37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_2712 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_2712  hypothetical protein  100 
 
 		 366 aa  760    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0689  multiheme cytochrome  53.12 
 
 		 359 aa  404  1.0000000000000001e-112  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000324131 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0676  multihaem cytochrome  53.52 
 
 		 359 aa  408  1.0000000000000001e-112  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2928  cytochrome c family protein  52.82 
 
 		 350 aa  384  1e-105  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000703284  decreased coverage  2.01033e-17 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0594  cytochrome c family protein  54.72 
 
 		 349 aa  374  1e-102  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.127637  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1577  cytochrome c family protein  49.04 
 
 		 372 aa  350  3e-95  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2739  hypothetical protein  24.8 
 
 		 471 aa  84  0.000000000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  unclonable  0.000000852444  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0100  cytochrome c family protein  27.33 
 
 		 618 aa  56.6  0.0000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000214934  normal  0.444755 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2603  cytochrome b subunit of formate dehydrogenase-like protein  26.67 
 
 		 729 aa  55.5  0.000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.18944  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0274  cytochrome c family protein  26.17 
 
 		 619 aa  55.5  0.000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00552346  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2713  cytochrome b subunit of formate dehydrogenase-like  28.91 
 
 		 658 aa  49.7  0.00008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.151641  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0125  hypothetical protein  27.27 
 
 		 618 aa  47.8  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000548778  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0817  cytochrome C family protein  28.07 
 
 		 540 aa  47.8  0.0003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0747  multiheme cytochrome  25.13 
 
 		 487 aa  47.4  0.0004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.568299  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2761  cytochrome C family protein  27.52 
 
 		 319 aa  46.6  0.0006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.309572  hitchhiker  0.000367908 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0077  hypothetical protein  22.98 
 
 		 616 aa  46.6  0.0007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.09082e-34 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1593  cytochrome C family protein  27.52 
 
 		 321 aa  46.6  0.0007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000481816  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2887  cytochrome c family protein  29.19 
 
 		 884 aa  46.2  0.0008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0141387  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3926  hypothetical protein  27.2 
 
 		 211 aa  45.8  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3775  cytochrome c family protein  35.96 
 
 		 384 aa  45.8  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.172971  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1616  cytochrome C family protein  27.52 
 
 		 321 aa  45.8  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.093642  normal  0.713619 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2960  cytochrome  27.35 
 
 		 577 aa  45.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.992406  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0253  hypothetical protein  29.75 
 
 		 370 aa  45.1  0.002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3831  cytochrome C family protein  35.96 
 
 		 358 aa  45.4  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1146  hypothetical protein  30.32 
 
 		 426 aa  44.3  0.003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00972968  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3915  cytochrome C family protein  35.96 
 
 		 358 aa  44.3  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1582  cytochrome C family protein  26.61 
 
 		 321 aa  44.7  0.003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000911408  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0588  hypothetical protein  28.35 
 
 		 607 aa  44.3  0.004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.221838  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0845  cytochrome b subunit of formate dehydrogenase-like protein  23.4 
 
 		 757 aa  43.5  0.006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.763615  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0905  flavocytochrome c  37.33 
 
 		 597 aa  43.5  0.006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.604755  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3318  flavocytochrome c  37.33 
 
 		 596 aa  43.5  0.006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.5959  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2672  cytochrome C family protein  27.52 
 
 		 321 aa  43.5  0.006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.655979  normal  0.0486911 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2574  cytochrome C family protein  27.52 
 
 		 321 aa  43.5  0.006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.448859  hitchhiker  0.00699839 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2506  cytochrome C family protein  27.52 
 
 		 321 aa  43.5  0.006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.365224  hitchhiker  0.00105775 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1782  decaheme cytochrome c MtrD  27.52 
 
 		 306 aa  43.1  0.008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1402  double CXXCH motif-containing protein  31.62 
 
 		 317 aa  42.7  0.009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0638375 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2583  cytochrome C family protein  24.89 
 
 		 259 aa  42.7  0.01  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>