15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_2156 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_2156  hypothetical protein  100 
 
 		 462 aa  936    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0754544 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2125  protein of unknown function DUF1593  46.03 
 
 		 477 aa  420  1e-116  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0761  protein of unknown function DUF1593  45.66 
 
 		 488 aa  394  1e-108  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6073  protein of unknown function DUF1593  46.14 
 
 		 474 aa  387  1e-106  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0565  signal peptide and transmembrane prediction  41.67 
 
 		 478 aa  366  1e-100  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000000390373  normal  0.415179 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2122  hypothetical protein  41.8 
 
 		 492 aa  344  2e-93  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.526696  normal  0.730716 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3215  hypothetical protein  42.74 
 
 		 498 aa  338  9.999999999999999e-92  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.63505 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0182  hypothetical protein  40.09 
 
 		 933 aa  319  7.999999999999999e-86  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.132644  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00711  alpha-rhamnosidase (Eurofung)  36.67 
 
 		 1507 aa  285  1.0000000000000001e-75  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.210101  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0873  hypothetical protein  28.38 
 
 		 493 aa  173  6.999999999999999e-42  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.390345  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00550  protein of unknown function (DUF1593) with cadherin domain  32.87 
 
 		 480 aa  154  2e-36  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.451215  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07383  conserved hypothetical protein  29.76 
 
 		 505 aa  145  1e-33  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2806  protein of unknown function DUF1593  28.35 
 
 		 431 aa  106  9e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.1118  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3136  hypothetical protein  27.95 
 
 		 787 aa  87.4  5e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3874  hypothetical protein  27.95 
 
 		 787 aa  87  6e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>