17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_6073 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_6073  protein of unknown function DUF1593  100 
 
 		 474 aa  975    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2122  hypothetical protein  56.58 
 
 		 492 aa  526  1e-148  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.526696  normal  0.730716 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0565  signal peptide and transmembrane prediction  55.65 
 
 		 478 aa  515  1.0000000000000001e-145  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000000390373  normal  0.415179 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3215  hypothetical protein  56.19 
 
 		 498 aa  504  9.999999999999999e-143  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.63505 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2125  protein of unknown function DUF1593  50.11 
 
 		 477 aa  454  1.0000000000000001e-126  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2156  hypothetical protein  44.6 
 
 		 462 aa  387  1e-106  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0754544 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0761  protein of unknown function DUF1593  42.92 
 
 		 488 aa  340  2.9999999999999998e-92  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00711  alpha-rhamnosidase (Eurofung)  37.14 
 
 		 1507 aa  301  2e-80  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.210101  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0182  hypothetical protein  36.42 
 
 		 933 aa  280  3e-74  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.132644  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0873  hypothetical protein  27.27 
 
 		 493 aa  148  2.0000000000000003e-34  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.390345  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00550  protein of unknown function (DUF1593) with cadherin domain  30.02 
 
 		 480 aa  138  2e-31  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.451215  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07383  conserved hypothetical protein  28.21 
 
 		 505 aa  130  5.0000000000000004e-29  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2806  protein of unknown function DUF1593  30.58 
 
 		 431 aa  105  2e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.1118  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3136  hypothetical protein  25.56 
 
 		 787 aa  70.5  0.00000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3874  hypothetical protein  25.84 
 
 		 787 aa  69.3  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2974  PKD domain-containing protein  35.23 
 
 		 833 aa  47  0.0008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1428  chitinase  44.44 
 
 		 972 aa  45.8  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>