30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_0521 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_0521  cytochrome C family protein  100 
 
 		 383 aa  781    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0077  cytochrome C family protein  72.8 
 
 		 2499 aa  584  1e-166  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0580  high-molecular-weight cytochrome c  49.74 
 
 		 869 aa  345  6e-94  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2899  high-molecular-weight cytochrome c  47.46 
 
 		 979 aa  338  8e-92  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0575  cytochrome c family protein  49.87 
 
 		 1127 aa  328  8e-89  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0499  cytochrome C family protein  41.3 
 
 		 1379 aa  211  2e-53  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00294186  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0120  cytochrome C family protein  37.47 
 
 		 2026 aa  187  2e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.345457  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0076  cytochrome C family protein  35.87 
 
 		 1438 aa  180  4e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3542  cytochrome C family protein  39.51 
 
 		 1453 aa  177  4e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1154  cytochrome C family protein  40.06 
 
 		 1454 aa  176  5e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0075  cytochrome C family protein  33.99 
 
 		 2222 aa  172  7.999999999999999e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3563  cytochrome C family protein  35.27 
 
 		 1276 aa  169  7e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0398  cytochrome C family protein  29.51 
 
 		 672 aa  95.1  2e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3049  cytochrome C family protein  26.2 
 
 		 2081 aa  79.3  0.0000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0215  multihaem cytochrome  26.65 
 
 		 563 aa  67  0.0000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.354833  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0229  cytochrome C family protein  24.35 
 
 		 431 aa  63.9  0.000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.286914 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1152  cytochrome C family protein  26.4 
 
 		 1009 aa  63.5  0.000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0702  cytochrome c family protein  27.88 
 
 		 1916 aa  54.7  0.000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3427  cytochrome C family protein  27.21 
 
 		 1457 aa  53.5  0.000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.476422  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0573  cytochrome C family protein  25.79 
 
 		 1672 aa  52  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1834  cytochrome C family protein  32.35 
 
 		 1611 aa  50.1  0.00006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1157  hypothetical protein  36.36 
 
 		 642 aa  48.1  0.0003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0498  cytochrome C family protein  24.88 
 
 		 1281 aa  46.6  0.0006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.618718  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1198  cytochrome C family protein  23.89 
 
 		 1143 aa  45.8  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3543  cytochrome C family protein  29.22 
 
 		 957 aa  45.8  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2869  cytochrome C family protein  31.5 
 
 		 1196 aa  45.1  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00106509  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3417  cytochrome C family protein  35.07 
 
 		 939 aa  44.7  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000650224  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3052  cytochrome C family protein  26.01 
 
 		 1143 aa  44.3  0.003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0558  cytochrome c family protein  27.19 
 
 		 1036 aa  44.3  0.004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3564  cytochrome C family protein  26.85 
 
 		 955 aa  43.1  0.008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>