20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_2125 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_2125  protein of unknown function DUF1593  100 
 
 		 477 aa  988    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6073  protein of unknown function DUF1593  50.11 
 
 		 474 aa  453  1.0000000000000001e-126  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0565  signal peptide and transmembrane prediction  49.03 
 
 		 478 aa  432  1e-120  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000000390373  normal  0.415179 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2122  hypothetical protein  47.96 
 
 		 492 aa  428  1e-119  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.526696  normal  0.730716 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3215  hypothetical protein  46.97 
 
 		 498 aa  426  1e-118  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.63505 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2156  hypothetical protein  46.03 
 
 		 462 aa  420  1e-116  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0754544 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0761  protein of unknown function DUF1593  47.38 
 
 		 488 aa  410  1e-113  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00711  alpha-rhamnosidase (Eurofung)  39.7 
 
 		 1507 aa  338  1.9999999999999998e-91  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.210101  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0182  hypothetical protein  37 
 
 		 933 aa  300  5e-80  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.132644  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0873  hypothetical protein  29.87 
 
 		 493 aa  162  1e-38  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.390345  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07383  conserved hypothetical protein  28.77 
 
 		 505 aa  157  4e-37  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00550  protein of unknown function (DUF1593) with cadherin domain  26.55 
 
 		 480 aa  147  5e-34  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.451215  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2806  protein of unknown function DUF1593  30.56 
 
 		 431 aa  119  1.9999999999999998e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.1118  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3874  hypothetical protein  23.84 
 
 		 787 aa  67.4  0.0000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3136  hypothetical protein  23.55 
 
 		 787 aa  66.6  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1428  chitinase  27.87 
 
 		 972 aa  52  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2974  PKD domain-containing protein  34.07 
 
 		 833 aa  50.8  0.00006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4057  carbohydrate-binding family V/XII protein  30.95 
 
 		 600 aa  48.9  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.770883  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00841  PKD domain protein  31.82 
 
 		 1098 aa  46.2  0.001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1101  chitinase  28.7 
 
 		 565 aa  44.3  0.005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>