19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_1384 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_1384  hypothetical protein  100 
 
 		 192 aa  389  1e-107  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0249  cytochrome c family protein  67.19 
 
 		 155 aa  183  1.0000000000000001e-45  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.00000623647  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2062  cytochrome c family protein  65.87 
 
 		 179 aa  183  1.0000000000000001e-45  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.198068 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2711  cytochrome c family protein  61.27 
 
 		 156 aa  170  9e-42  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.392635 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2262  cytochrome c family protein  60.77 
 
 		 148 aa  157  1e-37  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2858  cytochrome c family protein  48.34 
 
 		 153 aa  149  3e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000201551  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2482  hypothetical protein  31.45 
 
 		 561 aa  75.5  0.0000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.995863  normal  0.0219779 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2582  cytochrome c-554 precursor  33.58 
 
 		 236 aa  64.3  0.000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.579805  normal  0.362535 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2434  5'-nucleotidase/2' 3'-cyclic phosphodiesterase-like esterase  28.29 
 
 		 590 aa  62  0.000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.189389  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2660  cytochrome c-554 precursor  31.07 
 
 		 235 aa  52.4  0.000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.721726  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1084  cytochrome c-554 precursor  31.07 
 
 		 235 aa  52.4  0.000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0803  cytochrome c-554 precursor  31.07 
 
 		 235 aa  52.4  0.000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3828  multiheme cytochrome  38.3 
 
 		 307 aa  52  0.000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.326628 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0894  cytochrome c-554 precursor  26.04 
 
 		 240 aa  49.3  0.00003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.308781  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1622  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  26.71 
 
 		 974 aa  44.7  0.0008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2583  cytochrome C family protein  30.09 
 
 		 259 aa  44.3  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1988  TPR repeat-containing protein  32.18 
 
 		 764 aa  42.7  0.004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.645033 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2775  hypothetical protein  27.27 
 
 		 174 aa  42.4  0.004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.148265  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0959  multiheme cytochrome  32.41 
 
 		 447 aa  41.6  0.008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>