nitrite reductase  80.39 
 
 
154 aa  260  4e-69  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3837  formate-dependent nitrite reductase  79.74 
 
 
154 aa  259  8.999999999999999e-69  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3962  formate-dependent nitrite reductase  79.08 
 
 
154 aa  258  3e-68  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0313  formate-dependent nitrite reductase  78.43 
 
 
154 aa  256  1e-67  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0615  hypothetical protein  53.9 
 
 
154 aa  182  2.0000000000000003e-45  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3967  formate-dependent nitrite reductase  43.92 
 
 
156 aa  139  9.999999999999999e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0241  hypothetical protein  42.68 
 
 
157 aa  138  3e-32  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3563  hypothetical protein  44.97 
 
 
166 aa  129  2.0000000000000002e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0240  formate-dependent nitrite reductase  43.28 
 
 
157 aa  126  1.0000000000000001e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2902  hypothetical protein  40.29 
 
 
153 aa  119  9.999999999999999e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3156  hypothetical protein  41.55 
 
 
154 aa  119  9.999999999999999e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0518  hypothetical protein  34.62 
 
 
156 aa  116  9.999999999999999e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2734  cytochrome c nitrite reductase pentaheme subunit  35.38 
 
 
189 aa  79  0.00000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3956  cytochrome c nitrite reductase pentaheme subunit  31.41 
 
 
188 aa  78.2  0.00000000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.975829 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4533  cytochrome c nitrite reductase pentaheme subunit  31.41 
 
 
188 aa  78.2  0.00000000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4592  cytochrome c nitrite reductase pentaheme subunit  31.41 
 
 
188 aa  78.2  0.00000000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5576  cytochrome c nitrite reductase pentaheme subunit  31.21 
 
 
188 aa  77.8  0.00000000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4316  cytochrome c nitrite reductase pentaheme subunit  31.21 
 
 
188 aa  77.8  0.00000000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4627  cytochrome c nitrite reductase pentaheme subunit  31.21 
 
 
188 aa  77.8  0.00000000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03903  hypothetical protein  31.21 
 
 
188 aa  77.8  0.00000000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03943  nitrite reductase, formate-dependent, penta-heme cytochrome c  31.21 
 
 
188 aa  77.8  0.00000000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3921  cytochrome c nitrite reductase, pentaheme subunit  31.21 
 
 
188 aa  77.8  0.00000000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4621  cytochrome c nitrite reductase pentaheme subunit  32.82 
 
 
188 aa  75.9  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.342396 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4672  cytochrome c nitrite reductase pentaheme subunit  32.82 
 
 
188 aa  75.9  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4537  cytochrome c nitrite reductase pentaheme subunit  32.82 
 
 
188 aa  75.9  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4623  cytochrome c nitrite reductase pentaheme subunit  32.82 
 
 
188 aa  75.9  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2431  cytochrome c nitrite reductase pentaheme subunit  34.33 
 
 
189 aa  75.9  0.0000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4530  cytochrome c nitrite reductase pentaheme subunit  32.82 
 
 
188 aa  75.1  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1305  cytochrome c family protein  29.92 
 
 
310 aa  65.1  0.0000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000952698 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1998  cytochrome c nitrite reductase pentaheme subunit  29.73 
 
 
197 aa  64.3  0.0000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003115  cytochrome c-type protein nrfB precursor  29.93 
 
 
200 aa  62  0.000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3126  cytochrome C family protein  26.75 
 
 
333 aa  60.5  0.000000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00631921  hitchhiker  0.0000243395 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02726  cytochrome c nitrite reductase pentaheme subunit  28.47 
 
 
200 aa  60.5  0.000000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4360  decaheme cytochrome c  26.98 
 
 
304 aa  59.7  0.00000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1782  decaheme cytochrome c MtrD  27.52 
 
 
306 aa  60.1  0.00000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2761  cytochrome C family protein  27.52 
 
 
319 aa  59.3  0.00000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.309572  hitchhiker  0.000367908 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1477  cytochrome C family protein  27.39 
 
 
334 aa  59.7  0.00000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000779097  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2149  cytochrome c family protein  32.26 
 
 
304 aa  59.3  0.00000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0950345  normal  0.491991 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2672  cytochrome C family protein  26.85 
 
 
321 aa  59.3  0.00000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.655979  normal  0.0486911 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2574  cytochrome C family protein  26.85 
 
 
321 aa  59.3  0.00000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.448859  hitchhiker  0.00699839 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1593  cytochrome C family protein  27.52 
 
