25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_3136 on replicon NC_007494
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007494  RSP_3136  hypothetical protein  100 
 
 		 787 aa  1561    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3874  hypothetical protein  98.86 
 
 		 787 aa  1547    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4983  hypothetical protein  45.88 
 
 		 549 aa  223  9.999999999999999e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4980  hypothetical protein  51.74 
 
 		 685 aa  168  4e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2806  protein of unknown function DUF1593  34.98 
 
 		 431 aa  129  2.0000000000000002e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.1118  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0761  protein of unknown function DUF1593  29.41 
 
 		 488 aa  103  9e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2156  hypothetical protein  27.7 
 
 		 462 aa  87.4  9e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0754544 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0805  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  28.98 
 
 		 1236 aa  84.3  0.000000000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0565  signal peptide and transmembrane prediction  25.58 
 
 		 478 aa  78.2  0.0000000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000000390373  normal  0.415179 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6073  protein of unknown function DUF1593  26.2 
 
 		 474 aa  76.3  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1066  cellulase  47.13 
 
 		 709 aa  71.2  0.00000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.756742 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2125  protein of unknown function DUF1593  23.66 
 
 		 477 aa  70.5  0.0000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3215  hypothetical protein  23.33 
 
 		 498 aa  69.7  0.0000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.63505 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00711  alpha-rhamnosidase (Eurofung)  24.26 
 
 		 1507 aa  67.4  0.000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.210101  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2122  hypothetical protein  26.49 
 
 		 492 aa  65.9  0.000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.526696  normal  0.730716 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3763  peptidase M10A and M12B matrixin and adamalysin  37.4 
 
 		 387 aa  65.9  0.000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2490  hemolysin-type calcium-binding protein  32.98 
 
 		 833 aa  64.7  0.000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0747804  normal  0.0246403 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1513  glycoside hydrolase family protein  33.94 
 
 		 556 aa  60.8  0.0000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0182  hypothetical protein  24.38 
 
 		 933 aa  60.5  0.0000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.132644  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1566  outer membrane adhesin like proteiin  30.68 
 
 		 1712 aa  55.1  0.000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.6196  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0008  Hemolysin-type calcium-binding region  32.1 
 
 		 2336 aa  55.1  0.000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2041  response regulator receiver domain-containing protein  31.46 
 
 		 213 aa  54.7  0.000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.958403 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0054  hypothetical protein  32.38 
 
 		 2353 aa  53.9  0.00001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0873  hypothetical protein  25.27 
 
 		 493 aa  51.6  0.00005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.390345  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00550  protein of unknown function (DUF1593) with cadherin domain  26.14 
 
 		 480 aa  47.4  0.001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.451215  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>