20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_5736 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_5736  hypothetical protein  100 
 
 
683 aa  1391    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2279  metallophosphoesterase  33.55 
 
 
489 aa  152  2e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1014  metallophosphoesterase  32.72 
 
 
890 aa  148  4.0000000000000006e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0724249 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3327  metallophosphoesterase  32.4 
 
 
492 aa  147  7.0000000000000006e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.430138  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1284  metallophosphoesterase  25.74 
 
 
506 aa  125  2e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.543211  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3973  metallophosphoesterase  28.79 
 
 
357 aa  125  3e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1616  cell wall anchor domain-containing protein  27.81 
 
 
757 aa  124  5e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.551257  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2692  secreted protein  28.81 
 
 
574 aa  122  1.9999999999999998e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3300  putative secreted protein  29.64 
 
 
662 aa  120  9.999999999999999e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4853  metallophosphoesterase  26.79 
 
 
430 aa  116  1.0000000000000001e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4590  putative modular protein  27.76 
 
 
702 aa  116  1.0000000000000001e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.566253  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2642  metallophosphoesterase  27.03 
 
 
649 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0441775  normal  0.87277 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0744  metallophosphoesterase  24.84 
 
 
318 aa  102  2e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.110446  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3092  hypothetical protein  26.63 
 
 
447 aa  98.2  4e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.932849 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0484  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  27.76 
 
 
2668 aa  96.3  2e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22750  Calcineurin-like phosphoesterase  25.37 
 
 
626 aa  92  3e-17  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.623762  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1696  metallophosphoesterase  29.05 
 
 
2105 aa  88.6  4e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0682  putative Ig  28.5 
 
 
1123 aa  59.3  0.0000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.929764  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0282  metallophosphoesterase  27.41 
 
 
459 aa  58.5  0.0000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0444  YvnB  29.36 
 
 
98 aa  46.6  0.001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>