 
321 aa  58.5  0.00000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000481816  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2692  cytochrome C family protein  28.99 
 
 
319 aa  58.5  0.00000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1582  cytochrome C family protein  28.19 
 
 
321 aa  58.5  0.00000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000911408  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2638  cytochrome C family protein  26.75 
 
 
329 aa  58.2  0.00000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.838087  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1616  cytochrome C family protein  27.52 
 
 
321 aa  58.2  0.00000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.093642  normal  0.713619 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1577  cytochrome C family protein  26.75 
 
 
333 aa  58.2  0.00000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000354628  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1777  decaheme cytochrome c MtrA  27.39 
 
 
333 aa  58.2  0.00000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1611  cytochrome C family protein  26.75 
 
 
333 aa  58.2  0.00000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.173927  normal  0.248798 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2506  cytochrome C family protein  26.17 
 
 
321 aa  57.8  0.00000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.365224  hitchhiker  0.00105775 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2766  cytochrome C family protein  26.75 
 
 
333 aa  57.4  0.00000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0218266  hitchhiker  0.000000422231 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2579  cytochrome C family protein  26.75 
 
 
329 aa  57  0.00000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.069167  normal  0.0206665 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2677  cytochrome C family protein  26.75 
 
 
329 aa  57  0.00000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.376662  normal  0.0163011 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2511  cytochrome C family protein  26.75 
 
 
329 aa  57  0.00000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.115309  hitchhiker  0.00672893 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1207  decaheme cytochrome c MtrA  26.75 
 
 
326 aa  57  0.00000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0298799  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0268  cytochrome C family protein  25.84 
 
 
314 aa  56.2  0.0000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2925  cytochrome c family protein  27.52 
 
 
315 aa  56.2  0.0000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3675  cytochrome C family protein  26.4 
 
 
315 aa  55.8  0.0000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1524  cytochrome c family protein  25.48 
 
 
333 aa  55.1  0.0000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.462693  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2699  cytochrome C family protein  25.48 
 
 
328 aa  55.1  0.0000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.840713  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1588  cytochrome C family protein  26.75 
 
 
333 aa  55.1  0.0000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00373932  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2230  cytochrome C family protein  27.56 
 
 
309 aa  54.7  0.0000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0468166  decreased coverage  0.000802637 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1213  decaheme cytochrome c MtrD  28.78 
 
 
318 aa  54.3  0.0000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.766107  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0231  cytochrome C family protein  31.01 
 
 
316 aa  53.1  0.000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2526  cytochrome C family protein  25.48 
 
 
329 aa  53.5  0.000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1427  decaheme cytochrome c  27.14 
 
 
318 aa  53.1  0.000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2519  cytochrome C family protein  27.66 
 
 
322 aa  53.5  0.000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.589751  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0397  cytochrome C family protein  26.75 
 
 
299 aa  52.4  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.265526 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1530  cytochrome c family protein  27.13 
 
 
321 aa  52  0.000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.892773  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0227  cytochrome c family protein  29.14 
 
 
316 aa  51.2  0.000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0352  cytochrome c family protein  27.91 
 
 
317 aa  50.4  0.000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.101331 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3686  cytochrome C family protein  29.01 
 
 
314 aa  50.1  0.00001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3130  cytochrome C family protein  26.72 
 
 
317 aa  50.4  0.00001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.849943  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003777  decaheme cytochrome c MtrA  30.61 
 
 
326 aa  50.1  0.00001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3626  cytochrome C family protein  27.61 
 
 
299 aa  48.1  0.00004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2820  cytochrome C family protein  27.13 
 
 
312 aa  46.6  0.0001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1402  cytochrome c family protein  26.77 
 
 
316 aa  46.2  0.0002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1402  double CXXCH motif-containing protein  28.65 
 
 
317 aa  46.2  0.0002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0638375 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2203  cytochrome c family protein  30.4 
 
 
363 aa  43.9  0.0008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0274  cytochrome c family protein  29.1 
 
 
619 aa  43.5  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00552346  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3859  cytochrome C family protein  28.8 
 
 
287 aa  42.4  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00158078  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0361  decaheme cytochrome c MtrA  25.9 
 
 
286 aa  42.7  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.162857  hitchhiker  0.000223849 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4082  hypothetical protein  25.64 
 
 
307 aa  42.4  0.002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0556738  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1102  cytochrome c family protein  24.55 
 
 
252 aa  41.6  0.004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.000000169196  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0064  cytochrome c family protein  29.25 
 
 
689 aa  41.2  0.005  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>