20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_2122 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007912  Sde_0565  signal peptide and transmembrane prediction  66 
 
 
478 aa  638    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000000390373  normal  0.415179 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2122  hypothetical protein  100 
 
 
492 aa  996    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.526696  normal  0.730716 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3215  hypothetical protein  59.55 
 
 
498 aa  568  1e-161  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.63505 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6073  protein of unknown function DUF1593  56.58 
 
 
474 aa  525  1e-148  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2125  protein of unknown function DUF1593  47.96 
 
 
477 aa  428  1e-119  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2156  hypothetical protein  41.8 
 
 
462 aa  344  2e-93  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0754544 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0761  protein of unknown function DUF1593  42.77 
 
 
488 aa  329  6e-89  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00711  alpha-rhamnosidase (Eurofung)  39.23 
 
 
1507 aa  321  1.9999999999999998e-86  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.210101  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0182  hypothetical protein  33.62 
 
 
933 aa  253  6e-66  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.132644  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0873  hypothetical protein  27.84 
 
 
493 aa  144  5e-33  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.390345  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00550  protein of unknown function (DUF1593) with cadherin domain  28.63 
 
 
480 aa  141  1.9999999999999998e-32  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.451215  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07383  conserved hypothetical protein  26.97 
 
 
505 aa  120  7e-26  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2806  protein of unknown function DUF1593  32.2 
 
 
431 aa  109  1e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.1118  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3136  hypothetical protein  25.75 
 
 
787 aa  62.8  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3874  hypothetical protein  25.75 
 
 
787 aa  62  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1428  chitinase  28.93 
 
 
972 aa  49.7  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2888  glycosyl hydrolase family chitinase  33.33 
 
 
868 aa  45.4  0.002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2984  glycosyl hydrolase family chitinase  33.33 
 
 
868 aa  45.1  0.003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2805  glycosyl hydrolase family chitinase  32.43 
 
 
868 aa  43.9  0.007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3141  protease domain-containing protein  37.35 
 
 
1393 aa  43.5  0.008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>