13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_00550 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013172  Bfae_00550  protein of unknown function (DUF1593) with cadherin domain  100 
 
 		 480 aa  964    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.451215  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07383  conserved hypothetical protein  41.27 
 
 		 505 aa  316  6e-85  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0873  hypothetical protein  32.74 
 
 		 493 aa  259  1e-67  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.390345  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0565  signal peptide and transmembrane prediction  30.68 
 
 		 478 aa  177  5e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000000390373  normal  0.415179 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2156  hypothetical protein  32.87 
 
 		 462 aa  173  6.999999999999999e-42  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0754544 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3215  hypothetical protein  30.35 
 
 		 498 aa  167  2.9999999999999998e-40  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.63505 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00711  alpha-rhamnosidase (Eurofung)  30.26 
 
 		 1507 aa  167  5e-40  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.210101  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2125  protein of unknown function DUF1593  27.35 
 
 		 477 aa  162  1e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0761  protein of unknown function DUF1593  30.02 
 
 		 488 aa  161  3e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2122  hypothetical protein  29.79 
 
 		 492 aa  159  9e-38  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.526696  normal  0.730716 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6073  protein of unknown function DUF1593  30.02 
 
 		 474 aa  159  9e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0182  hypothetical protein  26.09 
 
 		 933 aa  128  2.0000000000000002e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.132644  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2806  protein of unknown function DUF1593  25.91 
 
 		 431 aa  68.2  0.0000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.1118  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>