17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_0565 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_0565  signal peptide and transmembrane prediction  100 
 
 		 478 aa  990    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000000390373  normal  0.415179 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2122  hypothetical protein  66 
 
 		 492 aa  639    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.526696  normal  0.730716 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3215  hypothetical protein  56.82 
 
 		 498 aa  554  1e-156  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.63505 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6073  protein of unknown function DUF1593  56.51 
 
 		 474 aa  514  1e-144  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2125  protein of unknown function DUF1593  47.93 
 
 		 477 aa  433  1e-120  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2156  hypothetical protein  41.46 
 
 		 462 aa  367  1e-100  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0754544 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0761  protein of unknown function DUF1593  41.19 
 
 		 488 aa  349  8e-95  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00711  alpha-rhamnosidase (Eurofung)  37.99 
 
 		 1507 aa  308  9e-83  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.210101  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0182  hypothetical protein  38.46 
 
 		 933 aa  307  3e-82  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.132644  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00550  protein of unknown function (DUF1593) with cadherin domain  30.8 
 
 		 480 aa  157  6e-37  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.451215  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0873  hypothetical protein  26.2 
 
 		 493 aa  137  5e-31  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.390345  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07383  conserved hypothetical protein  28.1 
 
 		 505 aa  133  6e-30  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2806  protein of unknown function DUF1593  34.01 
 
 		 431 aa  131  3e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.1118  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3136  hypothetical protein  25.34 
 
 		 787 aa  76.3  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3874  hypothetical protein  25.34 
 
 		 787 aa  75.1  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1428  chitinase  26.47 
 
 		 972 aa  50.1  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2974  PKD domain-containing protein  31.2 
 
 		 833 aa  47.4  0.0006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>